Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5GFJ4

Protein Details
Accession M5GFJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-66ATLAQRTRKARSVRHARRRRRGEEEDSEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-57TRKARSVRHARRRRR
253-267RGGSEGGSRGRGRGR
345-370RAARGRGRGGFRGRGAVRGAPPARGG
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 9.999, nucl 7.5, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MIMATTSASPVDVMPKLAQQTASVPDLQQTQPDASSATLAQRTRKARSVRHARRRRRGEEEDSEDEIVRDAGSESESEREELVDSEEESDVDDVEEPPTLVPSVNGKATISTTVEVAPSESTIPTATKWSDMVTSELDGGADASLPIIDFAEMGSVTPSASAAPVTTAPVPNEVESVSVKASASTSSGKTSSKTGPSARQAYLQRLENDPQFIPRVGAFWGHDDRLLDKGLRSMSPWWRDRQMAFRARGGMGRGGSEGGSRGRGRGRAGAAYYGGRGEAEASHTPVHAPATGPVPDTEAVPSALEASLAVPVPAPVPPPPPPAHPSDLPWGHDGYEELKRTDAERAARGRGRGGFRGRGAVRGAPPARGGHAVHGAPRAAVVSTTNAPSSFKNTRAEKPWTKDLAVHLYTDPTLQPKDNQGAGIRLKFPGSPNEGVVVRLPATISEPDRTRSPASASSAMKGPKVKLPSVPNPRSLSGTISVVDNGDFAQTVGSGPLSTPPSGNLVLETTAVPVPSATTEPVPVPEIDTVTKLEKQFQNIAVQQQQVAPQPQFKAINGFDPTALTNDKSLDIRPTPTQHQTLPPPHLQISPQPYPQYSYGVALPPGIAMDENGVCFEVATGRVVILQQPTPSPIYHPRPTAPLPGFVPHLRPMQNPSPETFTPSPFSDAVQPALPDAYLYPDQSGMPYFAQRRSSGPISIRSPTEPPSTAKPASSAGPPSSSLLRAAVHAAPFQPNRSLVTPQPSSFVPRAGYFTGSYDVSPVPLTGPSALPDDPAIVGRDLTLTQYATYYPPEQMYAYPPGEYAYTTYGYEGAVPEGYVPPADGRGPAVYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.23
4 0.25
5 0.25
6 0.21
7 0.24
8 0.25
9 0.26
10 0.24
11 0.21
12 0.22
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.23
17 0.23
18 0.22
19 0.23
20 0.21
21 0.16
22 0.18
23 0.16
24 0.18
25 0.22
26 0.24
27 0.29
28 0.36
29 0.41
30 0.45
31 0.52
32 0.55
33 0.58
34 0.67
35 0.73
36 0.76
37 0.82
38 0.87
39 0.89
40 0.92
41 0.94
42 0.91
43 0.9
44 0.87
45 0.85
46 0.85
47 0.82
48 0.77
49 0.7
50 0.63
51 0.53
52 0.44
53 0.35
54 0.25
55 0.17
56 0.11
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.12
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.15
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.14
76 0.13
77 0.1
78 0.09
79 0.1
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.13
90 0.16
91 0.17
92 0.18
93 0.17
94 0.18
95 0.19
96 0.21
97 0.18
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.13
103 0.13
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.17
118 0.18
119 0.19
120 0.16
121 0.17
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.11
126 0.1
127 0.07
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.12
154 0.13
155 0.14
156 0.17
157 0.18
158 0.17
159 0.17
160 0.15
161 0.15
162 0.13
163 0.14
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.16
174 0.18
175 0.18
176 0.19
177 0.23
178 0.26
179 0.28
180 0.32
181 0.34
182 0.4
183 0.46
184 0.5
185 0.47
186 0.48
187 0.47
188 0.48
189 0.49
190 0.47
191 0.42
192 0.4
193 0.42
194 0.38
195 0.38
196 0.32
197 0.28
198 0.26
199 0.23
200 0.21
201 0.17
202 0.16
203 0.13
204 0.15
205 0.13
206 0.16
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.18
211 0.19
212 0.18
213 0.19
214 0.15
215 0.12
216 0.15
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.21
221 0.27
222 0.35
223 0.38
224 0.39
225 0.41
226 0.44
227 0.44
228 0.46
229 0.47
230 0.47
231 0.46
232 0.45
233 0.44
234 0.41
235 0.41
236 0.35
237 0.28
238 0.21
239 0.19
240 0.16
241 0.14
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.09
246 0.13
247 0.12
248 0.14
249 0.17
250 0.19
251 0.21
252 0.24
253 0.25
254 0.24
255 0.25
256 0.24
257 0.22
258 0.2
259 0.18
260 0.14
261 0.11
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.09
267 0.1
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.11
304 0.14
305 0.19
306 0.2
307 0.24
308 0.26
309 0.29
310 0.32
311 0.3
312 0.3
313 0.33
314 0.34
315 0.32
316 0.3
317 0.26
318 0.22
319 0.21
320 0.19
321 0.14
322 0.18
323 0.17
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.17
328 0.2
329 0.2
330 0.17
331 0.22
332 0.24
333 0.28
334 0.3
335 0.3
336 0.29
337 0.31
338 0.31
339 0.32
340 0.33
341 0.32
342 0.3
343 0.36
344 0.34
345 0.31
346 0.29
347 0.26
348 0.24
349 0.27
350 0.27
351 0.21
