FuNGI

A0A059F2F3

Protein Details

Accession

A0A059F2F3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
643-662	CSDYSIKRIKKQNNNKKTNF	Hydrophilic
927-949	VLLRIKIKEKVKRKKLSDELVKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
932-941	KIKEKVKRKK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

MTFKPKLVKFDLYSDEELIKFCSLEVTETYSLDNLGHSIPNGLYDERMGPLKQGSTCLTCNQNYYQCPGHFGYIKTEEYIKPIVIDHVLFALQSKCFNCNKYKVMLSQENDDKFINSNDESEESEVKEINSKNFIINRNGNDDKFNNIDINALIESSNNLDYSALKTLRTILKIAKCPNCLVPHKPIHKVGNEIFSKSIKITIETIKSVLGANFNLCFSKIVLVTPNKFRPINYLGNKVYEDPMNNVYSKIIKERQPNLMHEVDLAIKQVIEKKEGIFRQNILGKRVNYSARSVISPDPNLATGEIGLPLIFAKKLSFPEKFTEFNFDRLFNAVINGNKYPGATHLTSDDVKIDLSFLDEHKRRGLAYQLKIGNKTVHRHVSNVDWLLVNRQPSLHKPSLMAHKVRVLGGEKTIRMHYANCNSYNADFDGDEINLHLVQDYLAFSEAKNILSTDMNYKSDTNNKPIRGLVQDHIVGATLLTMKDTFLTPQEFFYLTISHNVKSGTILPAIIRPCKLYSGKQCVSHLIHSIDTKVCLNNKSKVDEEEVVIMNSHLLSGVLDKNNLGPTSKSLVEIIGNKNNSYNTVLTLFSSLINKYLLKYGFTLRINDLFLNDCGEKVRKKEIYAANKEIENEFMPKQNTNICSDYSIKRIKKQNNNKKTNFTQKHFHLTNKLNYSEEAYHNSSYKIKNIMNQFTSKVLNHSLANTLIPFPYNNLSLIVLSGAKGSLVNVTQICCLLGQQELEGQRVSLMKNNLTLQILHQSKNTLKKENNFGEKEVEKGGFIFGRFLTGIKIHSFFFHCMAGREGLIDTAVKTARSGYLQRCLVKHLEGLMVCHNGYIYNNYNKIISFFSKKESGTPVGLIAAQSVGEPSTQMTLNTFHLAGVGNKNVTLGIPRLREILLVNKTNKKYFTLKQFDLKEIHSMLKDVLLRIKIKEKVKRKKLSDELVKEIIVRIKVSDHVKRVKEVLSDHFVIALNKILRKTHFGEKIIQNKISKEKEINLVENEEQNEEINEIISKESDSDTEKSENHELIKNDSLSNDNEDRNEESDVLIDNVIKKSVSSKCNVNSFMISSKKNIIKLSIILLEKKDVLLYPFIIEVIESMKLNDTEMNVIKDNNTITVEGCGINNLLTFMNDNLMKEVKDDYSMINLINLFITSYSNDIHSINDTLGLEASRNVIIKELKNVFDCYGISIDISHLELIGDYMCKTGIINAFSRNSFSNDDCMIQRMSFESTYAVLKNALMKTIHINGPSSKQMVGGLIKDECEIIYDLEN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.43
3	0.36
4	0.33
5	0.28
6	0.23
7	0.17
8	0.14
9	0.15
10	0.13
11	0.15
12	0.16
13	0.21
14	0.22
15	0.22
16	0.23
17	0.2
18	0.2
19	0.17
20	0.16
21	0.1
22	0.11
23	0.11
24	0.11
25	0.13
26	0.12
27	0.14
28	0.17
29	0.16
30	0.15
31	0.16
32	0.17
33	0.17
34	0.2
35	0.18
36	0.17
37	0.2
38	0.24
39	0.23
40	0.26
41	0.28
42	0.29
43	0.31
44	0.35
45	0.38
46	0.35
47	0.38
48	0.41
49	0.44
50	0.41
51	0.44
52	0.47
53	0.41
54	0.44
55	0.42
56	0.41
57	0.39
58	0.38
59	0.41
60	0.38
61	0.39
62	0.35
63	0.37
64	0.32
65	0.32
66	0.34
67	0.26
68	0.21
69	0.21
70	0.22
71	0.2
72	0.19
73	0.15
74	0.14
75	0.14
76	0.12
77	0.14
78	0.14
79	0.12
80	0.17
81	0.18
82	0.23
83	0.27
84	0.32
85	0.38
86	0.43
87	0.47
88	0.49
89	0.52
90	0.51
91	0.56
92	0.6
93	0.54
94	0.55
95	0.59
96	0.54
97	0.51
98	0.47
99	0.38
100	0.32
101	0.32
102	0.28
103	0.2
104	0.2
105	0.2
106	0.21
107	0.22
108	0.23
109	0.23
110	0.2
111	0.2
112	0.2
113	0.18
114	0.23
115	0.23
116	0.24
117	0.26
118	0.26
119	0.3
120	0.35
121	0.4
122	0.41
123	0.46
124	0.45
125	0.5
126	0.54
127	0.49
128	0.49
129	0.45
130	0.42
131	0.38
132	0.36
133	0.28
134	0.24
135	0.24
136	0.18
137	0.2
138	0.15
139	0.12
140	0.1
141	0.09
142	0.1
143	0.11
144	0.12
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.11
149	0.14
150	0.2
151	0.19
152	0.18
153	0.18
154	0.24
155	0.29
156	0.3
157	0.3
158	0.3
159	0.37
160	0.44
161	0.53
162	0.54
163	0.51
164	0.52
165	0.56
166	0.57
167	0.55
168	0.53
169	0.53
170	0.56
171	0.59
172	0.63
173	0.64
174	0.62
175	0.59
176	0.61
177	0.56
178	0.55
179	0.51
180	0.46
181	0.41
182	0.36
183	0.34
184	0.27
185	0.28
186	0.19
187	0.19
188	0.21
189	0.25
190	0.28
191	0.28
192	0.28
193	0.24
194	0.24
195	0.23
196	0.2
197	0.16
198	0.13
199	0.14
200	0.14
201	0.14
202	0.14
203	0.14
204	0.14
205	0.12
206	0.14
207	0.13
208	0.14
209	0.2
210	0.26
211	0.3
212	0.37
213	0.42
214	0.44
215	0.44
216	0.43
217	0.43
218	0.43
219	0.49
220	0.46
221	0.49
222	0.45
223	0.48
224	0.49
225	0.43
226	0.39
227	0.31
228	0.28
229	0.23
230	0.25
231	0.24
232	0.23
233	0.22
234	0.21
235	0.21
236	0.21
237	0.25
238	0.27
239	0.31
240	0.4
241	0.45
242	0.53
243	0.55
244	0.57
245	0.56
246	0.51
247	0.45
248	0.37
249	0.32
250	0.24
251	0.19
252	0.17
253	0.11
254	0.09
255	0.1
256	0.16
257	0.16
258	0.18
259	0.18
260	0.19
261	0.27
262	0.31
263	0.33
264	0.3
265	0.3
266	0.34
267	0.39
268	0.4
269	0.38
270	0.4
271	0.38
272	0.38
273	0.42
274	0.39
275	0.35
276	0.35
277	0.34
278	0.3
279	0.3
280	0.3
281	0.29
282	0.3
283	0.3
284	0.27
285	0.24
286	0.23
287	0.23
288	0.2
289	0.15
290	0.1
291	0.1
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.09
302	0.15
303	0.2
304	0.23
305	0.25
306	0.3
307	0.34
308	0.35
309	0.33
310	0.37
311	0.33
312	0.36
313	0.35
314	0.3
315	0.27
316	0.27
317	0.27
318	0.18
319	0.18
320	0.15
321	0.15
322	0.18
323	0.17
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.15
328	0.14
329	0.17
330	0.14
331	0.15
332	0.15
333	0.18
334	0.19
335	0.19
336	0.17
337	0.12
338	0.12
339	0.11
340	0.1
341	0.06
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.17
346	0.2
347	0.21
348	0.24
349	0.24
350	0.23
351	0.24
352	0.32
353	0.31
354	0.33
355	0.39
356	0.42
357	0.44
358	0.45
359	0.46
360	0.43
361	0.38
362	0.39
363	0.38
364	0.41
365	0.39
366	0.39
367	0.39
368	0.37
369	0.38
370	0.35
371	0.29
372	0.22
373	0.21
374	0.23
375	0.24
376	0.2
377	0.15
378	0.15
379	0.17
380	0.21
381	0.29
382	0.28
383	0.27
384	0.28
385	0.32
386	0.41
387	0.44
388	0.42
389	0.35
390	0.36
391	0.36
392	0.35
393	0.33
394	0.25
395	0.21
396	0.23
397	0.25
398	0.21
399	0.22
400	0.22
401	0.21
402	0.19
403	0.2
404	0.23
405	0.27
406	0.31
407	0.31
408	0.32
409	0.32
410	0.31
411	0.31
412	0.24
413	0.18
414	0.13
415	0.12
416	0.12
417	0.1
418	0.1
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.04
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.12
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.17
442	0.18
443	0.18
444	0.19
445	0.2
446	0.28
447	0.3
448	0.33
449	0.36
450	0.36
451	0.36
452	0.36
453	0.37
454	0.31
455	0.32
456	0.25
457	0.23
458	0.23
459	0.21
460	0.2
461	0.17
462	0.13
463	0.09
464	0.09
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.08
474	0.11
475	0.11
476	0.12
477	0.14
478	0.14
479	0.14
480	0.14
481	0.13
482	0.11
483	0.17
484	0.18
485	0.16
486	0.17
487	0.17
488	0.16
489	0.15
490	0.17
491	0.12
492	0.11
493	0.11
494	0.1
495	0.14
496	0.16
497	0.16
498	0.15
499	0.14
500	0.15
501	0.19
502	0.21
503	0.24
504	0.3
505	0.38
506	0.41
507	0.43
508	0.44
509	0.44
510	0.44
511	0.4
512	0.35
513	0.26
514	0.24
515	0.21
516	0.22
517	0.17
518	0.16
519	0.16
520	0.14
521	0.16
522	0.18
523	0.22
524	0.26
525	0.29
526	0.31
527	0.31
528	0.31
529	0.32
530	0.29
531	0.26
532	0.22
533	0.2
534	0.17
535	0.15
536	0.13
537	0.09
538	0.08
539	0.07
540	0.04
541	0.03
542	0.03
543	0.05
544	0.08
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.11
549	0.12
550	0.13
551	0.12
552	0.09
553	0.11
554	0.14
555	0.15
556	0.14
557	0.12
558	0.13
559	0.14
560	0.18
561	0.19
562	0.2
563	0.2
564	0.2
565	0.21
566	0.21
567	0.2
568	0.18
569	0.15
570	0.11
571	0.12
572	0.12
573	0.11
574	0.12
575	0.11
576	0.09
577	0.1
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.09
583	0.13
584	0.13
585	0.12
586	0.14
587	0.15
588	0.2
589	0.21
590	0.22
591	0.19
592	0.21
593	0.21
594	0.19
595	0.18
596	0.13
597	0.12
598	0.13
599	0.12
600	0.1
601	0.1
602	0.13
603	0.14
604	0.15
605	0.22
606	0.21
607	0.22
608	0.3
609	0.36
610	0.43
611	0.48
612	0.49
613	0.44
614	0.43
615	0.43
616	0.35
617	0.28
618	0.19
619	0.16
620	0.13
621	0.15
622	0.15
623	0.14
624	0.15
625	0.18
626	0.18
627	0.2
628	0.2
629	0.17
630	0.19
631	0.22
632	0.22
633	0.24
634	0.31
635	0.28
636	0.34
637	0.41
638	0.48
639	0.55
640	0.65
641	0.7
642	0.74
643	0.82
644	0.79
645	0.78
646	0.76
647	0.76
648	0.72
649	0.64
650	0.61
651	0.54
652	0.59
653	0.54
654	0.49
655	0.46
656	0.44
657	0.47
658	0.44
659	0.42
660	0.34
661	0.32
662	0.33
663	0.28
664	0.24
665	0.22
666	0.21
667	0.2
668	0.2
669	0.21
670	0.22
671	0.2
672	0.21
673	0.22
674	0.2
675	0.24
676	0.29
677	0.33
678	0.31
679	0.32
680	0.31
681	0.27
682	0.29
683	0.24
684	0.2
685	0.17
686	0.17
687	0.15
688	0.15
689	0.14
690	0.13
691	0.13
692	0.11
693	0.1
694	0.08
695	0.08
696	0.07
697	0.07
698	0.09
699	0.09
700	0.09
701	0.09
702	0.09
703	0.09
704	0.09
705	0.08
706	0.06
707	0.06
708	0.05
