Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7F1A0

Protein Details
Accession A7F1A0    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-51YSSASRYSRSRSRSPRRSISPRSRSRSGGHydrophilic
77-98RSLSPRGRSRTRSRSRERSESAHydrophilic
239-287TYRPGERTRERSRSPRRHRTRSRSLSSRSLSRSPLPRRDRVRDRRDSFGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-94RGRSRVSRSRTPYSSASRYSRSRSRSPRRSISPRSRSRSGGRASRSRSVAGTGRNGGGRYRSESRGRSLSPRGRSRTRSRSRER
242-308PGERTRERSRSPRRHRTRSRSLSSRSLSRSPLPRRDRVRDRRDSFGGRGGRGGRDRDGSRDGRRRRS
321-338SRSRSRGRGGGGGGRGRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034201  RNPS1_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0061574  C:ASAP complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ssl:SS1G_11370  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12365  RRM_RNPS1  
Amino Acid Sequences MPSRTPSPAPRGRSRVSRSRTPYSSASRYSRSRSRSPRRSISPRSRSRSGGRASRSRSVAGTGRNGGGRYRSESRGRSLSPRGRSRTRSRSRERSESAVAGVRSTKVVIEKLTKNVTEDHLREIFGSYGEIKDLDVPMNRSFNTNRGTAYILYVSAESAESAIAHMHESQLDGAIINVSIVLPRRKFSPQPPMARRGVNIDPRIPLGSGRSSRGGFDSRGSGGGTGGGRLVDRDRGGDTYRPGERTRERSRSPRRHRTRSRSLSSRSLSRSPLPRRDRVRDRRDSFGGRGGRGGRDRDGSRDGRRRRSPSYSSYSSYDDRSRSRSRGRGGGGGGRGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.72
4 0.74
5 0.73
6 0.74
7 0.72
8 0.67
9 0.67
10 0.65
11 0.65
12 0.63
13 0.61
14 0.59
15 0.61
16 0.63
17 0.63
18 0.62
19 0.65
20 0.68
21 0.74
22 0.77
23 0.81
24 0.83
25 0.85
26 0.88
27 0.89
28 0.89
29 0.89
30 0.88
31 0.87
32 0.82
33 0.78
34 0.74
35 0.72
36 0.68
37 0.66
38 0.63
39 0.64
40 0.65
41 0.66
42 0.62
43 0.55
44 0.48
45 0.44
46 0.42
47 0.37
48 0.36
49 0.32
50 0.31
51 0.32
52 0.31
53 0.28
54 0.27
55 0.25
56 0.26
57 0.29
58 0.33
59 0.38
60 0.4
61 0.44
62 0.46
63 0.47
64 0.47
65 0.51
66 0.54
67 0.56
68 0.62
69 0.64
70 0.65
71 0.7
72 0.74
73 0.75
74 0.78
75 0.79
76 0.8
77 0.84
78 0.83
79 0.85
80 0.79
81 0.74
82 0.67
83 0.58
84 0.5
85 0.44
86 0.36
87 0.27
88 0.24
89 0.18
90 0.15
91 0.14
92 0.13
93 0.1
94 0.12
95 0.13
96 0.19
97 0.21
98 0.26
99 0.29
100 0.28
101 0.28
102 0.28
103 0.29
104 0.29
105 0.28
106 0.28
107 0.25
108 0.25
109 0.24
110 0.23
111 0.19
112 0.13
113 0.13
114 0.09
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.12
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.18
128 0.18
129 0.21
130 0.22
131 0.2
132 0.19
133 0.18
134 0.2
135 0.17
136 0.17
137 0.13
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.02
166 0.03
167 0.06
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.14
172 0.18
173 0.22
174 0.27
175 0.36
176 0.41
177 0.5
178 0.54
179 0.57
180 0.57
181 0.54
182 0.49
183 0.44
184 0.42
185 0.39
186 0.36
187 0.32
188 0.3
189 0.3
190 0.3
191 0.24
192 0.19
193 0.14
194 0.18
195 0.18
196 0.19
197 0.21
198 0.2
199 0.21
200 0.23
201 0.23
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.13
209 0.1
210 0.12
211 0.11
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.14
223 0.17
224 0.19
225 0.2
226 0.23
227 0.26
228 0.28
229 0.28
230 0.33
231 0.37
232 0.43
233 0.51
234 0.54
235 0.57
236 0.65
237 0.75
238 0.79
239 0.83
240 0.85
241 0.86
242 0.88
243 0.93
244 0.92
245 0.92
246 0.91
247 0.9
248 0.87
249 0.83
250 0.81
251 0.74
252 0.72
253 0.66
254 0.6
255 0.55
256 0.52
257 0.56
258 0.56
259 0.62
260 0.61
261 0.65
262 0.69
263 0.75
264 0.8
265 0.81
266 0.82
267 0.83
268 0.81
269 0.8
270 0.78
271 0.73
272 0.65
273 0.63
274 0.57
275 0.46
276 0.47
277 0.41
278 0.41
279 0.4
280 0.4
281 0.36
282 0.38
283 0.39
284 0.39
285 0.44
286 0.45
287 0.5
288 0.57
289 0.62
290 0.65
291 0.73
292 0.75
293 0.75
294 0.78
295 0.75
296 0.74
297 0.74
298 0.69
299 0.64
300 0.61
301 0.58
302 0.52
303 0.5
304 0.47
305 0.44
306 0.43
307 0.47
308 0.5
309 0.53
310 0.6
311 0.63
312 0.63
313 0.66
314 0.65
315 0.64
316 0.61
317 0.6
318 0.57