FuNGI

M5G481

Protein Details

Accession

M5G481

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
69-90	GEMLRLRRLKREGKAANRNGHP	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cysk 13, cyto 7, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MKWEPTEDDEEHLPAPISGPEPVVAQAQNMSKLLQEVGEENDRRIAGMTEEERMAERDDLLQKFGGGVGEMLRLRRLKREGKAANRNGHPGHVDIQSPIPRTLRIAPLGVNKGNAMGIDTAVSMLPDDSPKSADAMEPPKTPVSRAELLEDLNRPRSAMRGSTAHSDTSSTIRRLRFADVTPSDIHVYPSQPTSPRAVHMLLAPPDDGAADGIPVTQLKFRSLRPETIHKRGDGPAVWLAQEQPSELSSSMDASMDMDALEEGTPEDIRHRFFPNEDAAQLGLEWITAPSATEQSSDAPRFDLQGMPIPRSLQTTLPTHLGLHHTSSSLAGYTLDDLLYLSRSTNAAQRATVLGVLAKIILRIRQGHISSDMLGPESRERILKSGIAALGEKGSVGARAVEVVWEAVVGGDESYMLQEGVELWGEEKRKVSSESQDDEPPSLIPGLDAISSIPLEEVLPLIQSYFTVPPSFPAVTLSQLLGILHRLTSHYEAHASAIIKAPHFLASILSAWLAYKPSDFPGESAQDPKLLQLLSVVAASSRSNGEALAVDVPNTLLRFIAQMPQTSQSVEERELRESLMAETLHFYATLGRYGLGCKVALIAQELMSLLVKYIAKTLSEGDITPSFARLAEAFFEVREIWTTCAIDPHKTSPPHELIWSQIEAFGWVDDLLQIAVHVPAEQDTVWAGLWSATAAYAEGAIINGVNKGQDERKKVLEGLRELTQDGNGRVAIDSALEDLQNCLDMYDGIGKPKYLESLGDVARSARLLGAAIRLSSSLITSATSTSDPLGLPGASISRLMDNLLNTTILHDALDITAPPGAYVHLRPLTTLLMNELKLSHRLGTMSMESWSTRALRILRHLLPGDEAYAHWIFQTFVAGAKDLADSMDIAIDDSIINQRCLEDVLPFYMHAIRPDHKYSVASFTSDPQSLPLWTRITLPSLAALHKPRTSTLKAPVGLPLKHDYLFQPLSDLLRSATTTAFESFPVSWNASETEVTRATLFGAEMYQTLLLETHPLEALRREEIVFGCMRVVMLEHGQPQGDSSEDVFRDAVVSGQMKRLLEPFLISPSSPALASYNISSTQEPSLEAAAKDYLGSGVPFYQFYTDLLALYEAISFADPVFSALLLPPLSMPYPPDYRQLFWGENSVAPRMVRTEVGGVPAEGLGEFLWPVEGSTEMLGRYVRALVDGTVGGFLRVVARHHVACSIWLSPAPVASDNPTPATHASPNTRSTPPEGGETRRRHLLLALLRSGKKQVVADILTYQPEVLCEGAPMTGREERLAWVRSWGGQDVVSRLDASLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.14
4	0.14
5	0.13
6	0.14
7	0.13
8	0.14
9	0.15
10	0.17
11	0.15
12	0.15
13	0.18
14	0.2
15	0.23
16	0.22
17	0.21
18	0.19
19	0.2
20	0.2
21	0.16
22	0.14
23	0.13
24	0.18
25	0.26
26	0.26
27	0.26
28	0.29
29	0.28
30	0.27
31	0.27
32	0.22
33	0.15
34	0.22
35	0.23
36	0.21
37	0.22
38	0.22
39	0.23
40	0.23
41	0.24
42	0.18
43	0.17
44	0.2
45	0.27
46	0.28
47	0.29
48	0.27
49	0.24
50	0.24
51	0.24
52	0.18
53	0.11
54	0.1
55	0.09
56	0.14
57	0.15
58	0.16
59	0.2
60	0.24
61	0.25
62	0.33
63	0.4
64	0.44
65	0.5
66	0.6
67	0.64
68	0.71
69	0.8
70	0.81
71	0.82
72	0.77
73	0.78
74	0.68
75	0.62
76	0.53
77	0.44
78	0.4
79	0.33
80	0.3
81	0.24
82	0.3
83	0.32
84	0.33
85	0.34
86	0.31
87	0.29
88	0.32
89	0.36
90	0.35
91	0.33
92	0.31
93	0.33
94	0.39
95	0.45
96	0.42
97	0.37
98	0.31
99	0.29
100	0.28
101	0.23
102	0.17
103	0.11
104	0.1
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.06
111	0.06
112	0.07
113	0.09
114	0.1
115	0.11
116	0.13
117	0.13
118	0.14
119	0.14
120	0.15
121	0.2
122	0.25
123	0.29
124	0.29
125	0.31
126	0.35
127	0.35
128	0.35
129	0.33
130	0.34
131	0.34
132	0.34
133	0.35
134	0.32
135	0.33
136	0.36
137	0.36
138	0.33
139	0.32
140	0.31
141	0.28
142	0.26
143	0.28
144	0.27
145	0.26
146	0.27
147	0.26
148	0.29
149	0.36
150	0.37
151	0.34
152	0.31
153	0.29
154	0.26
155	0.28
156	0.31
157	0.27
158	0.31
159	0.31
160	0.35
161	0.35
162	0.39
163	0.38
164	0.34
165	0.41
166	0.37
167	0.39
168	0.37
169	0.37
170	0.34
171	0.3
172	0.31
173	0.23
174	0.23
175	0.21
176	0.22
177	0.24
178	0.24
179	0.26
180	0.29
181	0.28
182	0.28
183	0.3
184	0.28
185	0.25
186	0.25
187	0.3
188	0.27
189	0.26
190	0.24
191	0.2
192	0.19
193	0.18
194	0.15
195	0.08
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.09
204	0.1
205	0.15
206	0.18
207	0.2
208	0.3
209	0.33
210	0.4
211	0.42
212	0.53
213	0.56
214	0.62
215	0.65
216	0.56
217	0.56
218	0.51
219	0.5
220	0.4
221	0.37
222	0.31
223	0.28
224	0.27
225	0.24
226	0.22
227	0.19
228	0.18
229	0.15
230	0.12
231	0.11
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.1
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.11
254	0.12
255	0.15
256	0.18
257	0.22
258	0.23
259	0.24
260	0.29
261	0.3
262	0.31
263	0.28
264	0.26
265	0.22
266	0.2
267	0.19
268	0.14
269	0.08
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.06
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.12
282	0.19
283	0.2
284	0.19
285	0.19
286	0.19
287	0.2
288	0.21
289	0.2
290	0.15
291	0.22
292	0.23
293	0.23
294	0.24
295	0.23
296	0.23
297	0.24
298	0.24
299	0.19
300	0.21
301	0.23
302	0.24
303	0.25
304	0.24
305	0.21
306	0.22
307	0.23
308	0.2
309	0.2
310	0.18
311	0.16
312	0.16
313	0.16
314	0.14
315	0.11
316	0.1
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.07
329	0.08
330	0.09
331	0.14
332	0.17
333	0.17
334	0.17
335	0.18
336	0.18
337	0.18
338	0.17
339	0.12
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.09
348	0.11
349	0.14
350	0.16
351	0.22
352	0.23
353	0.24
354	0.26
355	0.25
356	0.24
357	0.23
358	0.21
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.13
363	0.13
364	0.13
365	0.13
366	0.14
367	0.15
368	0.17
369	0.17
370	0.16
371	0.18
372	0.18
373	0.17
374	0.16
375	0.14
376	0.12
377	0.11
378	0.1
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.04
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.08
411	0.1
412	0.11
413	0.12
414	0.13
415	0.15
416	0.18
417	0.21
418	0.25
419	0.31
420	0.34
421	0.35
422	0.38
423	0.36
424	0.34
425	0.31
426	0.24
427	0.18
428	0.14
429	0.1
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.14
457	0.15
458	0.12
459	0.14
460	0.13
461	0.14
462	0.15
463	0.14
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.08
468	0.08
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.08
474	0.11
475	0.12
476	0.12
477	0.13
478	0.13
479	0.13
480	0.15
481	0.14
482	0.12
483	0.15
484	0.15
485	0.14
486	0.14
487	0.14
488	0.12
489	0.12
490	0.11
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.06
497	0.06
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.07
503	0.08
504	0.11
505	0.11
506	0.12
507	0.15
508	0.17
509	0.17
510	0.19
511	0.18
512	0.17
513	0.17
514	0.16
515	0.14
516	0.11
517	0.1
518	0.09
519	0.09
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.07
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.08
540	0.07
541	0.07
542	0.04
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.11
547	0.11
548	0.12
549	0.14
550	0.16
551	0.16
552	0.15
553	0.16
554	0.13
555	0.13
556	0.15
557	0.18
558	0.17
559	0.19
560	0.19
561	0.18
562	0.16
563	0.15
564	0.13
565	0.11
566	0.1
567	0.08
568	0.09
569	0.1
570	0.09
571	0.08
572	0.08
573	0.07
574	0.08
575	0.09
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.08
580	0.09
581	0.08
582	0.07
583	0.06
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.05
595	0.04
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.09
603	0.1
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.1
608	0.1
609	0.11
610	0.11
611	0.1
612	0.09
613	0.08
614	0.09
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.06
621	0.07
622	0.07
623	0.07
624	0.08
625	0.07
626	0.07
627	0.08
628	0.09
629	0.09
630	0.13
631	0.14
632	0.15
633	0.15
634	0.18
635	0.23
636	0.24
637	0.26
638	0.26
639	0.28
640	0.27
641	0.27
642	0.23
643	0.19
644	0.2
645	0.19
646	0.14
647	0.12
648	0.11
649	0.1
650	0.09
651	0.07
652	0.05
653	0.05
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.04
666	0.05
667	0.05
668	0.04
669	0.04
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.03
678	0.03
679	0.03
680	0.03
681	0.03
682	0.03
683	0.03
684	0.03
685	0.03
686	0.03
687	0.03
688	0.03
689	0.03
690	0.03
691	0.03
692	0.04
693	0.05
694	0.11
695	0.16
696	0.21
697	0.24
698	0.26
699	0.27
700	0.29
701	0.31
702	0.31
703	0.28
704	0.26
705	0.26
706	0.25
707	0.24
708	0.22
709	0.2
710	0.17
711	0.15
712	0.13
713	0.1
714	0.1
715	0.09
716	0.09
717	0.07
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.04
729	0.04
730	0.04
731	0.05
732	0.1
733	0.11
734	0.11
735	0.12
736	0.12
737	0.13
738	0.13
739	0.14
740	0.08
741	0.08
742	0.09
743	0.14
744	0.14
745	0.14
746	0.13
747	0.13
748	0.13
749	0.12
750	0.1
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.05
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.07
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.05
767	0.06
768	0.07
769	0.07
770	0.07
771	0.07
772	0.08
773	0.08
774	0.07
775	0.08
776	0.07
777	0.06
778	0.06
779	0.06
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.05
784	0.06
785	0.07
786	0.08
787	0.08
788	0.09
789	0.09
790	0.09
791	0.08
792	0.09
793	0.09
794	0.07
795	0.07
796	0.06
797	0.05
798	0.05
799	0.06
800	0.05
801	0.04
802	0.05
803	0.05
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.07
808	0.07
809	0.12
810	0.13
811	0.14
812	0.14
813	0.15
814	0.16
815	0.15
816	0.15
817	0.13
818	0.13
819	0.13
820	0.13
821	0.13
822	0.13
823	0.14
824	0.15
825	0.13
826	0.11
827	0.11
828	0.12
829	0.13
830	0.13
831	0.12
832	0.12
833	0.12
834	0.11
835	0.11
836	0.12
837	0.1
838	0.09
839	0.12
840	0.13
841	0.15
842	0.2
843	0.26
844	0.27
845	0.3
846	0.3
847	0.27
848	0.26
849	0.24
850	0.2
851	0.14
852	0.12
853	0.12
854	0.12
855	0.11
856	0.1
857	0.1
858	0.09
859	0.09
860	0.1
861	0.06
862	0.08
863	0.09
864	0.09
865	0.09
866	0.09
867	0.09
868	0.08
869	0.08
870	0.06
871	0.05
872	0.05
873	0.06
874	0.05
875	0.05
876	0.05
877	0.05
878	0.04
879	0.05
880	0.1
881	0.1
882	0.11
883	0.11
884	0.11
885	0.11
886	0.13
887	0.12
888	0.09
889	0.09
890	0.11
891	0.11
892	0.11
893	0.12
894	0.14
895	0.14
896	0.15
897	0.18
898	0.19
899	0.23
900	0.27
901	0.27
902	0.26
903	0.26
904	0.25
905	0.28
906	0.26
907	0.23
908	0.2
909	0.22
910	0.24
911	0.23
912	0.22
913	0.17
914	0.17
915	0.16
916	0.18
917	0.19
918	0.17
919	0.17
920	0.2
921	0.19
922	0.21
923	0.2
924	0.18
925	0.17
926	0.17
927	0.17
928	0.19
929	0.22
930	0.24
931	0.25
932	0.26
933	0.26
934	0.3
935	0.33
936	0.33
937	0.38
938	0.41
939	0.4
940	0.39
941	0.43
942	0.43
943	0.39
944	0.37
945	0.33
946	0.28
947	0.27
948	0.28
949	0.22
950	0.24
951	0.25
952	0.21
953	0.19
954	0.18
955	0.19
956	0.18
957	0.18
958	0.11
959	0.11
960	0.12
961	0.11
962	0.1
963	0.1
964	0.11
965	0.13
966	0.12
967	0.11
968	0.13
969	0.13
970	0.14
971	0.16
972	0.16
973	0.14
974	0.15
975	0.16
976	0.15
977	0.15
978	0.14
979	0.16
980	0.16
981	0.16
982	0.15
983	0.14
984	0.13
985	0.13
986	0.12
987	0.07
988	0.07
989	0.07
990	0.07
991	0.08
992	0.07
993	0.06
994	0.06
995	0.06
996	0.06
997	0.07
998	0.07
999	0.08
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.1
1003	0.13
1004	0.15
1005	0.15
1006	0.16
1007	0.15
1008	0.16
1009	0.17
1010	0.19
1011	0.16
1012	0.14
1013	0.13
1014	0.12
1015	0.11
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.08
1019	0.09
1020	0.11
1021	0.13
1022	0.14
1023	0.14
1024	0.14
1025	0.14
1026	0.13
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.1
1030	0.15
1031	0.15
1032	0.16
1033	0.15
1034	0.14
1035	0.14
1036	0.13
1037	0.12
1038	0.1
1039	0.12
1040	0.12
1041	0.16
1042	0.19
1043	0.18
1044	0.19
1045	0.21
1046	0.2
1047	0.18
1048	0.18
1049	0.16
1050	0.18
1051	0.18
1052	0.17
1053	0.16
1054	0.15
1055	0.16
1056	0.14
1057	0.13
1058	0.1
1059	0.11
1060	0.12
1061	0.12
1062	0.13
1063	0.13
1064	0.16
1065	0.15
1066	0.16
1067	0.17
1068	0.16
1069	0.16
1070	0.15
1071	0.16
1072	0.17
1073	0.16
1074	0.16
1075	0.14
1076	0.14
1077	0.13
1078	0.12
1079	0.1
1080	0.08
1081	0.08
1082	0.07
1083	0.09
1084	0.1
1085	0.1
1086	0.11
1087	0.12
1088	0.12
1089	0.12
1090	0.16
1091	0.14
1092	0.14
1093	0.14
1094	0.14
1095	0.12
1096	0.12
1097	0.11
1098	0.06
1099	0.06
1100	0.06
1101	0.06
1102	0.05
1103	0.06
1104	0.05
1105	0.06
1106	0.07
1107	0.06
1108	0.06
1109	0.07
1110	0.1
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.09
1114	0.1
1115	0.11
1116	0.11
1117	0.13
1118	0.15
1119	0.21
1120	0.23
1121	0.3
1122	0.32
1123	0.33
1124	0.37
1125	0.41
1126	0.38
1127	0.33
1128	0.36
1129	0.3
1130	0.3
1131	0.31
1132	0.28
1133	0.24
1134	0.22
1135	0.22
1136	0.19
1137	0.19
1138	0.17
1139	0.16
1140	0.19
1141	0.18
1142	0.21
1143	0.2
1144	0.18
1145	0.16
1146	0.16
1147	0.14
1148	0.1
1149	0.09
1150	0.06
1151	0.06
1152	0.05
1153	0.05
1154	0.06
1155	0.05
1156	0.06
1157	0.06
1158	0.07
1159	0.07
1160	0.08
1161	0.1
1162	0.09
1163	0.1
1164	0.11
1165	0.1
1166	0.11
1167	0.11
1168	0.1
1169	0.1
1170	0.11
1171	0.1
1172	0.12
1173	0.12
1174	0.11
1175	0.11
1176	0.11
1177	0.1
1178	0.09
1179	0.09
1180	0.1
1181	0.11
1182	0.12
1183	0.16
1184	0.2
1185	0.21
1186	0.22
1187	0.25
1188	0.22
1189	0.23
1190	0.24
1191	0.2
1192	0.18
1193	0.17
1194	0.18
1195	0.16
1196	0.18
1197	0.18
1198	0.17
1199	0.17
1200	0.19
1201	0.23
1202	0.23
1203	0.25
1204	0.24
1205	0.24
1206	0.24
1207	0.27
1208	0.27
1209	0.29
1210	0.35
1211	0.37
1212	0.42
1213	0.45
1214	0.46
1215	0.44
1216	0.45
1217	0.45
1218	0.39
1219	0.42
1220	0.42
1221	0.45
1222	0.52
1223	0.56
1224	0.55
1225	0.56
1226	0.55
1227	0.47
1228	0.45
1229	0.46
1230	0.44
1231	0.45
1232	0.46
1233	0.46
1234	0.47
1235	0.48
1236	0.49
1237	0.43
1238	0.39
1239	0.33
1240	0.3
1241	0.31
1242	0.31
1243	0.31
1244	0.31
1245	0.31
1246	0.29
1247	0.28
1248	0.24
1249	0.16
1250	0.15
1251	0.15
1252	0.12
1253	0.1
1254	0.09
1255	0.09
1256	0.11
1257	0.12
1258	0.13
1259	0.16
1260	0.19
1261	0.2
1262	0.2
1263	0.21
1264	0.23
1265	0.28
1266	0.3
1267	0.26
1268	0.27
1269	0.28
1270	0.3
1271	0.33
1272	0.31
1273	0.25
1274	0.25
1275	0.27
1276	0.25
1277	0.25
1278	0.22
1279	0.19

M5G481

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer