FuNGI

A7F448

Protein Details

Accession

A7F448

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
228-248	IEYFKKFWGRQSTKRRNCDSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, pero 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
KEGG	ssl:SS1G_12370 -
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MTTGDNSTKIILSSPEDWNSWIRNVQRIAESGGIKCWMQLENYRIKNTKYEKINKAISEVLKLASTDRARELTVVARYNCVKQPYKSNQDIYEWLNEWELIYTEAKTLNLPDVDRNRAAFDFSTALMNHSSSWATSTLLEITKKLKNQPEETIDVYDLIEDFRNYTRLTQASTTSTSSTSFATYKDGNKDKKEGERTCLCGKKHLYEKCYYLYSDNRPRNWKPIDADIEYFKKFWGRQSTKRRNCDSDTHVTNSLHNFVLEEFGKPSDMISAGRDRFQIEAFGTITMLINTPTGPGQITLKRVAYIPGFLTNLVSLALLSKKGVHWNTEHPDVLTKEGIAFITLKQTGDHWTLDPIILSQHASFATKNHTKSICRKVTTTELHDLLGHPSLEALQHLESATTDIIIDKTISTPSFSTCKVCNLSKAQQIISRNPRKEMPENGHVGDRLAWDLFEMDEAYNNTRYISHFWCTTHKIQWVYVLTRKTEMIDIMDTQFSLIQTQFGSKVRFIRLDGETTLGGDFKRITDKRGIIVERTPPDTPAQNGAAENAGKMLMVRARALLLSANLPQNLWPEAIKTAGYLENRTPKRALQWKTPFESATGNKPSLAHLHPYGCLAYVLNKQIPRRAKMQPRAKLGYLVGYDSTNIFRIWLPSINRVIRSRDVKFDETRYYRPEDIDIGFLIKDQLRDTAAIHEKRAEEIEISNLLSEESDESIGDIIVVEGPWNLQHNRLNERPTNESSSNKTDDGIPTNEGVPQTNPQLPTPRATLSPEALTRQSTGDVPIPSLPESELSSSPSSSLSQHDIITTTSSHNTAPLAEQIRADIDVSHIIQGSRRSQRKEHHAAALSSLPQLSSYFAAFAIGRSKLRTPRLHQNDLPPPPRFYHELVQHPYAREFQKACEDEINALKERKTFEYIDISTRGQKPLPLLWVFTYKFDQDGYLIKFKARICARGDLQSTEEETYAATLTSQIFRAMMAIAAAFDLEIRQFDVSNAFLHATLRQPIICKCPDGFEVPGKVISVNQALYGFRESPAYWYEDLTYTLTDFGLDPVPGAPCVFTNSWLTVLFYVDDIIAICKKADLLRLTLFENTLKSAYTIKSLGDIQFFLGIRVLRDRQNHRVWLCQDNYISKISNGFNIKPNPQACSLLPTIILTKNPAIVTPQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.29
3	0.29
4	0.31
5	0.33
6	0.34
7	0.32
8	0.34
9	0.31
10	0.36
11	0.38
12	0.4
13	0.4
14	0.38
15	0.39
16	0.39
17	0.38
18	0.32
19	0.31
20	0.29
21	0.25
22	0.24
23	0.23
24	0.18
25	0.19
26	0.25
27	0.29
28	0.37
29	0.43
30	0.49
31	0.51
32	0.51
33	0.57
34	0.57
35	0.59
36	0.59
37	0.64
38	0.65
39	0.7
40	0.75
41	0.67
42	0.64
43	0.62
44	0.53
45	0.48
46	0.41
47	0.34
48	0.27
49	0.27
50	0.24
51	0.25
52	0.25
53	0.23
54	0.26
55	0.26
56	0.26
57	0.26
58	0.27
59	0.25
60	0.29
61	0.33
62	0.3
63	0.34
64	0.35
65	0.4
66	0.43
67	0.44
68	0.44
69	0.41
70	0.51
71	0.56
72	0.63
73	0.66
74	0.67
75	0.63
76	0.61
77	0.62
78	0.54
79	0.5
80	0.42
81	0.36
82	0.31
83	0.27
84	0.23
85	0.19
86	0.17
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.12
91	0.14
92	0.14
93	0.14
94	0.15
95	0.17
96	0.18
97	0.19
98	0.26
99	0.3
100	0.36
101	0.37
102	0.37
103	0.36
104	0.34
105	0.35
106	0.27
107	0.24
108	0.2
109	0.18
110	0.21
111	0.17
112	0.19
113	0.17
114	0.17
115	0.15
116	0.14
117	0.14
118	0.11
119	0.13
120	0.12
121	0.12
122	0.11
123	0.13
124	0.14
125	0.18
126	0.19
127	0.18
128	0.23
129	0.27
130	0.31
131	0.37
132	0.42
133	0.46
134	0.5
135	0.56
136	0.57
137	0.56
138	0.55
139	0.5
140	0.43
141	0.35
142	0.3
143	0.22
144	0.16
145	0.13
146	0.12
147	0.09
148	0.1
149	0.12
150	0.14
151	0.15
152	0.16
153	0.2
154	0.2
155	0.24
156	0.24
157	0.25
158	0.27
159	0.29
160	0.3
161	0.26
162	0.25
163	0.23
164	0.21
165	0.19
166	0.18