352 0.22
353 0.2
354 0.2
355 0.19
356 0.18
357 0.13
358 0.16
359 0.15
360 0.16
361 0.17
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.16
377 0.17
378 0.19
379 0.25
380 0.29
381 0.33
382 0.38
383 0.45
384 0.45
385 0.48
386 0.52
387 0.47
388 0.44
389 0.42
390 0.39
391 0.37
392 0.32
393 0.28
394 0.2
395 0.18
396 0.18
397 0.16
398 0.14
399 0.09
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.12
404 0.15
405 0.15
406 0.16
407 0.14
408 0.18
409 0.19
410 0.2
411 0.18
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.19
418 0.18
419 0.18
420 0.2
421 0.19
422 0.19
423 0.18
424 0.14
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.06
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.12
433 0.13
434 0.15
435 0.16
436 0.19
437 0.18
438 0.17
439 0.19
440 0.19
441 0.22
442 0.26
443 0.25
444 0.24
445 0.26
446 0.26
447 0.25
448 0.24
449 0.21
450 0.19
451 0.22
452 0.22
453 0.24
454 0.3
455 0.37
456 0.46
457 0.48
458 0.5
459 0.5
460 0.49
461 0.46
462 0.4
463 0.33
464 0.24
465 0.22
466 0.16
467 0.14
468 0.13
469 0.1
470 0.1
471 0.07
472 0.06
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.08
484 0.09
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.1
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.1
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.11
514 0.11
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.17
519 0.16
520 0.22
521 0.23
522 0.26
523 0.29
524 0.29
525 0.33
526 0.31
527 0.35
528 0.32
529 0.3
530 0.27
531 0.24
532 0.24
533 0.22
534 0.23
535 0.2
536 0.2
537 0.21
538 0.25
539 0.25
540 0.22
541 0.25
542 0.22
543 0.27
544 0.26
545 0.25
546 0.21
547 0.2
548 0.21
549 0.17
550 0.17
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.12
555 0.13
556 0.13
557 0.16
558 0.16
559 0.19
560 0.22
561 0.25
562 0.29
563 0.33
564 0.35
565 0.32
566 0.37
567 0.41
568 0.44
569 0.45
570 0.43
571 0.4
572 0.39
573 0.38
574 0.34
575 0.33
576 0.34
577 0.33
578 0.34
579 0.33
580 0.32
581 0.34
582 0.34
583 0.31
584 0.24
585 0.21
586 0.2
587 0.19
588 0.19
589 0.15
590 0.14
591 0.1
592 0.1
593 0.08
594 0.06
595 0.04
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.1
612 0.11
613 0.13
614 0.13
615 0.13
616 0.16
617 0.17
618 0.17
619 0.19
620 0.26
621 0.32
622 0.36
623 0.39
624 0.39
625 0.43
626 0.45
627 0.49
628 0.42
629 0.38
630 0.35
631 0.34
632 0.36
633 0.31
634 0.32
635 0.27
636 0.31
637 0.29
638 0.29
639 0.34
640 0.38
641 0.44
642 0.42
643 0.41
644 0.42
645 0.4
646 0.46
647 0.41
648 0.36
649 0.32
650 0.32
651 0.33
652 0.27
653 0.28
654 0.26
655 0.26
656 0.25
657 0.23
658 0.21
659 0.18
660 0.18
661 0.16
662 0.1
663 0.09
664 0.12
665 0.12
666 0.13
667 0.13
668 0.14
669 0.14
670 0.15
671 0.16
672 0.13
673 0.12
674 0.18
675 0.2
676 0.24
677 0.28
678 0.28
679 0.3
680 0.35
681 0.36
682 0.36
683 0.37
684 0.4
685 0.4
686 0.42
687 0.41
688 0.37
689 0.37
690 0.36
691 0.37
692 0.32
693 0.32
694 0.36
695 0.4
696 0.39
697 0.37
698 0.34
699 0.31
700 0.31
701 0.32
702 0.29
703 0.24
704 0.24
705 0.25
706 0.25
707 0.26
708 0.24
709 0.21
710 0.19
711 0.17
712 0.16
713 0.18
714 0.18
715 0.17
716 0.18
717 0.19
718 0.24
719 0.25
720 0.27
721 0.27
722 0.26
723 0.29
724 0.3
725 0.33
726 0.3
727 0.37
728 0.39
729 0.36
730 0.37
731 0.34
732 0.37
733 0.34
734 0.33
735 0.28
736 0.25
737 0.29
738 0.27
739 0.29
740 0.23
741 0.24
742 0.24
743 0.22
744 0.2
745 0.18
746 0.16
747 0.15
748 0.15
749 0.13
750 0.11
751 0.11
752 0.12
753 0.12
754 0.12
755 0.13
756 0.16
757 0.16
758 0.15
759 0.15
760 0.15
761 0.14
762 0.15
763 0.15
764 0.12
765 0.12
766 0.11
767 0.13
768 0.12
769 0.13
770 0.13
771 0.12
772 0.12
773 0.13
774 0.14
775 0.14
776 0.18
777 0.18
778 0.18
779 0.19
780 0.2
781 0.21
782 0.21
783 0.24
784 0.27
785 0.26
786 0.24
787 0.23
788 0.22
789 0.22
790 0.2
791 0.18
792 0.15
793 0.15
794 0.15
795 0.16
796 0.15
797 0.15
798 0.16
799 0.14
800 0.12
801 0.11
802 0.1
803 0.11
804 0.12
805 0.13
806 0.11
807 0.11
808 0.11
809 0.13
810 0.14
811 0.13
812 0.14