Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7F1I6

Protein Details
Accession A7F1I6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-48SILDEQRPPKRIKKNHEELKRELEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
511-561QRGRGQNGRGGAQRGGGPQQRGGTQQRGGRGGSGPPRASHNPGHMGRGGRP
Subcellular Location(s) cysk 11, cyto 9, nucl 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0055087  C:Ski complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
KEGG ssl:SS1G_11456  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MAEGLVAALAELNLKSHDDDWIDSILDEQRPPKRIKKNHEELKRELEQKYLTPSTTFSTEWLNKLQQRWDSPPNYTDLFQLAPTQTRTITRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSFLRKPANRADFVRGAAGFFPFAPGGLDAVEAAAALEEQVGRVDNTVPQKKSLERIINFGGEDGLLSIPPGFTRGLKFEKKEEVDEKEAEDVKNVLEEEPAEEVSTNGADGAMKDEASSESSDDDEEDDIDSMLPVEFPALEPHGALATSSTKRGGREWAHMVDVKRDIPNFRELVPDMARDWPFELDTFQKEAVYHLESGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQVFDEVGILTGDVQINAEASCLIMTTEILRKRGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLEHYLWADKGVHKIVDADKKFIEKGWKSANDVLSGRDKTKALPAPEPTNARGGGNQRGRGQNGRGGAQRGGGPQQRGGTQQRGGRGGSGPPRASHNPGHMGRGGRPGGRTTAAQDKTLWVHLVQYLKKENLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTATEKSAIHMTIEKSIARLKPEDRLLPQIVRLRDLLGRGIAVHHGGLLPIVKEIVEMLFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGQSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVAPGGGEAPPVTELRQMILGEPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKVSEADLAKIQREPCNICEQDLDACHEAIQAYKQITLDIHIGSLATAIGRRMFVKGRLVVYHKDGVRTPGILLRDGAIDINGLSLHVLEIRTRRDQWDTTDLLPFVPKFRGMFTKLPLFKKHITTKTCYVFVNDLECVTDTIVKGVIPDIFQSGEVYENAKQKVFGLCSSWESDVWDELDWSKIKVLQLRENLVKRVQQATIAQNAICLSCPSFLKHFAMCHDQWLIQANIIQLRQLMSDNNLQLLPDYEQRIQVLKDLDFIDDSSRVQLKGKVACEIHSADELILTELILDNVLSAYTPEEIVSLLSAFIFQEKTTVVPTLPSSLELGKVKILELSKKITDMQLLHQVIQPSSESNDFEAHPERFGLMEVVYEWARGMSFKNITELTDVLEGTIVRVITRLDETCREVRNAARIIGDPELFQKMQTCQEIIKRDVTAVASLYPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.12
4 0.16
5 0.16
6 0.18
7 0.2
8 0.21
9 0.2
10 0.18
11 0.2
12 0.2
13 0.21
14 0.22
15 0.26
16 0.31
17 0.37
18 0.43
19 0.51
20 0.57
21 0.64
22 0.73
23 0.77
24 0.81
25 0.85
26 0.89
27 0.87
28 0.83
29 0.82
30 0.8
31 0.74
32 0.64
33 0.6
34 0.53
35 0.49
36 0.51
37 0.45
38 0.38
39 0.33
40 0.34
41 0.32
42 0.32
43 0.29
44 0.22
45 0.28
46 0.3
47 0.33
48 0.37
49 0.4
50 0.42
51 0.46
52 0.52
53 0.49
54 0.52
55 0.57
56 0.61
57 0.58
58 0.58
59 0.55
60 0.53
61 0.48
62 0.42
63 0.36
64 0.29
65 0.26
66 0.22
67 0.24
68 0.22
69 0.23
70 0.25
71 0.25
72 0.25
73 0.29
74 0.3
75 0.32
76 0.36
77 0.38
78 0.39
79 0.39
80 0.43
81 0.41
82 0.42
83 0.4
84 0.38
85 0.33
86 0.31
87 0.34
88 0.29
89 0.26
90 0.24
91 0.21
92 0.17
93 0.19
94 0.2
95 0.16
96 0.17
97 0.16
98 0.2
99 0.2
100 0.2
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.21
106 0.21
107 0.27
108 0.28
109 0.33
110 0.41
111 0.43
112 0.49
113 0.57
114 0.61
115 0.59
116 0.6
117 0.61
118 0.54
119 0.51
120 0.49
121 0.38
122 0.32
123 0.27
124 0.24
125 0.18
126 0.14
127 0.14
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.08
150 0.09
