FuNGI

A0A074VYL9

Protein Details

Accession

A0A074VYL9

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-56	QGALRRRKPTGPFAPKPSRNQAKRPPAPPPQKLT	Hydrophilic
396-426	QLEKQREREEKKKAKKLRKKLVKIEKNYEYD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
27-51	RRRKPTGPFAPKPSRNQAKRPPAPP
176-184	AKKRQPFKK
292-295	EKKR
401-418	REREEKKKAKKLRKKLVK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGVSPASRQPSTTPNNGQGALRRRKPTGPFAPKPSRNQAKRPPAPPPQKLTGTTKPLAASTVQAQPEPEDDPSTYNEIPLMATKKALLEGLRFHAIKFISNNVVNPYDKEQFERPVKLHRRFPQDTPNTPVDANPEDDKEREKEAIRKAEKAAEREATQAQIAPTDKAAAAKKRQPFKKKTEDVYYPTDTPEAQKRARLRYEEGRPWHLEDFENKNIWIGTYEEPLSESNVMFVFDNGRFRMVPIEKWYRFNPTGRVPLLSQAEADAVMEKREKGPRWFLENEAGREKKRAELARQQRLTKGRVGTRDENRRVKDEDDDGDMENVDIADDVDELDFEAEDEFQDDDEGKLFGDDEEEAKEAATKLKKERHEANIFAGTGVKDEKDWYEEEQLEKQREREEKKKAKKLRKKLVKIEKNYEYDDDESDNPFSEEEESDDSDIERQREEDERKKEEELKANGDKQPSQSSTNANTPSGRAEKHASGLLPKQSMSSLKRPGSPNLSETSGSESINRKRIKKDNLGATSPMGRHAGSGSDTETERRRTVTLNPRSTPGSPGNATPLGSRAGSPVPMPTADEIRAAIPPAGISIPELIKRFREQVPKTKEGNKAFIQLVLSVAKAMPGAPGLVGLR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.46
3	0.5
4	0.53
5	0.5
6	0.49
7	0.53
8	0.53
9	0.52
10	0.5
11	0.55
12	0.56
13	0.58
14	0.56
15	0.56
16	0.62
17	0.66
18	0.69
19	0.69
20	0.7
21	0.7
22	0.75
23	0.81
24	0.81
25	0.83
26	0.83
27	0.83
28	0.79
29	0.81
30	0.82
31	0.82
32	0.84
33	0.82
34	0.8
35	0.8
36	0.83
37	0.81
38	0.78
39	0.74
40	0.71
41	0.7
42	0.69
43	0.67
44	0.64
45	0.58
46	0.53
47	0.47
48	0.41
49	0.38
50	0.3
51	0.24
52	0.2
53	0.26
54	0.24
55	0.23
56	0.23
57	0.23
58	0.24
59	0.24
60	0.21
61	0.17
62	0.17
63	0.18
64	0.2
65	0.25
66	0.23
67	0.21
68	0.19
69	0.17
70	0.17
71	0.2
72	0.21
73	0.15
74	0.16
75	0.17
76	0.17
77	0.18
78	0.19
79	0.16
80	0.15
81	0.19
82	0.23
83	0.28
84	0.27
85	0.26
86	0.28
87	0.27
88	0.28
89	0.26
90	0.25
91	0.26
92	0.27
93	0.29
94	0.28
95	0.32
96	0.29
97	0.29
98	0.31
99	0.3
100	0.3
101	0.32
102	0.32
103	0.37
104	0.42
105	0.45
106	0.41
107	0.46
108	0.55
109	0.59
110	0.64
111	0.64
112	0.68
113	0.67
114	0.71
115	0.71
116	0.7
117	0.67
118	0.64
119	0.59
120	0.51
121	0.47
122	0.42
123	0.36
124	0.29
125	0.28
126	0.23
127	0.23
128	0.23
129	0.24
130	0.27
131	0.24
132	0.25
133	0.26
134	0.27
135	0.31
136	0.38
137	0.47
138	0.46
139	0.48
140	0.47
141	0.51
142	0.51
143	0.48
144	0.45
145	0.38
146	0.36
147	0.36
148	0.35
149	0.28
150	0.24
151	0.22
152	0.17
153	0.17
154	0.17
155	0.15
156	0.14
157	0.14
158	0.14
159	0.16
160	0.21
161	0.24
162	0.3
163	0.36
164	0.42
165	0.51
166	0.59
167	0.65
168	0.69
169	0.72
170	0.77
171	0.78
172	0.78
173	0.77
174	0.75
175	0.7
176	0.68
177	0.62
178	0.52
179	0.44
180	0.38
181	0.3
182	0.26
183	0.3
184	0.29
185	0.26
186	0.3
187	0.35
188	0.42
189	0.47
190	0.48
191	0.46
192	0.49
193	0.56
194	0.59
195	0.58
196	0.55
197	0.52
198	0.51
199	0.47
200	0.39
201	0.32
202	0.3
203	0.32
204	0.31
205	0.3
206	0.27
207	0.26
208	0.25
209	0.23
210	0.18
211	0.14
212	0.11
213	0.13
214	0.13
215	0.12
216	0.13
217	0.14
218	0.14
219	0.12
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.1
227	0.1
228	0.13
229	0.12
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.2
234	0.18
235	0.2
236	0.24
237	0.33
238	0.34
239	0.37
240	0.38
241	0.39
242	0.4
243	0.4
244	0.38
245	0.34
246	0.39
247	0.36
248	0.37
249	0.3
250	0.32
251	0.31
252	0.26
253	0.21
254	0.14
255	0.14
256	0.12
257	0.11
258	0.08
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.12
264	0.17
265	0.2
266	0.22
267	0.3
268	0.32
269	0.38
270	0.39
271	0.37
272	0.4
273	0.41
274	0.4
275	0.39
276	0.37
277	0.32
278	0.32
279	0.31
280	0.26
281	0.29
282	0.3
283	0.29
284	0.37
285	0.46
286	0.53
287	0.57
288	0.55
289	0.54
290	0.54
291	0.51
292	0.45
293	0.41
294	0.35
295	0.36
296	0.41
297	0.43
298	0.46
299	0.54
300	0.57
301	0.59
302	0.57
303	0.55
304	0.51
305	0.45
306	0.4
307	0.32
308	0.26
309	0.22
310	0.22
311	0.19
312	0.17
313	0.15
314	0.12
315	0.09
316	0.07
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.07
353	0.12
354	0.14
355	0.16
356	0.22
357	0.29
358	0.33
359	0.38
360	0.45
361	0.49
362	0.52
363	0.5
364	0.48
365	0.45
366	0.41
367	0.35
368	0.29
369	0.2
370	0.15
371	0.14
372	0.1
373	0.07
374	0.08
375	0.08
376	0.09
377	0.1
378	0.12
379	0.16
380	0.17
381	0.19
382	0.25
383	0.29
384	0.31
385	0.31
386	0.3
387	0.32
388	0.38
389	0.43
390	0.45
391	0.51
392	0.58
393	0.67
394	0.75
395	0.79
396	0.83
397	0.86
398	0.89
399	0.89
400	0.9
401	0.89
402	0.89
403	0.91
404	0.89
405	0.86
406	0.84
407	0.8
408	0.73
409	0.66
410	0.57
411	0.48
412	0.4
413	0.34
414	0.28
415	0.21
416	0.19
417	0.17
418	0.16
419	0.13
420	0.12
421	0.11
422	0.1
423	0.09
424	0.1
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.13
429	0.12
430	0.14
431	0.17
432	0.15
433	0.13
434	0.13
435	0.15
436	0.22
437	0.29
438	0.35
439	0.4
440	0.44
441	0.46
442	0.49
443	0.53
444	0.52
445	0.54
446	0.5
447	0.5
448	0.51
449	0.53
450	0.53
451	0.49
452	0.45
453	0.39
454	0.42
455	0.37
456	0.35
457	0.33
458	0.35
459	0.36
460	0.41
461	0.4
462	0.34
463	0.32
464	0.29
465	0.32
466	0.3
467	0.27
468	0.23
469	0.26
470	0.25
471	0.27
472	0.29
473	0.24
474	0.24
475	0.28
476	0.3
477	0.26
478	0.25
479	0.23
480	0.23
481	0.29
482	0.3
483	0.33
484	0.37
485	0.39
486	0.46
487	0.48
488	0.52
489	0.53
490	0.5
491	0.45
492	0.4
493	0.39
494	0.33
495	0.31
496	0.32
497	0.27
498	0.24
499	0.26
500	0.3
501	0.33
502	0.41
503	0.46
504	0.43
505	0.5
506	0.59
507	0.65
508	0.68
509	0.7
510	0.72
511	0.73
512	0.72
513	0.65
514	0.58
515	0.54
516	0.43
517	0.37
518	0.28
519	0.22
520	0.19
521	0.18
522	0.18
523	0.14
524	0.15
525	0.14
526	0.15
527	0.16
528	0.19
529	0.24
530	0.26
531	0.26
532	0.27
533	0.27
534	0.27
535	0.36
536	0.43
537	0.48
538	0.53
539	0.53
540	0.54
541	0.57
542	0.55
543	0.51
544	0.45
545	0.42
546	0.34
547	0.34
548	0.36
549	0.34
550	0.33
551	0.28
552	0.25
553	0.21
554	0.2
555	0.19
556	0.16
557	0.16
558	0.17
559	0.16
560	0.17
561	0.17
562	0.17
563	0.18
564	0.18
565	0.2
566	0.19
567	0.2
568	0.18
569	0.17
570	0.18
571	0.17
572	0.15
573	0.12
574	0.11
575	0.11
576	0.11
577	0.1
578	0.1
579	0.12
580	0.14
581	0.18
582	0.21
583	0.21
584	0.25
585	0.29
586	0.33
587	0.37
588	0.45
589	0.48
590	0.56
591	0.64
592	0.68
593	0.7
594	0.73
595	0.74
596	0.7
597	0.71
598	0.64
599	0.6
600	0.53
601	0.5
602	0.43
603	0.34
604	0.31
605	0.24
606	0.2
607	0.15
608	0.14
609	0.12
610	0.11
611	0.1
612	0.09
613	0.08
614	0.09
615	0.07

A0A074VYL9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer