Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7ELJ6

Protein Details
Accession A7ELJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-101LPISRKVQREQERENNKIRHHydrophilic
702-721AEEKRKEDRAKKLAGKRTKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
703-720EEKRKEDRAKKLAGKRTK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034482  Mrd1_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
KEGG ssl:SS1G_06193  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12568  RRM3_MRD1  
cd12319  RRM4_MRD1  
cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MASSRIFIKGLPPNITEDEFKTHFGANQEITDAKLISHRRIGYIGYKTPEEAVKAVKYFNKSFVRLSKIGVEIARPISDSSLPISRKVQREQERENNKIRHLKQEADAKASESLNTGTKRKRSDIDAADPKLQEFLEVMQPASKSNSNMWKAGAMDDDIEEPPMKLQAIEVPEGESDDEYQSVPSKSKKAPAKPIDPQVPAAPAAPITSAITSDNADPTDEVMVDTPSNNVEATDDDWLRSHTSRLLDIVDPEDIISKTQNLDVKNVEEVTAEKAEPNPPVEDMVVDAESEAMEEQPENPASELDATIETIKASGRLFVRNLPYSATEDDLRKHFEQYGALEEIHLPVDAKGASKGFVLVQYTDPNAAAEAYHNVDGEPFQGRLLHILPAAAKRDNKLDEFAIAKLPLKKQRLLKKKADSSSNTFNWNSLYMNQDAVNSSVAERLGVSKSDLLDPTSADAGVKQAIAETSVIQETKSYFANNGVDLDAFKKRERGDTAILVKNFTYGMTLEELRKTFEEFGQVIRVLMPPTGTIAIVEFAQPTHARAAFASLAYRRMKDTVLFLEKAPKDLFTGPAPSQPVATIDRNAGKAADPKFSTSDLLERESGAENVDTTTLFVRNLNFSTTSQRLTEVFKPLDGFLSARVNTKTDPKKPGQVLSMGFGFIEFRTKSQAQAAIKAMDGYTLDNHKLLVKASHKGADAAEEKRKEDRAKKLAGKRTKLIVKNLPFEASKSDIRKLFGTYGQLRSVRMPKKFDHSTRGFAFADFITAREAENALEALKDTHLLGRRLVIDFASEETVDAEEEIEKMQKKVGSQVDKVALQNLTGGGRKKFNIEGNDADLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.39
4 0.34
5 0.35
6 0.33
7 0.33
8 0.31
9 0.28
10 0.29
11 0.29
12 0.31
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.23
18 0.22
19 0.2
20 0.15
21 0.2
22 0.22
23 0.24
24 0.31
25 0.31
26 0.31
27 0.33
28 0.36
29 0.37
30 0.4
31 0.42
32 0.39
33 0.39
34 0.37
35 0.39
36 0.38
37 0.32
38 0.27
39 0.26
40 0.27
41 0.27
42 0.31
43 0.33
44 0.37
45 0.37
46 0.44
47 0.46
48 0.44
49 0.49
50 0.52
51 0.56
52 0.5
53 0.51
54 0.48
55 0.42
56 0.43
57 0.37
58 0.31
59 0.27
60 0.29
61 0.26
62 0.21
63 0.2
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.18
68 0.23
69 0.23
70 0.26
71 0.32
72 0.37
73 0.42
74 0.48
75 0.55
76 0.58
77 0.65
78 0.72
79 0.76
80 0.78
81 0.78
82 0.81
83 0.76
84 0.74
85 0.75
86 0.68
87 0.68
88 0.64
89 0.61
90 0.58
91 0.62
92 0.58
93 0.53
94 0.5
95 0.42
96 0.41
97 0.36
98 0.3
99 0.22
100 0.21
101 0.22
102 0.26
103 0.3
104 0.33
105 0.39
106 0.44
107 0.47
108 0.5
109 0.49
110 0.55
111 0.56
112 0.6
113 0.63
114 0.61
115 0.61
116 0.56
117 0.51
118 0.43
119 0.35
120 0.25
121 0.17
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.18
128 0.19
129 0.22
130 0.22
131 0.18
132 0.24
133 0.33
134 0.33
135 0.35
136 0.34
137 0.33
138 0.31
139 0.3
140 0.26
141 0.17
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.12
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.08
153 0.08
154 0.12
155 0.14
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.24
173 0.26
174 0.35
175 0.43
176 0.48
177 0.58
178 0.63
179 0.68
180 0.69
181 0.75
182 0.74
183 0.67
184 0.61
185 0.52
186 0.45
187 0.37
188 0.3
189 0.21
190 0.14
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.09
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.13
225 0.14
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.17
231 0.17
232 0.18
233 0.19
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.14
238 0.13
239 0.12
240 0.13
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.13
247 0.16
248 0.15
249 0.18
250 0.19
251 0.2
252 0.21
253 0.2
254 0.17
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.13
262 0.15
263 0.16
264 0.17
265 0.15
266 0.14
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.1
302 0.11
303 0.14
304 0.15
305 0.19
306 0.24
307 0.24
308 0.25
309 0.22
310 0.23
311 0.23
312 0.22
313 0.2
314 0.17
315 0.16
316 0.18
317 0.19
318 0.22
319 0.2
320 0.21
321 0.2
322 0.19
323 0.2
324 0.19
325 0.21
326 0.18
327 0.17
328 0.15
