FuNGI

M5G1S1

Protein Details

Accession

M5G1S1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
307-326	AEWKRSKKLKRRHGDTLERN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
310-319	KRSKKLKRRH
404-442	RSGREEYRGGGRGRGGGRGGWREPAGGRDRGRGRGRGRG

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, cysk 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MDSTVPSRSLGVPQDLALLMEMAQEHVAPSVQAPVVLPVRLPIQVLGKVPLAEPEKPDAEHGALSENQDAAQLKLPSEPQVSIADQANIEPSPPEGAESLSDSESESDDGSESESEESDSSDEADGSESVNERSQPQRAKRQPAEVDEADEEPGPTGPAAFASKHEIVIPNVEMPEFEEIGPEEKIEQIGEVMNIVDSVVVVRGRMNSQYQVIDSGSLLVFEDRKVLGFVFETFGAVSSPLYTVRFPSSSLVPSRVLPSLPIFHVPQRSTYIFTRHLLLLKGSDASNMHDEEVEGDEVEFSDDEKEAEWKRSKKLKRRHGDTLERNGPRFREQEQDVGLDYGDSSVPASDLLAARGPPVRYDDEDFGMADAEPVRSRSPTEDTRRSLGVGRDRDGQRDREWVPRSGREEYRGGGRGRGGGRGGWREPAGGRDRGRGRGRGRGGPSNYNNPNNYDRPPPPQSGPHGYSNSTHGDVAGLSGRAMSPASEAIARVTGQYDAGPSQPSYPSTPYGQHALHSPPGPQDTYDPRAPAFSTVSPSPVQSYPSTPMQTQMALQMQMPFAFGGHINPRFAFAPGFLPQVQMQMQMQQQPGMFGMQQQGRGGQGAWGWEQQHPQGGYPPQQGDGEQHDGVGGEEHRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.24
4	0.18
5	0.14
6	0.1
7	0.1
8	0.1
9	0.08
10	0.08
11	0.08
12	0.08
13	0.08
14	0.08
15	0.07
16	0.07
17	0.11
18	0.11
19	0.12
20	0.12
21	0.16
22	0.18
23	0.18
24	0.18
25	0.15
26	0.17
27	0.17
28	0.18
29	0.15
30	0.17
31	0.21
32	0.23
33	0.24
34	0.24
35	0.23
36	0.23
37	0.27
38	0.27
39	0.26
40	0.27
41	0.29
42	0.3
43	0.3
44	0.31
45	0.27
46	0.25
47	0.23
48	0.2
49	0.19
50	0.18
51	0.2
52	0.2
53	0.17
54	0.15
55	0.18
56	0.18
57	0.15
58	0.2
59	0.19
60	0.18
61	0.21
62	0.23
63	0.24
64	0.26
65	0.24
66	0.2
67	0.23
68	0.24
69	0.23
70	0.24
71	0.21
72	0.19
73	0.19
74	0.19
75	0.15
76	0.14
77	0.12
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.12
82	0.1
83	0.11
84	0.12
85	0.14
86	0.15
87	0.13
88	0.13
89	0.13
90	0.13
91	0.13
92	0.13
93	0.1
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.1
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.08
110	0.08
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.09
115	0.09
116	0.1
117	0.12
118	0.13
119	0.15
120	0.18
121	0.25
122	0.32
123	0.39
124	0.49
125	0.56
126	0.65
127	0.67
128	0.73
129	0.72
130	0.68
131	0.69
132	0.58
133	0.53
134	0.44
135	0.4
136	0.31
137	0.25
138	0.2
139	0.13
140	0.12
141	0.09
142	0.07
143	0.06
144	0.05
145	0.07
146	0.09
147	0.08
148	0.1
149	0.16
150	0.17
151	0.17
152	0.19
153	0.19
154	0.18
155	0.21
156	0.2
157	0.16
158	0.15
159	0.15
160	0.13
161	0.12
162	0.14
163	0.12
164	0.11
165	0.1
166	0.1
167	0.12
168	0.13
169	0.11
170	0.09
171	0.08
172	0.09
173	0.08
174	0.08
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.03
185	0.03
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.07
191	0.09
192	0.11
193	0.13
194	0.14
195	0.16
196	0.17
197	0.16
198	0.17
199	0.16
200	0.14
201	0.12
202	0.11
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.06
207	0.07
208	0.06
209	0.08
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.09
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.08
229	0.07
230	0.09
231	0.11
232	0.12
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.17
237	0.18
238	0.2
239	0.18
240	0.19
241	0.2
242	0.19
243	0.17
244	0.15
245	0.15
246	0.14
247	0.14
248	0.15
249	0.15
250	0.17
251	0.22
252	0.21
253	0.22
254	0.24
255	0.24
