FuNGI

M5GDM1

Protein Details

Accession

M5GDM1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-103	AKEAAASARKERRHKKKTQDGELSQRRHE	Basic
1060-1095	DDDEKPAKQTKKNADKENNKGKQKRKLDDIKAEDAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
72-91	KARAKEAAASARKERRHKKK
148-164	KKMKGRKAAAVEHRHRK
1069-1085	TKKNADKENNKGKQKRK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002464 DNA/RNA_helicase_DEAH_CS IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR009057 Homeobox-like_sf IPR015194 ISWI_HAND-dom IPR036306 ISWI_HAND-dom_sf IPR027417 P-loop_NTPase IPR001005 SANT/Myb IPR017884 SANT_dom IPR015195 SLIDE IPR038718 SNF2-like_sf IPR000330 SNF2_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0140658 F:ATP-dependent chromatin remodeler activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0031491 F:nucleosome binding
Pfam	View protein in Pfam PF09110 HAND PF00271 Helicase_C PF09111 SLIDE PF00176 SNF2-rel_dom
PROSITE	View protein in PROSITE PS00690 DEAH_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51293 SANT
CDD	cd00167 SANT cd18793 SF2_C_SNF

Amino Acid Sequences

MTQTPTLSAIPQHMLQVPDDDPGILSDVMPSAEPSRPASSAPETESDLEESDMDMDDPYEPNGVMQTPQSAKARAKEAAASARKERRHKKKTQDGELSQRRHELDKQKVATAMKRYSYLLGQTELFQHFMDAKKARDPAYNDIIEPEKKMKGRKAAAVEHRHRKSEKEEDEELLKENEKEDEEDEAIVFESSPPYVTGGTLRDYQVQGLNWMVDLYHHGLNGILADEMGLGKTLQTVSFLGYLKYYRNKGGPHLVVVPKSTLDNWAREFGKWIPDFNVVVLQGTREERAQIIQERLLPQKFEVCVTSYEMCLRETSSLRKLSFGYIIIDEAHRIKNINSILSRIVRELASEGRLLITGTPLQNNLQELFSLLNFICPEIFTDYEDLESFLHKDIGGGGDVEMDDDEKNMRVVRALHKILRPFLLRRVKSDVEKSLLPKKETNLYVGLTEMQRKLYRSVLEKDIEAVRGMTGKKEGKTRLMNIVMQLRKVTCHPYLFDGVEPGPPYTTDVHLVENAGKMVILDKLLQAMKAKGSRVLIFSQMSRMLDILEDYCMFRGFQYCRIDGGTAHEDRIAAIDEYNKEGSEKFVFLLTTRAGGLGINLTTADVVILYDSDWNPQADLQAMDRAHRIGQTKQVYVYRFITEGSVEERMLERAAQKLRLDQLVIQQQRGAAQQQKAASKDELLEMIHHGAEKIANSTDDMMVNEDIDAIIARGEMMTAELQSKYDSLNLDELTNFKTESTVQTWEGENFEGRKFAQMSLSWLEPEKRARKANYSIDQYYKETMRAGPVAPPKPKMPRAPKQVAINDYQFFPPRLAELYEKESNYFRKTQDYKVPFPEPENEEDTLEDREARRAKEQEIIDNAVPLTEEENAEKDELSTHGFQNWQRRDYQAFIRGSADFGKDSWEEIVNEIGKDKTVQDVQEYAKVFWARIDELEDKERILQRIEEGEQKREKTRSTQEILDHKVKQYSYPMQELELHYNVTKGKVWSEEEDRYLLVRLQHYKLSRDDVFDLIKKDISQFPQFRFDWFMKSRTSAEISRRCTTLLNMLRREVGEVADDDDDEKPAKQTKKNADKENNKGKQKRKLDDIKAEDAPPSHASPAPVQSNGIVAKKSKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.24
3	0.26
4	0.23
5	0.21
6	0.2
7	0.17
8	0.14
9	0.13
10	0.16
11	0.12
12	0.11
13	0.1
14	0.11
15	0.11
16	0.11
17	0.12
18	0.12
19	0.15
20	0.17
21	0.21
22	0.24
23	0.24
24	0.25
25	0.29
26	0.32
27	0.33
28	0.34
29	0.32
30	0.31
31	0.32
32	0.33
33	0.29
34	0.24
35	0.21
36	0.18
37	0.15
38	0.13
39	0.12
40	0.1
41	0.09
42	0.08
43	0.09
44	0.1
45	0.1
46	0.11
47	0.1
48	0.1
49	0.12
50	0.12
51	0.11
52	0.12
53	0.18
54	0.19
55	0.25
56	0.28
57	0.32
58	0.35
59	0.39
60	0.44
61	0.39
62	0.39
63	0.37
64	0.39
65	0.44
66	0.46
67	0.45
68	0.48
69	0.54
70	0.6
71	0.67
72	0.72
73	0.73
74	0.77
75	0.83
76	0.85
77	0.88
78	0.91
79	0.91
80	0.91
81	0.88
82	0.89
83	0.88
84	0.82
85	0.74
86	0.68
87	0.59
88	0.53
89	0.54
90	0.53
91	0.53
92	0.58
93	0.58
94	0.56
95	0.59
96	0.58
97	0.56
98	0.55
99	0.51
100	0.43
101	0.43
102	0.41
103	0.39
104	0.38
105	0.36
106	0.3
107	0.26
108	0.25
109	0.24
110	0.27
111	0.26
112	0.24
113	0.19
114	0.18
115	0.19
116	0.2
117	0.27
118	0.25
119	0.26
120	0.31
121	0.35
122	0.37
123	0.4
124	0.43
125	0.43
126	0.47
127	0.46
128	0.4
129	0.39
130	0.42
131	0.36
132	0.34
133	0.31
134	0.29
135	0.32
136	0.38
137	0.42
138	0.47
139	0.52
140	0.56
141	0.59
142	0.63
143	0.68
144	0.72
145	0.75
146	0.76
147	0.74
148	0.74
149	0.68
150	0.63
151	0.61
152	0.61
153	0.59
154	0.56
155	0.55
156	0.51
157	0.53
158	0.5
159	0.44
160	0.35
161	0.3
162	0.23
163	0.2
164	0.2
165	0.18
166	0.18
167	0.17
168	0.19
169	0.18
170	0.18
171	0.17
172	0.14
173	0.13
174	0.11
175	0.1
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.11
185	0.12
186	0.15
187	0.18
188	0.18
189	0.21
190	0.21
191	0.23
192	0.23
193	0.22
194	0.21
195	0.19
196	0.17
197	0.13
198	0.13
199	0.11
200	0.07
201	0.1
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.12
209	0.1
210	0.06
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.08
223	0.08
224	0.09
225	0.14
226	0.14
227	0.13
228	0.14
229	0.16
230	0.19
231	0.25
232	0.26
233	0.26
234	0.3
235	0.32
236	0.36
237	0.44
238	0.41
239	0.37
240	0.42
241	0.42
242	0.38
243	0.37
244	0.33
245	0.24
246	0.24
247	0.21
248	0.21
249	0.2
250	0.23
251	0.24
252	0.29
253	0.3
254	0.29
255	0.32
256	0.27
257	0.33
258	0.3
259	0.29
260	0.26
261	0.28
262	0.29
263	0.25
264	0.27
265	0.18
266	0.18
267	0.16
268	0.13
269	0.12
270	0.13
271	0.14
272	0.11
273	0.12
274	0.11
275	0.13
276	0.17
277	0.19
278	0.2
279	0.21
280	0.24
281	0.27
282	0.32
283	0.32
284	0.28
285	0.24
286	0.27
287	0.25
288	0.23
289	0.21
290	0.18
291	0.18
292	0.21
293	0.21
294	0.17
295	0.19
296	0.19
297	0.18
298	0.16
299	0.16
300	0.15
301	0.17
302	0.22
303	0.25
304	0.31
305	0.3
306	0.32
307	0.32
308	0.3
309	0.29
310	0.25
311	0.21
312	0.15
313	0.16
314	0.15
315	0.14
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.17
323	0.18
324	0.21
325	0.2
326	0.2
327	0.23
328	0.25
329	0.26
330	0.21
331	0.21
332	0.16
333	0.16
334	0.16
335	0.14
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.1
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.14
350	0.15
351	0.14
352	0.12
353	0.11
354	0.1
355	0.1
356	0.09
357	0.1
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.1
366	0.11
367	0.1
368	0.11
369	0.11
370	0.12
371	0.12
372	0.11
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.08
377	0.09
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.12
399	0.17
400	0.24
401	0.27
402	0.31
403	0.33
404	0.36
405	0.36
406	0.37
407	0.34
408	0.28
409	0.35
410	0.4
411	0.38
412	0.39
413	0.44
414	0.43
415	0.44
416	0.47
417	0.41
418	0.34
419	0.36
420	0.36
421	0.37
422	0.38
423	0.37
424	0.34
425	0.33
426	0.37
427	0.35
428	0.34
429	0.28
430	0.24
431	0.22
432	0.2
433	0.2
434	0.14
435	0.16
436	0.14
437	0.15
438	0.16
439	0.17
440	0.18
441	0.2
442	0.23
443	0.25
444	0.28
445	0.3
446	0.29
447	0.28
448	0.28
449	0.26
450	0.23
451	0.18
452	0.14
453	0.09
454	0.11
455	0.12
456	0.1
457	0.14
458	0.17
459	0.19
460	0.24
461	0.26
462	0.3
463	0.34
464	0.36
465	0.38
466	0.37
467	0.36
468	0.33
469	0.38
470	0.32
471	0.29
472	0.27
473	0.2
474	0.18
475	0.19
476	0.21
477	0.16
478	0.17
479	0.17
480	0.19
481	0.22
482	0.21
483	0.2
484	0.17
485	0.15
486	0.15
487	0.14
488	0.12
489	0.09
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.1
494	0.11
495	0.11
496	0.12
497	0.12
498	0.12
499	0.11
500	0.1
501	0.1
502	0.07
503	0.06
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.08
511	0.08
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.12
516	0.14
517	0.14
518	0.14
519	0.16
520	0.16
521	0.17
522	0.18
523	0.17
524	0.16
525	0.16
526	0.15
527	0.15
528	0.14
529	0.12
530	0.11
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.06
535	0.05
536	0.06
537	0.05
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.1
543	0.1
544	0.17
545	0.2
546	0.2
547	0.21
548	0.21
549	0.22
550	0.17
551	0.21
552	0.19
553	0.16
554	0.15
555	0.15
556	0.14
557	0.14
558	0.14
559	0.1
560	0.06
561	0.06
562	0.08
563	0.08
564	0.1
565	0.11
566	0.1
567	0.09
568	0.09
569	0.11
570	0.1
571	0.1
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.11
577	0.09
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.07
582	0.07
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.04
591	0.03
592	0.02
593	0.02
594	0.02
595	0.02
596	0.03
597	0.05
598	0.05
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.08
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.08
607	0.08
608	0.11
609	0.11
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.12
614	0.14
615	0.16
616	0.13
617	0.22
618	0.24
619	0.24
620	0.27
621	0.3
622	0.28
623	0.29
624	0.3
625	0.23
626	0.19
627	0.19
628	0.16
629	0.13
630	0.12
631	0.11
632	0.1
633	0.09
634	0.09
635	0.09
636	0.1
637	0.1
638	0.1
639	0.08
640	0.12
641	0.15
642	0.17
643	0.17
644	0.19
645	0.21
646	0.21
647	0.21
648	0.17
649	0.21
650	0.27
651	0.27
652	0.25
653	0.23
654	0.22
655	0.23
656	0.23
657	0.21
658	0.17
659	0.18
660	0.21
661	0.24
662	0.27
663	0.27
664	0.29
665	0.26
666	0.21
667	0.2
668	0.18
669	0.15
670	0.12
671	0.11
672	0.1
673	0.1
674	0.09
675	0.08
676	0.07
677	0.07
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.08
684	0.09
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.1
689	0.09
690	0.09
691	0.09
692	0.07
693	0.06
694	0.05
695	0.05
696	0.03
697	0.03
698	0.03
699	0.03
700	0.03
701	0.03
702	0.03
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.06
707	0.06
708	0.07
709	0.07
710	0.08
711	0.07
712	0.09
713	0.09
714	0.1
715	0.12
716	0.13
717	0.13
718	0.13
719	0.13
720	0.13
721	0.13
722	0.12
723	0.08
724	0.09
725	0.09
726	0.12
727	0.14
728	0.16
729	0.16
730	0.18
731	0.19
732	0.19
733	0.19
734	0.17
735	0.15
736	0.14
737	0.14
738	0.13
739	0.12
740	0.16
741	0.16
742	0.16
743	0.17
744	0.16
745	0.2
746	0.2
747	0.21
748	0.18
749	0.18
750	0.19
751	0.18
752	0.26
753	0.28
754	0.32
755	0.37
756	0.4
757	0.45
758	0.52
759	0.59
760	0.58
761	0.59
762	0.56
763	0.54
764	0.54
765	0.49
766	0.44
767	0.35
768	0.29
769	0.23
770	0.2
771	0.2
772	0.18
773	0.17
774	0.2
775	0.27
776	0.33