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.1
333 0.07
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.11
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.19
382 0.2
383 0.2
384 0.2
385 0.18
386 0.17
387 0.17
388 0.17
389 0.14
390 0.12
391 0.14
392 0.15
393 0.19
394 0.24
395 0.26
396 0.3
397 0.36
398 0.45
399 0.54
400 0.58
401 0.63
402 0.64
403 0.69
404 0.69
405 0.68
406 0.62
407 0.58
408 0.58
409 0.51
410 0.45
411 0.38
412 0.34
413 0.28
414 0.25
415 0.2
416 0.13
417 0.14
418 0.11
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.11
438 0.11
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.11
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.1
472 0.1
473 0.12
474 0.13
475 0.13
476 0.13
477 0.17
478 0.17
479 0.22
480 0.26
481 0.28
482 0.28
483 0.32
484 0.38
485 0.39
486 0.38
487 0.34
488 0.3
489 0.26
490 0.22
491 0.16
492 0.11
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.1
497 0.1
498 0.13
499 0.13
500 0.14
501 0.14
502 0.15
503 0.14
504 0.13
505 0.16
506 0.14
507 0.15
508 0.17
509 0.16
510 0.15
511 0.14
512 0.14
513 0.11
514 0.1
515 0.09
516 0.06
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.05
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.14
535 0.13
536 0.13
537 0.15
538 0.13
539 0.18
540 0.19
541 0.2
542 0.18
543 0.19
544 0.19
545 0.18
546 0.2
547 0.21
548 0.25
549 0.25
550 0.24
551 0.32
552 0.31
553 0.33
554 0.3
555 0.23
556 0.21
557 0.21
558 0.23
559 0.16
560 0.21
561 0.19
562 0.22
563 0.24
564 0.21
565 0.2
566 0.18
567 0.19
568 0.18
569 0.19
570 0.17
571 0.18
572 0.21
573 0.22
574 0.22
575 0.19
576 0.17
577 0.21
578 0.22
579 0.24
580 0.22
581 0.23
582 0.25
583 0.26
584 0.25
585 0.2
586 0.23
587 0.19
588 0.21
589 0.19
590 0.18
591 0.18
592 0.18
593 0.17
594 0.14
595 0.12
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.08
600 0.07
601 0.08
602 0.08
603 0.09
604 0.1
605 0.11
606 0.13
607 0.14
608 0.16
609 0.16
610 0.17
611 0.23
612 0.24
613 0.25
614 0.22
615 0.23
616 0.23
617 0.25
618 0.29
619 0.29
620 0.27
621 0.26
622 0.27
623 0.26
624 0.26
625 0.22
626 0.18
627 0.13
628 0.18
629 0.18
630 0.21
631 0.21
632 0.22
633 0.22
634 0.32
635 0.37
636 0.39
637 0.46
638 0.46
639 0.54
640 0.56
641 0.6
642 0.53
643 0.5
644 0.44
645 0.39
646 0.35
647 0.26
648 0.22
649 0.17
650 0.15
651 0.1
652 0.14
653 0.12
654 0.12
655 0.19
656 0.19
657 0.21
658 0.24
659 0.31
660 0.27
661 0.32
662 0.34
663 0.29
664 0.28
665 0.27
666 0.23
667 0.17
668 0.16
669 0.12
670 0.12
671 0.15
672 0.15
673 0.15
674 0.16
675 0.17
676 0.17
677 0.17
678 0.21
679 0.21
680 0.25
681 0.28
682 0.32
683 0.3
684 0.31
685 0.3
686 0.29
687 0.29
688 0.3
689 0.35
690 0.33
691 0.35
692 0.38
693 0.44
694 0.46
695 0.5
696 0.55
697 0.55
698 0.62
699 0.7
700 0.75
701 0.79
702 0.8
703 0.78
704 0.73
705 0.74
706 0.73
707 0.7
708 0.69
709 0.69
710 0.66
711 0.65
712 0.62
713 0.56
714 0.48
715 0.43
716 0.39
717 0.35
718 0.34
719 0.32
720 0.36
721 0.36
722 0.38
723 0.38
724 0.37
725 0.36
726 0.33
727 0.37
728 0.37
729 0.38
730 0.42
731 0.41
732 0.39
733 0.42
734 0.48
735 0.47
736 0.48
737 0.49
738 0.47
739 0.54
740 0.63
741 0.62
742 0.63
743 0.61
744 0.63
745 0.6
746 0.61
747 0.53
748 0.43
749 0.4
750 0.29
751 0.29
752 0.21
753 0.19
754 0.15
755 0.15
756 0.15
757 0.14
758 0.15
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.09
763 0.09
764 0.09
765 0.09
766 0.09
767 0.1
768 0.09
769 0.14
770 0.2
771 0.22
772 0.22
773 0.25
774 0.28
775 0.29
776 0.29
777 0.24
778 0.19
779 0.19
780 0.2
781 0.18
782 0.15
783 0.13
784 0.13
785 0.13
786 0.12
787 0.11
788 0.09
789 0.07
790 0.08
791 0.09
792 0.13
793 0.15
794 0.15
795 0.2
796 0.21
797 0.22
798 0.3
799 0.38
800 0.41
801 0.42
802 0.48
803 0.5
804 0.51
805 0.51
806 0.47
807 0.38
808 0.3
809 0.29
810 0.24
811 0.21
812 0.22
813 0.26
814 0.25
815 0.3
816 0.31
817 0.34
818 0.38
819 0.42
820 0.44
821 0.46
822 0.46