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.05
714	0.05
715	0.07
716	0.07
717	0.08
718	0.08
719	0.09
720	0.09
721	0.07
722	0.07
723	0.06
724	0.07
725	0.06
726	0.06
727	0.09
728	0.1
729	0.11
730	0.11
731	0.1
732	0.1
733	0.11
734	0.11
735	0.13
736	0.13
737	0.13
738	0.16
739	0.17
740	0.18
741	0.17
742	0.17
743	0.14
744	0.21
745	0.22
746	0.2
747	0.2
748	0.21
749	0.24
750	0.34
751	0.36
752	0.34
753	0.36
754	0.4
755	0.49
756	0.53
757	0.58
758	0.5
759	0.48
760	0.46
761	0.43
762	0.39
763	0.31
764	0.25
765	0.16
766	0.15
767	0.15
768	0.11
769	0.1
770	0.1
771	0.08
772	0.09
773	0.09
774	0.09
775	0.09
776	0.09
777	0.11
778	0.11
779	0.12
780	0.11
781	0.13
782	0.15
783	0.15
784	0.16
785	0.16
786	0.15
787	0.15
788	0.17
789	0.15
790	0.13
791	0.12
792	0.11
793	0.09
794	0.08
795	0.07
796	0.06
797	0.08
798	0.08
799	0.08
800	0.08
801	0.08
802	0.09
803	0.12
804	0.16
805	0.17
806	0.24
807	0.28
808	0.31
809	0.31
810	0.32
811	0.32
812	0.28
813	0.26
814	0.2
815	0.19
816	0.16
817	0.17
818	0.17
819	0.16
820	0.15
821	0.14
822	0.12
823	0.1
824	0.1
825	0.13
826	0.15
827	0.19
828	0.21
829	0.21
830	0.22
831	0.21
832	0.22
833	0.21
834	0.2
835	0.2
836	0.2
837	0.23
838	0.27
839	0.27
840	0.28
841	0.3
842	0.29
843	0.25
844	0.24
845	0.21
846	0.17
847	0.17
848	0.14
849	0.1
850	0.07
851	0.06
852	0.05
853	0.05
854	0.05
855	0.04
856	0.04
857	0.05
858	0.06
859	0.07
860	0.07
861	0.08
862	0.1
863	0.12
864	0.13
865	0.13
866	0.1
867	0.11
868	0.12
869	0.13
870	0.13
871	0.14
872	0.12
873	0.12
874	0.12
875	0.12
876	0.11
877	0.11
878	0.1
879	0.14
880	0.15
881	0.16
882	0.18
883	0.18
884	0.18
885	0.18
886	0.23
887	0.24
888	0.29
889	0.33
890	0.39
891	0.42
892	0.44
893	0.44
894	0.41
895	0.41
896	0.41
897	0.47
898	0.48
899	0.49
900	0.54
901	0.55
902	0.55
903	0.51
904	0.46
905	0.39
906	0.32
907	0.31
908	0.24
909	0.21
910	0.18
911	0.19
912	0.19
913	0.16
914	0.18
915	0.2
916	0.21
917	0.22
918	0.29
919	0.32
920	0.39
921	0.47
922	0.54
923	0.61
924	0.7
925	0.78
926	0.76
927	0.8
928	0.81
929	0.82
930	0.81
931	0.76
932	0.72
933	0.64
934	0.58
935	0.48
936	0.42
937	0.35
938	0.26
939	0.2
940	0.15
941	0.14
942	0.19
943	0.25
944	0.29
945	0.33
946	0.4
947	0.41
948	0.43
949	0.44
950	0.42
951	0.39
952	0.37
953	0.35
954	0.33
955	0.33
956	0.3
957	0.29
958	0.27
959	0.24
960	0.21
961	0.2
962	0.17
963	0.18
964	0.2
965	0.21
966	0.21
967	0.27
968	0.31
969	0.35
970	0.39
971	0.39
972	0.46
973	0.51
974	0.59
975	0.59
976	0.59
977	0.52
978	0.49
979	0.55
980	0.51
981	0.47
982	0.41
983	0.4
984	0.44
985	0.46
986	0.46
987	0.39
988	0.39
989	0.36
990	0.36
991	0.33
992	0.25
993	0.21
994	0.18
995	0.16
996	0.12
997	0.11
998	0.08
999	0.08
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.07
1004	0.08
1005	0.08
1006	0.1
1007	0.13
1008	0.14
1009	0.18
1010	0.21
1011	0.21
1012	0.25
1013	0.28
1014	0.29
1015	0.28
1016	0.31
1017	0.29
1018	0.3
1019	0.35
1020	0.31
1021	0.28
1022	0.27
1023	0.27
1024	0.23
1025	0.28
1026	0.28
1027	0.24
1028	0.24
1029	0.26
1030	0.27
1031	0.27
1032	0.27
1033	0.21
1034	0.17
1035	0.16
1036	0.16
1037	0.14
1038	0.12
1039	0.11
1040	0.13
1041	0.13
1042	0.14
1043	0.12
1044	0.11
1045	0.17
1046	0.24
1047	0.27
1048	0.28
1049	0.35
1050	0.4
1051	0.47
1052	0.49
1053	0.45
1054	0.4
1055	0.38
1056	0.41
1057	0.39
1058	0.35
1059	0.31
1060	0.37
1061	0.38
1062	0.4
1063	0.39
1064	0.35
1065	0.33
1066	0.33
1067	0.34
1068	0.32
1069	0.3
1070	0.29
1071	0.29
1072	0.28
1073	0.25
1074	0.23
1075	0.2
1076	0.15
1077	0.15
1078	0.15
1079	0.14
1080	0.13
1081	0.13
1082	0.13
1083	0.12
1084	0.1
1085	0.09
1086	0.08
1087	0.09
1088	0.08
1089	0.09
1090	0.11
1091	0.12
1092	0.13
1093	0.14
1094	0.13
1095	0.17
1096	0.2
1097	0.23
1098	0.21
1099	0.22
1100	0.22
1101	0.23
1102	0.22
1103	0.19
1104	0.18
1105	0.15
1106	0.14
1107	0.15
1108	0.16
1109	0.14
1110	0.13
1111	0.12
1112	0.11
1113	0.1
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.08
1117	0.08
1118	0.1
1119	0.09
1120	0.13
1121	0.14
1122	0.15
1123	0.16
1124	0.18
1125	0.17
1126	0.17
1127	0.2
1128	0.16
1129	0.17
1130	0.18
1131	0.16
1132	0.18
1133	0.19
1134	0.18
1135	0.17
1136	0.17
1137	0.15
1138	0.14
1139	0.13
1140	0.09
1141	0.08
1142	0.09
1143	0.08
1144	0.1
1145	0.1
1146	0.11
1147	0.13
1148	0.13
1149	0.14
1150	0.15
1151	0.16
1152	0.14
1153	0.17
1154	0.16
1155	0.15
1156	0.15
1157	0.14
1158	0.12
1159	0.11
1160	0.13
1161	0.12
1162	0.12
1163	0.12
1164	0.16
1165	0.2
1166	0.22
1167	0.3
1168	0.33
1169	0.34
1170	0.36
1171	0.39
1172	0.35
1173	0.33
1174	0.31
1175	0.25
1176	0.22
1177	0.18
1178	0.16
1179	0.13
1180	0.13
1181	0.12
1182	0.13
1183	0.1
1184	0.08
1185	0.08
1186	0.08
1187	0.08
1188	0.08
1189	0.08
1190	0.07
1191	0.08
1192	0.08
1193	0.08
1194	0.08
1195	0.13
1196	0.17
1197	0.19
1198	0.21
1199	0.26
1200	0.3
1201	0.31
1202	0.33
1203	0.3
1204	0.3
1205	0.31
1206	0.3
1207	0.3
1208	0.28
1209	0.3
1210	0.29
1211	0.3
1212	0.27
1213	0.23
1214	0.22
1215	0.19
1216	0.21
1217	0.19
1218	0.18
1219	0.17
1220	0.16
1221	0.2
1222	0.19
1223	0.18
1224	0.15
1225	0.16
1226	0.22
1227	0.21
1228	0.24
1229	0.21
1230	0.22
1231	0.26
1232	0.32
1233	0.35
1234	0.3
1235	0.32
1236	0.31
1237	0.36
1238	0.39
1239	0.35
1240	0.29
1241	0.26
1242	0.26
1243	0.27
1244	0.27
1245	0.24
1246	0.23
1247	0.22
1248	0.22
1249	0.22
1250	0.21
1251	0.16
1252	0.16
1253	0.15

A0A059F2F3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer