Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5G1H4

Protein Details
Accession M5G1H4    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-150IAKPVEEKEKKPKKKRTRVAPKRVGEVBasic
179-205ADAKEAPKKKKPARKPKPARRAKANGDBasic
228-252ESDEKATRVKKPRAPPRPRRPAGTDBasic
287-310IVSARIVRRRWPPRRSKGYGFVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-146EEKEKKPKKKRTRVAPKR
182-208KEAPKKKKPARKPKPARRAKANGDAAP
215-248AKAPATKAAQPAPESDEKATRVKKPRAPPRPRRP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, cyto 12.5, nucl 11, mito_nucl 7.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSEPTAAAPQLASAPKDAVPAPTDAVKPQENVEVKVNGANGAAVEEPAGPKVFAGNLAYITSEEGLRGFFKEFEADILHVNLVHRGPRPAGYAFVTFSALERAEVAVTALNDKELDGRKVAVQIAKPVEEKEKKPKKKRTRVAPKRVGEVTEEEAEGEGAAEPAPATHARIDVPETVAADAKEAPKKKKPARKPKPARRAKANGDAAPGEATEGAKAPATKAAQPAPESDEKATRVKKPRAPPRPRRPAGTDPVGTLSPNMLFVANLPFTVTDQTLAEMFTSAGINIVSARIVRRRWPPRRSKGYGFVDVGDEAAQKKGIEAVNGKQFEGREVAVKVAVNTQLEDAEKEEAAQEGSSPEATVLAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.22
4 0.22
5 0.19
6 0.19
7 0.2
8 0.2
9 0.22
10 0.23
11 0.22
12 0.27
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.32
17 0.3
18 0.32
19 0.35
20 0.31
21 0.29
22 0.31
23 0.29
24 0.21
25 0.19
26 0.16
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.1
39 0.09
40 0.11
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.15
71 0.15
72 0.17
73 0.18
74 0.2
75 0.23
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.2
81 0.19
82 0.18
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.18
107 0.2
108 0.18
109 0.16
110 0.2
111 0.22
112 0.23
113 0.23
114 0.22
115 0.29
116 0.31
117 0.35
118 0.4
119 0.49
120 0.57
121 0.67
122 0.77
123 0.79
124 0.85
125 0.9
126 0.9
127 0.91
128 0.92
129 0.93
130 0.92
131 0.84
132 0.78
133 0.7
134 0.6
135 0.5
136 0.42
137 0.33
138 0.24
139 0.21
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.1
144 0.08
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.15
170 0.18
171 0.22
172 0.27
173 0.37
174 0.44
175 0.53
176 0.61
177 0.68
178 0.75
179 0.82
180 0.87
181 0.89
182 0.92
183 0.92
184 0.88
185 0.86
186 0.84
187 0.79
188 0.77
189 0.72
190 0.62
191 0.54
192 0.47
193 0.38
194 0.3
195 0.23
196 0.13
197 0.08
198 0.07
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.1
206 0.11
207 0.13
208 0.16
209 0.18
210 0.2
211 0.21
212 0.22
213 0.22
214 0.24
215 0.24
216 0.22
217 0.23
218 0.23
219 0.29
220 0.31
221 0.34
222 0.41
223 0.47
224 0.53
225 0.6
226 0.68
227 0.73
228 0.8
229 0.84
230 0.85
231 0.89
232 0.85
233 0.81
234 0.78
235 0.75
236 0.71
237 0.67
238 0.57
239 0.47
240 0.46
241 0.4
242 0.32
243 0.24
244 0.18
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.13
258 0.12
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.09
278 0.14
279 0.17
280 0.23
281 0.34
282 0.44
283 0.54
284 0.64
285 0.72
286 0.78
287 0.86
288 0.87
289 0.85
290 0.84
291 0.81
292 0.78
293 0.68
294 0.58
295 0.5
296 0.42
297 0.34
298 0.25
299 0.18
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.1
304 0.1
305 0.15
306 0.15
307 0.18
308 0.21
309 0.26
310 0.34
311 0.35
312 0.35
313 0.33
314 0.32
315 0.3
316 0.29
317 0.24
318 0.19
319 0.19
320 0.2
321 0.2
322 0.21
323 0.19
324 0.2
325 0.23
326 0.19
327 0.19
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.17
333 0.16
334 0.15
335 0.15
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.11
341 0.09
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.09