151 0.13
152 0.23
153 0.31
154 0.32
155 0.34
156 0.38
157 0.4
158 0.45
159 0.49
160 0.5
161 0.43
162 0.47
163 0.48
164 0.46
165 0.43
166 0.37
167 0.28
168 0.18
169 0.17
170 0.12
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.07
179 0.09
180 0.12
181 0.18
182 0.26
183 0.33
184 0.36
185 0.4
186 0.48
187 0.49
188 0.53
189 0.53
190 0.52
191 0.5
192 0.48
193 0.44
194 0.41
195 0.41
196 0.34
197 0.29
198 0.23
199 0.18
200 0.2
201 0.19
202 0.13
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.08
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.12
225 0.12
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.17
259 0.19
260 0.21
261 0.23
262 0.3
263 0.28
264 0.33
265 0.38
266 0.37
267 0.38
268 0.41
269 0.4
270 0.36
271 0.35
272 0.31
273 0.28
274 0.28
275 0.27
276 0.26
277 0.32
278 0.28
279 0.26
280 0.28
281 0.25
282 0.29
283 0.28
284 0.26
285 0.22
286 0.26
287 0.26
288 0.22
289 0.23
290 0.19
291 0.18
292 0.17
293 0.17
294 0.15
295 0.17
296 0.19
297 0.18
298 0.17
299 0.17
300 0.18
301 0.19
302 0.18
303 0.15
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.13
308 0.12
309 0.08
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.11
340 0.18
341 0.19
342 0.21
343 0.23
344 0.26
345 0.26
346 0.3
347 0.38
348 0.38
349 0.47
350 0.47
351 0.52
352 0.53
353 0.55
354 0.61
355 0.52
356 0.45
357 0.42
358 0.41
359 0.34
360 0.3
361 0.29
362 0.17
363 0.17
364 0.15
365 0.08
366 0.06
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.04
382 0.06
383 0.12
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.18
389 0.23
390 0.23
391 0.19
392 0.18
393 0.17
394 0.18
395 0.18
396 0.16
397 0.11
398 0.09
399 0.07
400 0.06
401 0.04
402 0.04
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.16
423 0.22
424 0.27
425 0.3
426 0.34
427 0.38
428 0.4
429 0.46
430 0.42
431 0.42
432 0.47
433 0.53
434 0.52
435 0.52
436 0.5
437 0.46
438 0.47
439 0.41
440 0.34
441 0.32
442 0.35
443 0.33
444 0.35
445 0.36
446 0.34
447 0.33
448 0.32
449 0.26
450 0.19
451 0.19
452 0.17
453 0.14
454 0.13
455 0.16
456 0.2
457 0.27
458 0.27
459 0.26
460 0.26
461 0.27
462 0.27
463 0.27
464 0.3
465 0.22
466 0.27
467 0.32
468 0.34
469 0.36
470 0.41
471 0.4
472 0.34
473 0.34
474 0.31
475 0.29
476 0.28
477 0.25
478 0.23
479 0.22
480 0.19
481 0.26
482 0.28
483 0.25
484 0.28
485 0.31
486 0.33
487 0.37
488 0.39
489 0.33
490 0.31
491 0.28
492 0.24
493 0.23
494 0.22
495 0.27
496 0.28
497 0.31
498 0.32
499 0.34
500 0.36
501 0.36
502 0.35
503 0.3
504 0.27
505 0.26
506 0.24
507 0.24
508 0.22
509 0.2
510 0.19
511 0.17
512 0.21
513 0.21
514 0.19
515 0.19
516 0.2
517 0.2
518 0.23
519 0.25
520 0.24
521 0.26
522 0.27
523 0.28
524 0.29
525 0.28
526 0.25
527 0.22
528 0.22
529 0.24
530 0.26
531 0.24
532 0.22
533 0.28
534 0.29
535 0.31
536 0.3
537 0.28
538 0.31
539 0.31
540 0.33
541 0.3
542 0.29
543 0.27
544 0.31
545 0.29
546 0.22
547 0.22
548 0.21
549 0.2
550 0.2
551 0.18
552 0.15
553 0.23
554 0.22
555 0.22
556 0.22
557 0.21
558 0.21
559 0.22
560 0.19
561 0.1
562 0.1
563 0.12
564 0.16
565 0.16
566 0.18
567 0.2
568 0.2
569 0.21
570 0.2
571 0.21
572 0.18
573 0.19
574 0.16
575 0.14
576 0.14
577 0.13
578 0.13
579 0.12
580 0.17
581 0.17
582 0.23
583 0.24
584 0.26
585 0.27
586 0.33
587 0.35
588 0.35
589 0.38
590 0.33
591 0.31
592 0.29
593 0.28
594 0.23
595 0.19
596 0.13
597 0.08
598 0.07
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.14
603 0.14
604 0.14
605 0.16
606 0.16
607 0.12
608 0.14
609 0.15
610 0.14
611 0.15
612 0.14
613 0.12
614 0.16
615 0.17
616 0.16
617 0.18
618 0.16
619 0.2
620 0.23
621 0.25
622 0.23
623 0.26
624 0.27
625 0.25
626 0.28
627 0.28
628 0.25
629 0.24
630 0.22
631 0.19
632 0.18
633 0.18
634 0.15
635 0.1
636 0.1
637 0.08
638 0.08
639 0.07
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.06
669 0.05
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.07
676 0.06
677 0.07
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.08
684 0.1
685 0.13
686 0.19
687 0.22
688 0.26
689 0.26
690 0.27
691 0.3
692 0.33
693 0.33
694 0.37
695 0.38
696 0.34
697 0.37
698 0.36
699 0.31
700 0.27
701 0.24
702 0.17
703 0.13
704 0.13
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.1
709 0.1
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.12
714 0.12
715 0.12
716 0.12
717 0.11
718 0.09
719 0.09
720 0.07
721 0.07
722 0.06
723 0.05
724 0.04
725 0.03
726 0.02
727 0.02
728 0.03
729 0.02
730 0.03
731 0.02
732 0.03
733 0.05
734 0.05
735 0.06
736 0.07
737 0.08
738 0.08
739 0.11
740 0.1
741 0.1
742 0.14
743 0.14
744 0.14
745 0.14
746 0.16
747 0.17
748 0.19
749 0.2
750 0.19
751 0.24
752 0.29
753 0.31
754 0.36
755 0.35
756 0.37
757 0.38
758 0.36
759 0.31
760 0.25
761 0.22
762 0.15
763 0.13
764 0.09
765 0.07
766 0.06
767 0.05
768 0.06
769 0.06
770 0.07
771 0.09
772 0.11
773 0.13
774 0.14
775 0.14
776 0.14
777 0.15
778 0.17
779 0.17
780 0.19
781 0.19
782 0.23
783 0.25
784 0.24
785 0.24
786 0.26
787 0.25
788 0.23
789 0.22
790 0.19
791 0.17
792 0.18
793 0.17
794 0.15
795 0.15
796 0.13
797 0.13
798 0.16
799 0.15
800 0.15
801 0.17
802 0.16
803 0.16
804 0.18
805 0.2
806 0.19
807 0.22
808 0.24
809 0.24
810 0.32
811 0.31
812 0.29
813 0.28
814 0.25
815 0.24
816 0.23
817 0.24
818 0.16
819 0.15
820 0.14
821 0.14
822 0.13
823 0.11
824 0.11
825 0.1
826 0.1
827 0.11
828 0.11
829 0.12
830 0.12
831 0.13
832 0.14
833 0.11
834 0.1
835 0.08
836 0.08
837 0.07
838 0.08
839 0.05
840 0.04
841 0.04
842 0.05
843 0.06
844 0.07
845 0.07
846 0.1
847 0.12
848 0.15
849 0.2
850 0.23
851 0.24
852 0.27
853 0.3
854 0.3
855 0.32
856 0.35
857 0.3
858 0.29
859 0.28
860 0.28
861 0.26
862 0.24
863 0.21
864 0.18
865 0.18
866 0.17
867 0.16
868 0.13
869 0.12
870 0.12
871 0.11
872 0.08
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.05
877 0.04
878 0.04
879 0.04
880 0.04
881 0.05
882 0.06
883 0.08
884 0.12
885 0.16
886 0.2
887 0.22
888 0.25
889 0.28
890 0.3
891 0.33
892 0.36
893 0.35
894 0.32
895 0.34
896 0.31
897 0.27
898 0.27
899 0.22
900 0.18
901 0.16
902 0.16
903 0.13
904 0.16
905 0.22
906 0.25
907 0.29
908 0.3
909 0.38
910 0.43
911 0.47
912 0.48
913 0.48
914 0.47
915 0.52
916 0.57
917 0.56
918 0.54
919 0.56
920 0.6
921 0.59
922 0.57
923 0.49
924 0.43
925 0.37
926 0.34
927 0.31
928 0.23
929 0.19
930 0.17
931 0.17
932 0.14
933 0.12
934 0.13
935 0.09
936 0.1
937 0.1
938 0.09
939 0.09
940 0.09
941 0.1
942 0.08
943 0.09
944 0.09
945 0.09
946 0.1
947 0.1
948 0.09
949 0.1
950 0.1
951 0.12
952 0.15
953 0.2
954 0.21
955 0.21
956 0.21
957 0.21
958 0.26
959 0.25
960 0.22
961 0.2
962 0.21
963 0.23
964 0.26
965 0.25
966 0.2
967 0.2
968 0.19
969 0.17
970 0.16
971 0.14
972 0.12
973 0.11
974 0.16
975 0.14
976 0.14
977 0.14
978 0.16
979 0.18
980 0.22
981 0.27
982 0.31
983 0.35
984 0.41
985 0.47
986 0.48
987 0.49
988 0.47
989 0.45
990 0.41
991 0.4
992 0.34
993 0.3
994 0.32
995 0.32
996 0.34
997 0.32
998 0.29
999 0.26
1000 0.26
1001 0.22
1002 0.18
1003 0.15
1004 0.1
1005 0.12
1006 0.13
1007 0.15
1008 0.18
1009 0.21
1010 0.24
1011 0.25
1012 0.26
1013 0.27
1014 0.34
1015 0.31
1016 0.31
1017 0.3
1018 0.27
1019 0.26
1020 0.28
1021 0.25
1022 0.18
1023 0.2
1024 0.18
1025 0.2
1026 0.19
1027 0.18
1028 0.15
1029 0.15
1030 0.15
1031 0.14
1032 0.14
1033 0.13
1034 0.19
1035 0.19
1036 0.2
1037 0.2
1038 0.18
1039 0.18
1040 0.18
1041 0.18
1042 0.17
1043 0.2
1044 0.2
1045 0.22
1046 0.23
1047 0.26
1048 0.24
1049 0.25
1050 0.24
1051 0.2
1052 0.23
1053 0.22
1054 0.22
1055 0.2
1056 0.2
1057 0.18
1058 0.16
1059 0.16
1060 0.16
1061 0.18
1062 0.17
1063 0.19
1064 0.23
1065 0.26
1066 0.31
1067 0.32
1068 0.34
1069 0.33
1070 0.34
1071 0.36
1072 0.34
1073 0.3
1074 0.25
1075 0.24
1076 0.17
1077 0.17
1078 0.16
1079 0.13
1080 0.11
1081 0.08
1082 0.07
1083 0.07
1084 0.07
1085 0.06
1086 0.05
1087 0.04
1088 0.04
1089 0.04
1090 0.04
1091 0.04
1092 0.05
1093 0.06
1094 0.07
1095 0.06
1096 0.07
1097 0.07
1098 0.07
1099 0.08
1100 0.07
1101 0.06
1102 0.06
1103 0.06
1104 0.06
1105 0.08
1106 0.08
1107 0.07
1108 0.09
1109 0.09
1110 0.11
1111 0.12
1112 0.14
1113 0.12
1114 0.14
1115 0.15
1116 0.18
1117 0.18
1118 0.17
1119 0.18
1120 0.17
1121 0.22
1122 0.22
1123 0.22
1124 0.2
1125 0.2
1126 0.19
1127 0.21
1128 0.23
1129 0.24
1130 0.26
1131 0.31
1132 0.3
1133 0.31
1134 0.33
1135 0.3
1136 0.32
1137 0.29
1138 0.3
1139 0.34
1140 0.34
1141 0.34
1142 0.35
1143 0.35
1144 0.3
1145 0.3
1146 0.25
1147 0.17
1148 0.19
1149 0.2
1150 0.19
1151 0.18
1152 0.21
1153 0.2
1154 0.23
1155 0.28
1156 0.25
1157 0.24
1158 0.23
1159 0.21
1160 0.19
1161 0.19
1162 0.17
1163 0.1
1164 0.1
1165 0.1
1166 0.12
1167 0.12
1168 0.11
1169 0.11
1170 0.1
1171 0.1
1172 0.1
1173 0.12
1174 0.16
1175 0.2
1176 0.2
1177 0.25
1178 0.26
1179 0.27
1180 0.29
1181 0.26
1182 0.22
1183 0.2
1184 0.19
1185 0.15
1186 0.15
1187 0.14
1188 0.12
1189 0.14
1190 0.11
1191 0.09
1192 0.1
1193 0.1
1194 0.11
1195 0.16
1196 0.17
1197 0.19
1198 0.24
1199 0.3
1200 0.35
1201 0.38
1202 0.38
1203 0.37
1204 0.39
1205 0.43
1206 0.42
1207 0.39
1208 0.35
1209 0.33
1210 0.34
1211 0.35
1212 0.32
1213 0.24
1214 0.24
1215 0.28
1216 0.25
1217 0.23
1218 0.24
1219 0.23
1220 0.29
1221 0.32
1222 0.31
1223 0.3
1224 0.37
1225 0.44
1226 0.43
1227 0.44
1228 0.38
1229 0.36
1230 0.37
1231 0.34
1232 0.28
1233 0.23