777	0.34
778	0.36
779	0.38
780	0.45
781	0.51
782	0.55
783	0.57
784	0.6
785	0.66
786	0.71
787	0.71
788	0.71
789	0.71
790	0.64
791	0.59
792	0.53
793	0.44
794	0.39
795	0.35
796	0.29
797	0.24
798	0.22
799	0.17
800	0.15
801	0.15
802	0.16
803	0.17
804	0.18
805	0.24
806	0.28
807	0.28
808	0.28
809	0.3
810	0.32
811	0.33
812	0.34
813	0.28
814	0.34
815	0.38
816	0.43
817	0.49
818	0.52
819	0.53
820	0.56
821	0.59
822	0.5
823	0.49
824	0.5
825	0.43
826	0.4
827	0.39
828	0.33
829	0.29
830	0.28
831	0.27
832	0.21
833	0.19
834	0.17
835	0.14
836	0.2
837	0.24
838	0.25
839	0.3
840	0.32
841	0.33
842	0.38
843	0.39
844	0.38
845	0.38
846	0.4
847	0.34
848	0.32
849	0.29
850	0.22
851	0.2
852	0.14
853	0.11
854	0.08
855	0.09
856	0.09
857	0.11
858	0.12
859	0.12
860	0.11
861	0.1
862	0.1
863	0.11
864	0.13
865	0.14
866	0.14
867	0.16
868	0.2
869	0.23
870	0.32
871	0.37
872	0.36
873	0.35
874	0.38
875	0.4
876	0.41
877	0.45
878	0.43
879	0.38
880	0.37
881	0.38
882	0.34
883	0.32
884	0.3
885	0.24
886	0.16
887	0.15
888	0.17
889	0.15
890	0.16
891	0.16
892	0.16
893	0.15
894	0.15
895	0.2
896	0.18
897	0.17
898	0.18
899	0.16
900	0.14
901	0.15
902	0.14
903	0.15
904	0.16
905	0.17
906	0.18
907	0.23
908	0.24
909	0.29
910	0.3
911	0.26
912	0.28
913	0.28
914	0.25
915	0.22
916	0.23
917	0.19
918	0.18
919	0.23
920	0.21
921	0.24
922	0.28
923	0.27
924	0.24
925	0.28
926	0.32
927	0.28
928	0.27
929	0.24
930	0.23
931	0.28
932	0.3
933	0.33
934	0.32
935	0.39
936	0.43
937	0.45
938	0.48
939	0.47
940	0.48
941	0.47
942	0.54
943	0.55
944	0.54
945	0.56
946	0.57
947	0.61
948	0.65
949	0.64
950	0.57
951	0.51
952	0.51
953	0.46
954	0.41
955	0.41
956	0.42
957	0.4
958	0.43
959	0.41
960	0.38
961	0.43
962	0.43
963	0.42
964	0.34
965	0.31
966	0.26
967	0.27
968	0.26
969	0.23
970	0.23
971	0.19
972	0.2
973	0.23
974	0.27
975	0.3
976	0.36
977	0.38
978	0.37
979	0.37
980	0.34
981	0.3
982	0.28
983	0.25
984	0.22
985	0.25
986	0.28
987	0.3
988	0.35
989	0.37
990	0.4
991	0.42
992	0.45
993	0.41
994	0.39
995	0.39
996	0.36
997	0.38
998	0.38
999	0.37
1000	0.31
1001	0.31
1002	0.27
1003	0.28
1004	0.31
1005	0.31
1006	0.37
1007	0.4
1008	0.42
1009	0.49
1010	0.49
1011	0.48
1012	0.48
1013	0.44
1014	0.43
1015	0.41
1016	0.41
1017	0.36
1018	0.39
1019	0.39
1020	0.37
1021	0.41
1022	0.38
1023	0.44
1024	0.49
1025	0.53
1026	0.53
1027	0.51
1028	0.47
1029	0.44
1030	0.41
1031	0.41
1032	0.41
1033	0.44
1034	0.43
1035	0.45
1036	0.46
1037	0.45
1038	0.45
1039	0.35
1040	0.27
1041	0.2
1042	0.18
1043	0.18
1044	0.16
1045	0.16
1046	0.15
1047	0.15
1048	0.15
1049	0.14
1050	0.14
1051	0.15
1052	0.23
1053	0.3
1054	0.35
1055	0.44
1056	0.54
1057	0.64
1058	0.72
1059	0.79
1060	0.82
1061	0.85
1062	0.89
1063	0.91
1064	0.89
1065	0.89
1066	0.88
1067	0.87
1068	0.87
1069	0.87
1070	0.84
1071	0.84
1072	0.85
1073	0.84
1074	0.86
1075	0.84
1076	0.8
1077	0.74
1078	0.67
1079	0.59
1080	0.49
1081	0.43
1082	0.36
1083	0.31
1084	0.27
1085	0.25
1086	0.26
1087	0.28
1088	0.35
1089	0.35
1090	0.32
1091	0.31
1092	0.29
1093	0.31
1094	0.33
1095	0.32
1096	0.27

M5GDM1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer