Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5GGQ5

Protein Details
Accession M5GGQ5    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-266DEDLWRQATKRRKMEKRDVEHGLBasic
293-321GKLQGRKVKALKEERTKRRKVDHDEEEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-271KRRKMEKRDVEHGLGKKRK
296-312QGRKVKALKEERTKRRK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRVVKPKNARSKRAMLAREPQEVEPPKTCIFVKGTSTGERLNGVLKDLMSLKRPNAVSFSKKNAVHPFESTDSFTFWSQKNDASLFLVGTHSKKRPHDLTFIRMYDYRVLEMLELGVEAYTPMSAFSGRKPPPGHRPLMTFDSPLFDTHPRFQQVKSLLLDLFNGAEIDAICLAGLEHVVQVSLAPPPPGFTNESTSSAELPLIHVRCYAMRFLASGQRTPRVELEPIGPSLDVSLRRSSPADEDLWRQATKRRKMEKRDVEHGLGKKRKNLAVDEGGDLIGRVHVGKQDLGKLQGRKVKALKEERTKRRKVDHDEEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.75
3 0.7
4 0.71
5 0.69
6 0.68
7 0.63
8 0.55
9 0.55
10 0.55
11 0.53
12 0.47
13 0.45
14 0.39
15 0.39
16 0.38
17 0.34
18 0.32
19 0.32
20 0.32
21 0.32
22 0.35
23 0.35
24 0.37
25 0.34
26 0.31
27 0.28
28 0.24
29 0.23
30 0.2
31 0.19
32 0.18
33 0.16
34 0.17
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.24
39 0.23
40 0.28
41 0.29
42 0.29
43 0.31
44 0.35
45 0.38
46 0.4
47 0.47
48 0.48
49 0.49
50 0.54
51 0.57
52 0.56
53 0.51
54 0.48
55 0.45
56 0.41
57 0.41
58 0.37
59 0.29
60 0.26
61 0.25
62 0.23
63 0.22
64 0.2
65 0.23
66 0.21
67 0.23
68 0.24
69 0.23
70 0.23
71 0.21
72 0.2
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.15
78 0.19
79 0.21
80 0.27
81 0.3
82 0.36
83 0.41
84 0.44
85 0.51
86 0.5
87 0.52
88 0.53
89 0.51
90 0.46
91 0.41
92 0.39
93 0.34
94 0.3
95 0.24
96 0.17
97 0.17
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.05
113 0.05
114 0.08
115 0.18
116 0.19
117 0.25
118 0.27
119 0.32
120 0.41
121 0.46
122 0.48
123 0.4
124 0.43
125 0.41
126 0.44
127 0.4
128 0.31
129 0.25
130 0.23
131 0.22
132 0.19
133 0.17
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.21
138 0.22
139 0.23
140 0.22
141 0.26
142 0.26
143 0.28
144 0.27
145 0.24
146 0.21
147 0.2
148 0.2
149 0.14
150 0.11
151 0.07
152 0.06
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.1
178 0.12
179 0.12
180 0.17
181 0.19
182 0.23
183 0.23
184 0.23
185 0.22
186 0.19
187 0.18
188 0.13
189 0.13
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.15
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.18
203 0.18
204 0.2
205 0.22
206 0.27
207 0.28
208 0.29
209 0.3
210 0.27
211 0.26
212 0.24
213 0.25
214 0.21
215 0.21
216 0.2
217 0.17
218 0.13
219 0.13
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.17
224 0.17
225 0.19
226 0.2
227 0.21
228 0.21
229 0.22
230 0.22
231 0.21
232 0.24
233 0.28
234 0.31
235 0.3
236 0.27
237 0.31
238 0.38
239 0.45
240 0.51
241 0.57
242 0.63
243 0.72
244 0.82
245 0.86
246 0.85
247 0.83
248 0.79
249 0.73
250 0.71
251 0.68
252 0.67
253 0.64
254 0.58
255 0.57
256 0.58
257 0.56
258 0.53
259 0.51
260 0.49
261 0.49
262 0.48
263 0.43
264 0.38
265 0.34
266 0.29
267 0.25
268 0.17
269 0.1
270 0.08
271 0.06
272 0.07
273 0.09
274 0.12
275 0.14
276 0.17
277 0.23
278 0.25
279 0.3
280 0.36
281 0.37
282 0.42
283 0.45
284 0.45
285 0.47
286 0.5
287 0.52
288 0.55
289 0.62
290 0.65
291 0.7
292 0.78
293 0.81
294 0.86
295 0.87
296 0.86
297 0.86
298 0.86
299 0.85
300 0.85
301 0.84