167	0.16
168	0.15
169	0.18
170	0.21
171	0.25
172	0.33
173	0.41
174	0.45
175	0.48
176	0.54
177	0.55
178	0.61
179	0.66
180	0.6
181	0.6
182	0.59
183	0.61
184	0.63
185	0.64
186	0.56
187	0.54
188	0.54
189	0.55
190	0.58
191	0.59
192	0.55
193	0.54
194	0.57
195	0.53
196	0.51
197	0.44
198	0.4
199	0.4
200	0.45
201	0.5
202	0.53
203	0.56
204	0.61
205	0.63
206	0.67
207	0.64
208	0.61
209	0.54
210	0.56
211	0.56
212	0.51
213	0.5
214	0.47
215	0.46
216	0.41
217	0.37
218	0.29
219	0.27
220	0.25
221	0.3
222	0.36
223	0.4
224	0.49
225	0.6
226	0.71
227	0.76
228	0.84
229	0.84
230	0.8
231	0.76
232	0.74
233	0.7
234	0.68
235	0.63
236	0.58
237	0.56
238	0.5
239	0.47
240	0.41
241	0.37
242	0.28
243	0.22
244	0.19
245	0.14
246	0.17
247	0.15
248	0.14
249	0.13
250	0.13
251	0.13
252	0.13
253	0.13
254	0.1
255	0.11
256	0.1
257	0.12
258	0.19
259	0.2
260	0.22
261	0.22
262	0.22
263	0.22
264	0.22
265	0.21
266	0.14
267	0.15
268	0.14
269	0.13
270	0.12
271	0.11
272	0.11
273	0.09
274	0.09
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.12
284	0.15
285	0.18
286	0.21
287	0.21
288	0.22
289	0.22
290	0.24
291	0.2
292	0.18
293	0.17
294	0.16
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.13
299	0.12
300	0.1
301	0.08
302	0.05
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.1
309	0.17
310	0.19
311	0.2
312	0.22
313	0.3
314	0.35
315	0.38
316	0.37
317	0.3
318	0.34
319	0.32
320	0.31
321	0.23
322	0.18
323	0.14
324	0.14
325	0.14
326	0.1
327	0.09
328	0.07
329	0.12
330	0.13
331	0.13
332	0.12
333	0.13
334	0.16
335	0.18
336	0.19
337	0.14
338	0.15
339	0.15
340	0.15
341	0.14
342	0.11
343	0.09
344	0.08
345	0.09
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.1
350	0.1
351	0.11
352	0.18
353	0.23
354	0.24
355	0.29
356	0.32
357	0.36
358	0.45
359	0.54
360	0.53
361	0.5
362	0.5
363	0.48
364	0.53
365	0.53
366	0.5
367	0.44
368	0.37
369	0.36
370	0.35
371	0.31
372	0.24
373	0.21
374	0.16
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.06
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.11
401	0.14
402	0.15
403	0.17
404	0.16
405	0.21
406	0.24
407	0.25
408	0.27
409	0.31
410	0.36
411	0.38
412	0.39
413	0.35
414	0.35
415	0.37
416	0.41
417	0.45
418	0.49
419	0.45
420	0.45
421	0.48
422	0.49
423	0.51
424	0.5
425	0.46
426	0.44
427	0.45
428	0.44
429	0.42
430	0.36
431	0.31
432	0.25
433	0.18
434	0.13
435	0.1
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.05
443	0.07
444	0.08
445	0.1
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.12
451	0.15
452	0.17
453	0.17
454	0.18
455	0.19
456	0.24
457	0.28
458	0.3
459	0.3
460	0.31
461	0.31
462	0.29
463	0.33
464	0.32
465	0.3
466	0.31
467	0.29
468	0.26
469	0.25
470	0.25
471	0.21
472	0.18
473	0.15
474	0.12
475	0.11
476	0.11
477	0.11
478	0.11
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.06
486	0.06
487	0.07
488	0.1
489	0.12
490	0.14
491	0.14
492	0.18
493	0.19
494	0.21
495	0.21
496	0.23
497	0.22
498	0.22
499	0.21
500	0.19
501	0.16
502	0.15
503	0.15
504	0.1
505	0.09
506	0.07
507	0.07
508	0.06
509	0.15
510	0.15
511	0.17
512	0.22
513	0.23
514	0.25
515	0.3
516	0.3
517	0.24
518	0.26
519	0.3
520	0.26
521	0.28
522	0.26
523	0.22
524	0.22
525	0.22
526	0.2
527	0.18
528	0.17
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.14
533	0.12
534	0.11
535	0.08
536	0.06
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.08
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.1
555	0.11
556	0.11
557	0.1
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.09
562	0.08
563	0.07
564	0.07
565	0.1
566	0.11
567	0.12
568	0.14
569	0.22
570	0.23
571	0.25
572	0.24
573	0.21
574	0.29
575	0.36
576	0.36
577	0.38
578	0.47
579	0.49
580	0.52
581	0.53
582	0.45
583	0.38
584	0.4
585	0.31
586	0.29
587	0.27
588	0.24
589	0.23
590	0.23
591	0.23
592	0.22
593	0.21
594	0.16
595	0.15
596	0.16
597	0.16
598	0.17
599	0.16
600	0.12
601	0.11
602	0.08
603	0.1
604	0.12
605	0.14
606	0.16
607	0.18
608	0.19
609	0.24
610	0.29
611	0.28
612	0.31
613	0.37
614	0.44
615	0.51
616	0.6
617	0.61
618	0.64
619	0.65
620	0.6
621	0.53
622	0.44
623	0.38
624	0.29
625	0.23
626	0.16
627	0.13
628	0.12
629	0.11
630	0.11
631	0.08
632	0.07
633	0.08
634	0.07
635	0.09
636	0.1
637	0.14
638	0.15
639	0.19
640	0.24
641	0.25
642	0.28
643	0.29
644	0.31
645	0.32
646	0.36
647	0.34
648	0.35
649	0.38
650	0.38
651	0.39
652	0.39
653	0.4
654	0.39
655	0.4
656	0.37
657	0.36
658	0.34
659	0.32
660	0.29
661	0.24
662	0.21
663	0.19
664	0.16
665	0.12
666	0.11
667	0.1
668	0.1
669	0.09
670	0.09
671	0.08
672	0.09
673	0.09
674	0.1
675	0.1
676	0.16
677	0.23
678	0.23
679	0.23
680	0.25
681	0.25
682	0.25
683	0.26
684	0.19
685	0.12
686	0.11
687	0.13
688	0.11
689	0.1
690	0.1
691	0.09
692	0.08
693	0.07
694	0.07
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.04
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.03
710	0.04
711	0.07
712	0.08
713	0.11
714	0.16
715	0.2
716	0.26
717	0.3
718	0.34
719	0.35
720	0.38
721	0.4
722	0.39
723	0.42
724	0.38
725	0.38
726	0.37
727	0.39
728	0.38
729	0.33
730	0.3
731	0.26
732	0.26
733	0.27
734	0.24
735	0.19
736	0.17
737	0.17
738	0.19
739	0.17
740	0.15
741	0.12
742	0.13
743	0.15
744	0.18
745	0.18
746	0.18
747	0.25
748	0.25
749	0.26
750	0.27
751	0.25
752	0.23
753	0.25
754	0.26
755	0.21
756	0.23
757	0.22
758	0.21
759	0.21
760	0.2
761	0.18
762	0.17
763	0.16
764	0.13
765	0.14
766	0.16
767	0.15
768	0.16
769	0.16
770	0.16
771	0.16
772	0.16
773	0.14
774	0.1
775	0.11
776	0.13
777	0.12
778	0.14
779	0.15
780	0.14
781	0.15
782	0.14
783	0.14
784	0.13
785	0.15
786	0.15
787	0.16
788	0.16
789	0.16
790	0.16
791	0.15
792	0.16
793	0.14
794	0.12
795	0.12
796	0.13
797	0.12
798	0.12
799	0.12
800	0.11
801	0.11
802	0.14
803	0.16
804	0.16
805	0.16
806	0.15
807	0.16
808	0.16
809	0.15
810	0.09
811	0.08
812	0.09
813	0.1
814	0.1
815	0.1
816	0.1
817	0.12
818	0.16
819	0.22
820	0.29
821	0.35
822	0.39
823	0.44
824	0.52
825	0.6
826	0.66
827	0.63
828	0.61
829	0.6
830	0.56
831	0.52
832	0.46
833	0.37
834	0.29
835	0.24
836	0.16
837	0.12
838	0.12
839	0.1
840	0.09
841	0.08
842	0.08
843	0.08
844	0.09
845	0.09
846	0.09
847	0.12
848	0.13
849	0.14
850	0.15
851	0.21
852	0.26
853	0.34
854	0.41
855	0.43
856	0.52
857	0.61
858	0.66
859	0.64
860	0.67
861	0.68
862	0.7
863	0.69
864	0.61
865	0.55
866	0.49
867	0.49
868	0.44
869	0.38
870	0.38
871	0.39
872	0.45
873	0.47
874	0.5
875	0.5
876	0.47
877	0.45
878	0.43
879	0.37
880	0.34
881	0.3
882	0.28
883	0.35
884	0.34
885	0.35
886	0.32
887	0.32
888	0.3
889	0.33
890	0.34
891	0.28
892	0.28
893	0.27
894	0.27
895	0.29
896	0.29
897	0.29
898	0.27
899	0.27
900	0.33
901	0.34
902	0.35
903	0.35
904	0.33
905	0.35
906	0.36
907	0.35
908	0.28
909	0.28
910	0.27
911	0.28
912	0.33
913	0.27
914	0.26
915	0.26
916	0.33
917	0.31
918	0.31
919	0.3
920	0.24
921	0.23
922	0.22
923	0.2
924	0.15
925	0.2
926	0.23
927	0.25
928	0.25
929	0.25
930	0.3
931	0.29
932	0.37
933	0.34
934	0.35
935	0.33
936	0.41
937	0.43
938	0.46
939	0.47
940	0.41
941	0.39
942	0.35
943	0.33
944	0.27
945	0.24
946	0.16
947	0.14
948	0.12
949	0.11
950	0.09
951	0.06
952	0.07
953	0.08
954	0.1
955	0.11
956	0.11
957	0.1
958	0.1
959	0.11
960	0.09
961	0.08
962	0.07
963	0.06
964	0.05
965	0.05
966	0.05
967	0.04
968	0.04
969	0.04
970	0.04
971	0.05
972	0.06
973	0.07
974	0.07
975	0.08
976	0.1
977	0.11
978	0.11
979	0.12
980	0.12
981	0.12
982	0.12
983	0.14
984	0.15
985	0.17
986	0.18
987	0.18
988	0.2
989	0.23
990	0.3
991	0.3
992	0.3
993	0.27
994	0.3
995	0.31
996	0.31
997	0.32
998	0.31
999	0.32
1000	0.3
1001	0.3
1002	0.27
1003	0.25
1004	0.21
1005	0.21
1006	0.18
1007	0.15
1008	0.15
1009	0.15
1010	0.15
1011	0.17
1012	0.2
1013	0.18
1014	0.15
1015	0.17
1016	0.16
1017	0.18
1018	0.2
1019	0.22
1020	0.19
1021	0.19
1022	0.21
1023	0.19
1024	0.21
1025	0.19
1026	0.18
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.13
1030	0.12
1031	0.1
1032	0.1
1033	0.11
1034	0.1
1035	0.1
1036	0.11
1037	0.13
1038	0.12
1039	0.12
1040	0.11
1041	0.09
1042	0.15
1043	0.15
1044	0.16
1045	0.18
1046	0.19
1047	0.21
1048	0.21
1049	0.21
1050	0.17
1051	0.18
1052	0.16
1053	0.12
1054	0.12
1055	0.09
1056	0.09
1057	0.08
1058	0.1
1059	0.1
1060	0.1
1061	0.1
1062	0.1
1063	0.12
1064	0.14
1065	0.2
1066	0.2
1067	0.24
1068	0.28
1069	0.3
1070	0.32
1071	0.31
1072	0.31
1073	0.26
1074	0.25
1075	0.23
1076	0.19
1077	0.17
1078	0.16
1079	0.19
1080	0.19
1081	0.21
1082	0.21
1083	0.18
1084	0.21
1085	0.24
1086	0.25
1087	0.23
1088	0.23
1089	0.19
1090	0.24
1091	0.23
1092	0.21
1093	0.2
1094	0.19
1095	0.18
1096	0.24
1097	0.27
1098	0.28
1099	0.37
1100	0.44
1101	0.5
1102	0.58
1103	0.64
1104	0.6
1105	0.66
1106	0.64
1107	0.64
1108	0.6
1109	0.56
1110	0.52
1111	0.48
1112	0.48
1113	0.42
1114	0.39
1115	0.31
1116	0.34
1117	0.29
1118	0.32
1119	0.34
1120	0.35
1121	0.39
1122	0.44
1123	0.47
1124	0.49
1125	0.5
1126	0.47
1127	0.45
1128	0.46
1129	0.39
1130	0.39
1131	0.37
1132	0.3
1133	0.29
1134	0.26
1135	0.26
1136	0.25
1137	0.25
1138	0.23
1139	0.22
1140	0.25
1141	0.25

A7F448

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer