Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074VJT4

Protein Details
Accession A0A074VJT4    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44PEPPSKKAMREAKKAAKRAKENPEGVHydrophilic
299-334DAAADKKEKNTKKTKKPKKQNKRKWFINRLHGRPLRBasic
372-410AAQERPQKRSRPKGDADARQEARRKKFDARKIRPGNALAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-38SKKAMREAKKAAKRAK
304-324KKEKNTKKTKKPKKQNKRKWF
376-406RPQKRSRPKGDADARQEARRKKFDARKIRPG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences KKRKRVLPEDEIEVDVNAPEPPSKKAMREAKKAAKRAKENPEGVAAATATTAAEGEKKRSDYGIWIGNLAFAVDKDMLRVFLTRQAQIPEAEITRVNMPVPQGPPQPGRTKPSNKGFAYVDFASEESLNKAIAMSETLVSGRKVLIKNAKSFEGRPAQATATVNALAGNADSSEAAAAAGGAAPNKIGPNGKPVMPPSKRVFVGNLNFDVTREDLETHFAQAGELEDVFMATFQDSGKCKGYAWIRFAELEAAESAVRGFIWKFDEASDDEEEEEEEEEEPEDKKADNSGSDSDSEAEDAAADKKEKNTKKTKKPKKQNKRKWFINRLHGRPLRCEFAEDASTRYKKRFGKERPATESHPSDAAPIAEVDGAAQERPQKRSRPKGDADARQEARRKKFDARKIRPGNALANAPRASAAIVEGAGKKISFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.23
3 0.18
4 0.12
5 0.1
6 0.12
7 0.13
8 0.16
9 0.23
10 0.26
11 0.29
12 0.38
13 0.48
14 0.54
15 0.62
16 0.69
17 0.73
18 0.78
19 0.84
20 0.83
21 0.82
22 0.82
23 0.82
24 0.82
25 0.81
26 0.75
27 0.68
28 0.65
29 0.55
30 0.47
31 0.38
32 0.28
33 0.18
34 0.15
35 0.12
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.11
41 0.12
42 0.17
43 0.22
44 0.24
45 0.26
46 0.27
47 0.28
48 0.27
49 0.31
50 0.33
51 0.28
52 0.28
53 0.26
54 0.26
55 0.24
56 0.19
57 0.14
58 0.07
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.12
68 0.18
69 0.21
70 0.21
71 0.24
72 0.25
73 0.26
74 0.26
75 0.27
76 0.22
77 0.2
78 0.2
79 0.17
80 0.17
81 0.16
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.17
87 0.19
88 0.22
89 0.24
90 0.28
91 0.32
92 0.36
93 0.42
94 0.41
95 0.45
96 0.49
97 0.54
98 0.59
99 0.64
100 0.68
101 0.62
102 0.61
103 0.57
104 0.49
105 0.47
106 0.38
107 0.3
108 0.21
109 0.2
110 0.17
111 0.16
112 0.14
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.14
130 0.14
131 0.2
132 0.28
133 0.31
134 0.37
135 0.39
136 0.42
137 0.38
138 0.39
139 0.4
140 0.38
141 0.35
142 0.31
143 0.3
144 0.26
145 0.28
146 0.28
147 0.21
148 0.16
149 0.15
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.02
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.13
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.2
181 0.29
182 0.29
183 0.35
184 0.32
185 0.36
186 0.35
187 0.34
188 0.34
189 0.31
190 0.33
191 0.3
192 0.28
193 0.24
194 0.23
195 0.22
196 0.21
197 0.14
198 0.11
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.09
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.07
222 0.09
223 0.12
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.19
228 0.25
229 0.26
230 0.28
231 0.27
232 0.26
233 0.26
234 0.26
235 0.22
236 0.16
237 0.12
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.13
253 0.13
254 0.16
255 0.15
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.14
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.17
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.1
284 0.08
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.16
292 0.26
293 0.32
294 0.39
295 0.49
296 0.58
297 0.68
298 0.78
299 0.84
300 0.86
301 0.92
302 0.95
303 0.95
304 0.96
305 0.97
306 0.97
307 0.96
308 0.95
309 0.95
310 0.94
311 0.91
312 0.91
313 0.89
314 0.83
315 0.83
316 0.77
317 0.69
318 0.65
319 0.61
320 0.55
321 0.46
322 0.43
323 0.34
324 0.33
325 0.36
326 0.29
327 0.28
328 0.31
329 0.35
330 0.34
331 0.35
332 0.39
333 0.39
334 0.48
335 0.55
336 0.57
337 0.64
338 0.73
339 0.79
340 0.8
341 0.8
342 0.76
343 0.72
344 0.66
345 0.57
346 0.48
347 0.39
348 0.32
349 0.28
350 0.23
351 0.16
352 0.13
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.16
362 0.21
363 0.27
364 0.34
365 0.42
366 0.52
367 0.63
368 0.71
369 0.73
370 0.75
371 0.79
372 0.83
373 0.83
374 0.8
375 0.8
376 0.74
377 0.72
378 0.73
379 0.71
380 0.7
381 0.68
382 0.65
383 0.65
384 0.71
385 0.74
386 0.78
387 0.79
388 0.81
389 0.83
390 0.85
391 0.81
392 0.76
393 0.72
394 0.66
395 0.64
396 0.55
397 0.53
398 0.47
399 0.4
400 0.36
401 0.29
402 0.25
403 0.17
404 0.15
405 0.09
406 0.09
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.15