Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5FVX1

Protein Details
Accession M5FVX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-262LKTLMEMQRKQKQREKRFGHKPIGGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-262RKQKQREKRFGHKPIGGR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039157  RBM18_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12355  RRM_RBM18  
Amino Acid Sequences MASSTEKLEGTTTPSGLITIPEPEEEDGPEPGPSKPRAPQVRQDRLYVGNLPSSVDEYTLIKAFERFGKITSLDFLFHKAGPQKGKPRGYAFIEFSNKDEALKAIVTMHDKLVRGRNLVVTFAHQAPPMDEAGRLGKRKTDTARPTALSLLKNQAKLKTNDKIAVLERKLAQLQKEQPASTAPVSTLPQIAPSLPDPLNHPLPPKPSSVNSPVASPSKPVPAPAGNMRRLQDEPPDLKTLMEMQRKQKQREKRFGHKPIGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.17
4 0.17
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.17
19 0.22
20 0.23
21 0.25
22 0.29
23 0.38
24 0.46
25 0.51
26 0.59
27 0.64
28 0.72
29 0.7
30 0.67
31 0.61
32 0.54
33 0.52
34 0.46
35 0.37
36 0.29
37 0.26
38 0.24
39 0.21
40 0.2
41 0.16
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.16
52 0.19
53 0.18
54 0.18
55 0.21
56 0.21
57 0.21
58 0.22
59 0.18
60 0.16
61 0.16
62 0.18
63 0.17
64 0.16
65 0.18
66 0.2
67 0.24
68 0.28
69 0.34
70 0.4
71 0.47
72 0.52
73 0.53
74 0.53
75 0.54
76 0.53
77 0.51
78 0.44
79 0.42
80 0.42
81 0.38
82 0.35
83 0.33
84 0.28
85 0.23
86 0.21
87 0.14
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.07
92 0.09
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.14
97 0.14
98 0.16
99 0.22
100 0.22
101 0.21
102 0.22
103 0.24
104 0.22
105 0.22
106 0.2
107 0.16
108 0.17
109 0.16
110 0.16
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.11
120 0.15
121 0.16
122 0.14
123 0.17
124 0.18
125 0.23
126 0.26
127 0.31
128 0.33
129 0.37
130 0.41
131 0.38
132 0.38
133 0.36
134 0.36
135 0.27
136 0.24
137 0.27
138 0.26
139 0.29
140 0.3
141 0.32
142 0.34
143 0.36
144 0.41
145 0.38
146 0.39
147 0.38
148 0.37
149 0.34
150 0.33
151 0.37
152 0.32
153 0.29
154 0.27
155 0.26
156 0.28
157 0.27
158 0.26
159 0.25
160 0.3
161 0.34
162 0.36
163 0.34
164 0.32
165 0.31
166 0.32
167 0.26
168 0.21
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.12
180 0.16
181 0.15
182 0.16
183 0.18
184 0.23
185 0.28
186 0.27
187 0.29
188 0.28
189 0.33
190 0.34
191 0.34
192 0.32
193 0.31
194 0.35
195 0.38
196 0.42
197 0.37
198 0.37
199 0.38
200 0.37
201 0.35
202 0.31
203 0.27
204 0.27
205 0.27
206 0.26
207 0.27
208 0.26
209 0.31
210 0.38
211 0.44
212 0.41
213 0.45
214 0.45
215 0.45
216 0.44
217 0.42
218 0.4
219 0.4
220 0.39
221 0.39
222 0.42
223 0.38
224 0.35
225 0.34
226 0.34
227 0.34
228 0.4
229 0.41
230 0.47
231 0.56
232 0.65
233 0.72
234 0.73
235 0.75
236 0.77
237 0.82
238 0.83
239 0.84
240 0.87
241 0.88
242 0.89