Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074VTV2

Protein Details
Accession A0A074VTV2    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-113AEKTPVKKTAKKTKTEKKADTSHydrophilic
196-233SESEPKKTKKTTKPAKAEKAAKKEKKDRKPVEKTEPSSBasic
348-370VTKGKAFTKAKNKGKRGSYRGGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-225PKKTKKTTKPAKAEKAAKKEKKDRKP
355-363TKAKNKGKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSSAAPSPELLALVNDFLASNGFDKAAKALTKQAKDQNIALTNDGKTTLTALFDARPKETAVATADDSSDASDSSDSESSDSDSDSDSESEAEKTPVKKTAKKTKTEKKADTSDSSSASSSSESDDSSDSSDSSDSDSSDSDSDSDSDSSSSSSSSSSSSSSSSSDSDSDSSSDSDSDSSSSSSSESESSDSDSESESEPKKTKKTTKPAKAEKAAKKEKKDRKPVEKTEPSSDSAASSVTLADAPAPIDTIMVPASSALGQAEGAAAATNDADQHMHPSRKRKLGGAFSEAEQQVAVPATEENLKRAKKENVPFSRIPKDQYVDPRLASNAFVPYDYAQRAHEALIVTKGKAFTKAKNKGKRGSYRGGIIDQTPKGIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.12
13 0.16
14 0.17
15 0.18
16 0.26
17 0.34
18 0.38
19 0.45
20 0.51
21 0.53
22 0.54
23 0.55
24 0.54
25 0.52
26 0.5
27 0.45
28 0.41
29 0.34
30 0.32
31 0.3
32 0.22
33 0.16
34 0.16
35 0.15
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.15
40 0.19
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.21
45 0.22
46 0.21
47 0.2
48 0.18
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.18
53 0.16
54 0.16
55 0.13
56 0.11
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.2
83 0.27
84 0.32
85 0.38
86 0.46
87 0.55
88 0.6
89 0.67
90 0.75
91 0.78
92 0.83
93 0.86
94 0.83
95 0.8
96 0.79
97 0.75
98 0.7
99 0.64
100 0.56
101 0.48
102 0.42
103 0.35
104 0.27
105 0.22
106 0.17
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.12
184 0.12
185 0.15
186 0.19
187 0.21
188 0.25
189 0.31
190 0.4
191 0.46
192 0.56
193 0.63
194 0.69
195 0.77
196 0.82
197 0.84
198 0.82
199 0.83
200 0.79
201 0.79
202 0.79
203 0.75
204 0.74
205 0.76
206 0.78
207 0.78
208 0.82
209 0.81
210 0.81
211 0.86
212 0.85
213 0.86
214 0.84
215 0.79
216 0.74
217 0.67
218 0.58
219 0.49
220 0.41
221 0.31
222 0.22
223 0.18
224 0.11
225 0.09
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.11
263 0.17
264 0.23
265 0.27
266 0.37
267 0.44
268 0.51
269 0.53
270 0.53
271 0.55
272 0.58
273 0.6
274 0.56
275 0.5
276 0.43
277 0.48
278 0.42
279 0.34
280 0.25
281 0.19
282 0.15
283 0.13
284 0.12
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.13
289 0.13
290 0.16
291 0.23
292 0.24
293 0.26
294 0.33
295 0.4
296 0.44
297 0.52
298 0.6
299 0.61
300 0.67
301 0.69
302 0.7
303 0.71
304 0.64
305 0.59
306 0.55
307 0.49
308 0.48
309 0.53
310 0.52
311 0.46
312 0.45
313 0.43
314 0.38
315 0.35
316 0.3
317 0.23
318 0.21
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.17
323 0.21
324 0.22
325 0.21
326 0.18
327 0.2
328 0.21
329 0.19
330 0.21
331 0.17
332 0.17
333 0.23
334 0.24
335 0.22
336 0.24
337 0.26
338 0.24
339 0.32
340 0.34
341 0.35
342 0.44
343 0.55
344 0.62
345 0.7
346 0.77
347 0.78
348 0.84
349 0.86
350 0.83
351 0.82
352 0.77
353 0.73
354 0.69
355 0.64
356 0.56
357 0.5
358 0.49
359 0.41
360 0.4
361 0.36
362 0.32