Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5FT26

Protein Details
Accession M5FT26    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-190ASGSQQRKRGRPKKHGDAGAVHydrophilic
215-240ETGESNPKRPRGRPKKSKGTASDPAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-184RKRGRPKKH
221-232PKRPRGRPKKSK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR018482  Znf-C4H2  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MGPSYLTSVPDPESQGPIVAVPGTDWSQQLLKLAKTAELKKHTLALQIHTADIVNAQASLEEKQKALQDVRSEKNWLESERERLLEALKEVNLDRERVDLAEANLGRSIQEYQTTITTVTDGDYAPSRGTVDALRQELELPPLPSLQDTLNEKAAIILEEKRRAAQPQLASGSQQRKRGRPKKHGDAGAVPGTGELSFEGITAGTLPDGTGRNGETGESNPKRPRGRPKKSKGTASDPAVPTGGHVQMQVPMQGQMDVPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.22
4 0.19
5 0.17
6 0.13
7 0.1
8 0.08
9 0.1
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.2
17 0.21
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.25
22 0.3
23 0.36
24 0.4
25 0.42
26 0.44
27 0.42
28 0.46
29 0.42
30 0.43
31 0.39
32 0.34
33 0.35
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.25
38 0.18
39 0.16
40 0.13
41 0.06
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.07
46 0.09
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.15
51 0.17
52 0.21
53 0.22
54 0.23
55 0.28
56 0.34
57 0.38
58 0.38
59 0.38
60 0.34
61 0.39
62 0.38
63 0.32
64 0.32
65 0.31
66 0.34
67 0.34
68 0.35
69 0.28
70 0.26
71 0.25
72 0.2
73 0.19
74 0.15
75 0.12
76 0.13
77 0.12
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.15
86 0.1
87 0.1
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.12
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.14
126 0.13
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.08
134 0.11
135 0.13
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.12
143 0.1
144 0.13
145 0.15
146 0.18
147 0.19
148 0.19
149 0.21
150 0.22
151 0.23
152 0.24
153 0.22
154 0.25
155 0.28
156 0.27
157 0.27
158 0.31
159 0.38
160 0.37
161 0.43
162 0.42
163 0.47
164 0.58
165 0.66
166 0.7
167 0.72
168 0.77
169 0.8
170 0.83
171 0.8
172 0.73
173 0.68
174 0.63
175 0.55
176 0.45
177 0.34
178 0.25
179 0.21
180 0.16
181 0.12
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.14
204 0.24
205 0.26
206 0.32
207 0.37
208 0.45
209 0.51
210 0.57
211 0.65
212 0.66
213 0.74
214 0.78
215 0.83
216 0.87
217 0.89
218 0.91
219 0.87
220 0.84
221 0.82
222 0.77
223 0.75
224 0.65
225 0.58
226 0.49
227 0.41
228 0.34
229 0.29
230 0.25
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.17