256	0.26
257	0.26
258	0.28
259	0.26
260	0.26
261	0.26
262	0.23
263	0.24
264	0.21
265	0.19
266	0.15
267	0.12
268	0.13
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.1
273	0.12
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.1
280	0.08
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.05
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.09
293	0.09
294	0.15
295	0.21
296	0.23
297	0.3
298	0.39
299	0.47
300	0.53
301	0.63
302	0.67
303	0.72
304	0.76
305	0.79
306	0.79
307	0.81
308	0.79
309	0.78
310	0.76
311	0.67
312	0.61
313	0.53
314	0.45
315	0.39
316	0.34
317	0.27
318	0.25
319	0.25
320	0.27
321	0.27
322	0.26
323	0.22
324	0.2
325	0.18
326	0.12
327	0.1
328	0.06
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.11
343	0.11
344	0.1
345	0.13
346	0.14
347	0.15
348	0.18
349	0.19
350	0.18
351	0.18
352	0.17
353	0.14
354	0.13
355	0.1
356	0.08
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.12
365	0.17
366	0.25
367	0.33
368	0.39
369	0.41
370	0.43
371	0.43
372	0.41
373	0.39
374	0.36
375	0.35
376	0.3
377	0.3
378	0.36
379	0.36
380	0.4
381	0.4
382	0.39
383	0.33
384	0.36
385	0.37
386	0.37
387	0.39
388	0.4
389	0.41
390	0.43
391	0.46
392	0.45
393	0.45
394	0.41
395	0.39
396	0.34
397	0.36
398	0.35
399	0.31
400	0.27
401	0.25
402	0.27
403	0.26
404	0.27
405	0.21
406	0.18
407	0.21
408	0.24
409	0.24
410	0.22
411	0.21
412	0.2
413	0.2
414	0.24
415	0.25
416	0.26
417	0.26
418	0.32
419	0.35
420	0.42
421	0.46
422	0.47
423	0.46
424	0.49
425	0.52
426	0.51
427	0.53
428	0.53
429	0.53
430	0.55
431	0.56
432	0.56
433	0.58
434	0.56
435	0.53
436	0.49
437	0.5
438	0.45
439	0.43
440	0.41
441	0.38
442	0.41
443	0.44
444	0.44
445	0.41
446	0.43
447	0.47
448	0.48
449	0.48
450	0.47
451	0.45
452	0.42
453	0.4
454	0.38
455	0.35
456	0.28
457	0.24
458	0.17
459	0.15
460	0.13
461	0.13
462	0.12
463	0.09
464	0.07
465	0.08
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.1
477	0.1
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.1
484	0.09
485	0.1
486	0.12
487	0.11
488	0.14
489	0.15
490	0.17
491	0.2
492	0.21
493	0.23
494	0.24
495	0.27
496	0.26
497	0.3
498	0.28
499	0.25
500	0.26
501	0.27
502	0.29
503	0.27
504	0.26
505	0.25
506	0.27
507	0.27
508	0.24
509	0.26
510	0.28
511	0.33
512	0.35
513	0.32
514	0.29
515	0.3
516	0.3
517	0.27
518	0.24
519	0.2
520	0.22
521	0.22
522	0.24
523	0.23
524	0.23
525	0.25
526	0.22
527	0.23
528	0.2
529	0.23
530	0.25
531	0.31
532	0.33
533	0.29
534	0.31
535	0.29
536	0.28
537	0.25
538	0.26
539	0.23
540	0.21
541	0.22
542	0.22
543	0.2
544	0.2
545	0.2
546	0.14
547	0.1
548	0.11
549	0.1
550	0.12
551	0.19
552	0.22
553	0.23
554	0.23
555	0.26
556	0.26
557	0.27
558	0.23
559	0.16
560	0.19
561	0.19
562	0.23
563	0.2
564	0.21
565	0.21
566	0.24
567	0.23
568	0.21
569	0.2
570	0.21
571	0.25
572	0.28
573	0.28
574	0.27
575	0.27
576	0.25
577	0.25
578	0.22
579	0.19
580	0.15
581	0.22
582	0.22
583	0.24
584	0.23
585	0.24
586	0.23
587	0.24
588	0.22
589	0.16
590	0.15
591	0.15
592	0.17
593	0.2
594	0.21
595	0.22
596	0.26
597	0.26
598	0.32
599	0.3
600	0.29
601	0.32
602	0.36
603	0.4
604	0.44
605	0.43
606	0.38
607	0.39
608	0.38
609	0.35
610	0.36
611	0.35
612	0.28
613	0.26
614	0.24
615	0.23
616	0.22
617	0.22

M5G1S1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer