Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5FS28

Protein Details
Accession M5FS28    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-175EEEEERERKKKRNEKKLEVRAHKAKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-179KRKLSKEEEEERERKKKRNEKKLEVRAHKAKEQQDK
185-192KFAKKSEK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 11.5, cyto 3, mito 2.5, cyto_pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014002  Agenet_dom_plant  
IPR010304  SMN_Tudor  
IPR002999  Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50304  TUDOR  
Amino Acid Sequences MDRQELEQYQAQLAQVNAVLEEDAENEELQSLRTEIVELIDLAQKALAQEAIAAARAKASAAKAATGVRAIPQADFKPGGDVDAKYSRDGHWYPAKIIAVGGSESNRVYTVLFKGYSETEIVKASEIRASTSTQPWQNPHNDAKRKLSKEEEEERERKKKRNEKKLEVRAHKAKEQQDKQQAWMKFAKKSEKKGIEIAGMSGRSIFKSPDNPLGRVGVTGSGKGMTSYTSMGKHKFAAEEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.15
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.1
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.09
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.09
33 0.1
34 0.08
35 0.05
36 0.05
37 0.06
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.14
52 0.15
53 0.13
54 0.13
55 0.1
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.14
60 0.14
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.17
67 0.15
68 0.15
69 0.16
70 0.22
71 0.22
72 0.2
73 0.21
74 0.2
75 0.24
76 0.25
77 0.25
78 0.26
79 0.27
80 0.27
81 0.3
82 0.3
83 0.24
84 0.23
85 0.18
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.13
118 0.15
119 0.19
120 0.2
121 0.22
122 0.23
123 0.26
124 0.28
125 0.31
126 0.35
127 0.41
128 0.45
129 0.46
130 0.53
131 0.58
132 0.57
133 0.57
134 0.55
135 0.51
136 0.51
137 0.56
138 0.55
139 0.54
140 0.57
141 0.59
142 0.63
143 0.63
144 0.63
145 0.65
146 0.67
147 0.7
148 0.76
149 0.8
150 0.81
151 0.87
152 0.9
153 0.9
154 0.87
155 0.86
156 0.83
157 0.77
158 0.71
159 0.67
160 0.65
161 0.65
162 0.63
163 0.64
164 0.65
165 0.62
166 0.62
167 0.62
168 0.55
169 0.49
170 0.51
171 0.45
172 0.41
173 0.45
174 0.51
175 0.51
176 0.58
177 0.64
178 0.63
179 0.63
180 0.62
181 0.59
182 0.52
183 0.45
184 0.39
185 0.33
186 0.26
187 0.23
188 0.2
189 0.17
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.21
195 0.25
196 0.34
197 0.38
198 0.38
199 0.38
200 0.39
201 0.35
202 0.3
203 0.26
204 0.22
205 0.19
206 0.18
207 0.17
208 0.15
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.15
216 0.19
217 0.24
218 0.26
219 0.29
220 0.3
221 0.31
222 0.32
223 0.31