Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074VSM3

Protein Details
Accession A0A074VSM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-427TMKSGKRGAYYRKRRRWARCKAIVDETRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-415RKRRR
556-566RGKYNKKRKIG
Subcellular Location(s) nucl 12.5cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSRVHAGEYVLLRLPSDTLKLVQIVPNSVISIGKFGSFPCNLLIGRPYYLTYEITDKQSETDASRLRVVPASELNAEVLSEDAPPSENPTEKADESFDIVADDGSVLLKNNRLTVDDASRQALSMDEIEELKKAGTGSGRDIIEKILKSHTHLSEKTSFALAKYTLRKHKKYLRRFTVLPMNVSMLTEYMIAEKESSRVMELREESLGLVGSWANVHYHPDAEPTLTEEGTQLGGGRWLVVDDTGGLVVASMAEKMGLLYLPDREDEESDDDEATTEAGAQQTAAAEEDADVEMQDPSKDEPTTEEPREGEEVRANGRKRPINKHNTNLSSTNTITVLHANAQPNVSLLKYFSYDTNNPTAAHPLHTHLKTLTWLQLIDPTADPTYDEPEIIPQSELDTMKSGKRGAYYRKRRRWARCKAIVDETRAGGFDGLIIASHMSPATILKNTVHLLRGSAHIAIYSPTVEPLTEIMDLYSKDRKAAFLDHIANDTTPPEEDFPLDPRLVLGPTLQTTRIRPWQVLPGRTHPLMTWRGGAEGYLFTARKVLPVDGKVEARGKYNKKRKIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.16
4 0.18
5 0.17
6 0.15
7 0.18
8 0.19
9 0.21
10 0.23
11 0.24
12 0.24
13 0.24
14 0.23
15 0.21
16 0.2
17 0.19
18 0.15
19 0.16
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.19
25 0.18
26 0.19
27 0.18
28 0.21
29 0.2
30 0.22
31 0.25
32 0.21
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.2
37 0.22
38 0.22
39 0.2
40 0.23
41 0.25
42 0.28
43 0.28
44 0.26
45 0.25
46 0.27
47 0.27
48 0.23
49 0.27
50 0.28
51 0.29
52 0.33
53 0.33
54 0.32
55 0.34
56 0.32
57 0.28
58 0.26
59 0.28
60 0.24
61 0.23
62 0.22
63 0.18
64 0.17
65 0.13
66 0.11
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.08
73 0.14
74 0.17
75 0.18
76 0.2
77 0.24
78 0.28
79 0.28
80 0.29
81 0.26
82 0.23
83 0.25
84 0.23
85 0.18
86 0.14
87 0.13
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.11
97 0.12
98 0.15
99 0.15
100 0.17
101 0.19
102 0.22
103 0.28
104 0.29
105 0.3
106 0.29
107 0.28
108 0.26
109 0.24
110 0.2
111 0.14
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.12
124 0.13
125 0.16
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.22
130 0.22
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.24
137 0.31
138 0.34
139 0.37
140 0.37
141 0.41
142 0.41
143 0.42
144 0.39
145 0.35
146 0.3
147 0.23
148 0.25
149 0.2
150 0.21
151 0.27
152 0.33
153 0.4
154 0.49
155 0.52
156 0.58
157 0.67
158 0.71
159 0.75
160 0.79
161 0.78
162 0.76
163 0.73
164 0.71
165 0.71
166 0.63
167 0.54
168 0.44
169 0.36
170 0.3
171 0.28
172 0.22
173 0.12
174 0.1
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.11
290 0.17
291 0.24
292 0.24
293 0.25
294 0.23
295 0.24
296 0.27
297 0.24
298 0.19
299 0.15
300 0.16
301 0.18
302 0.24
303 0.23
304 0.23
305 0.29
306 0.32
307 0.36
308 0.45
309 0.51
310 0.56
311 0.62
312 0.66
313 0.69
314 0.68
315 0.66
316 0.58
317 0.5
318 0.43
319 0.36
320 0.3
321 0.21
322 0.18
323 0.15
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.11
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.1
341 0.16
342 0.17
343 0.2
344 0.24
345 0.24
346 0.23
347 0.23
348 0.26
349 0.21
350 0.21
351 0.2
352 0.19
353 0.26
354 0.25
355 0.26
356 0.22
357 0.22
358 0.21
359 0.22
360 0.22
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.11
373 0.14
374 0.12
375 0.12
376 0.1
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.13
381 0.1
382 0.11
383 0.14
384 0.15
385 0.12
386 0.14
387 0.15
388 0.16
389 0.19
390 0.19
391 0.17
392 0.21
393 0.26
394 0.34
395 0.44
396 0.53
397 0.62
398 0.71
399 0.8
400 0.85
401 0.9
402 0.9
403 0.9
404 0.9
405 0.89
406 0.85
407 0.8
408 0.81
409 0.74
410 0.69
411 0.61
412 0.51
413 0.41
414 0.35
415 0.3
416 0.2
417 0.15
418 0.09
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.05
429 0.06
430 0.09
431 0.09
432 0.11
433 0.11
434 0.15
435 0.17
436 0.19
437 0.19
438 0.17
439 0.17
440 0.18
441 0.19
442 0.17
443 0.17
444 0.14
445 0.12
446 0.13
447 0.12
448 0.11
449 0.1
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.11
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.11
461 0.12
462 0.15
463 0.21
464 0.19
465 0.21
466 0.22
467 0.23
468 0.24
469 0.28
470 0.29
471 0.31
472 0.36
473 0.34
474 0.36
475 0.35
476 0.32
477 0.27
478 0.23
479 0.16
480 0.12
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.15
485 0.17
486 0.19
487 0.22
488 0.21
489 0.19
490 0.18
491 0.19
492 0.17
493 0.16
494 0.14
495 0.13
496 0.16
497 0.19
498 0.2
499 0.22
500 0.24
501 0.31
502 0.39
503 0.38
504 0.38
505 0.39
506 0.47
507 0.52
508 0.55
509 0.54
510 0.52
511 0.56
512 0.54
513 0.52
514 0.42
515 0.42
516 0.4
517 0.36
518 0.33
519 0.27
520 0.27
521 0.26
522 0.25
523 0.2
524 0.16
525 0.16
526 0.18
527 0.17
528 0.16
529 0.2
530 0.2
531 0.21
532 0.23
533 0.25
534 0.26
535 0.29
536 0.33
537 0.34
538 0.35
539 0.36
540 0.39
541 0.36
542 0.37
543 0.44
544 0.5
545 0.56
546 0.65