Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5GB02

Protein Details
Accession M5GB02    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-58PSTIEASQKKGKKHRFRHRPGGIKIGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-53KKGKKHRFRHRPGG
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 11.5, nucl 4.5, mito 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences LFAIAKPSGPVCMTMLDGIKPLISQSRIFSHPSTIEASQKKGKKHRFRHRPGGIKIGQGGTLDPLADGVLIIGIGKGTKKLQTHLDGPKTYRTTALLGAETDTYDSEGKVVRTAPWKHVTREKIESVLDRFRGEITQLPPIYSALKMDGKPLYEYAREGKSLPRPIEARKVTIHSLKCIDWQDGAPLDGDGPGHHFDFPKAQVSEKDKETMDKVRELVVKEGKVEGVAGETEMEAEAVPEALDECRPPIFKLEMQVSGGTYVRSIVHNIGHAIGSAAHVVHLSRTIQGDYHCDEQPGDPGNCISWSVFERAIEERKGDGPRTEDKKDEEWTAWEEAVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.16
4 0.17
5 0.15
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.21
13 0.26
14 0.28
15 0.32
16 0.32
17 0.32
18 0.3
19 0.31
20 0.32
21 0.28
22 0.34
23 0.34
24 0.38
25 0.41
26 0.45
27 0.51
28 0.57
29 0.66
30 0.68
31 0.76
32 0.82
33 0.85
34 0.9
35 0.93
36 0.92
37 0.92
38 0.85
39 0.84
40 0.76
41 0.68
42 0.61
43 0.5
44 0.42
45 0.31
46 0.27
47 0.19
48 0.16
49 0.13
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.04
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.03
61 0.04
62 0.04
63 0.06
64 0.08
65 0.13
66 0.15
67 0.18
68 0.25
69 0.29
70 0.37
71 0.44
72 0.5
73 0.48
74 0.49
75 0.53
76 0.49
77 0.45
78 0.39
79 0.32
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.19
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.14
88 0.12
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.21
100 0.24
101 0.29
102 0.36
103 0.39
104 0.41
105 0.48
106 0.49
107 0.47
108 0.5
109 0.45
110 0.39
111 0.37
112 0.37
113 0.33
114 0.33
115 0.29
116 0.23
117 0.22
118 0.2
119 0.18
120 0.16
121 0.17
122 0.15
123 0.2
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.15
130 0.14
131 0.1
132 0.13
133 0.13
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.17
138 0.18
139 0.17
140 0.14
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.19
147 0.23
148 0.28
149 0.28
150 0.28
151 0.28
152 0.3
153 0.39
154 0.36
155 0.32
156 0.28
157 0.3
158 0.29
159 0.33
160 0.31
161 0.24
162 0.25
163 0.23
164 0.25
165 0.24
166 0.22
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.05
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.15
186 0.18
187 0.17
188 0.18
189 0.23
190 0.28
191 0.32
192 0.3
193 0.32
194 0.26
195 0.28
196 0.3
197 0.31
198 0.27
199 0.25
200 0.25
201 0.26
202 0.29
203 0.29
204 0.31
205 0.29
206 0.27
207 0.26
208 0.26
209 0.21
210 0.18
211 0.16
212 0.1
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.14
236 0.18
237 0.19
238 0.23
239 0.26
240 0.26
241 0.26
242 0.26
243 0.22
244 0.2
245 0.19
246 0.14
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.13
259 0.12
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.15
274 0.16
275 0.2
276 0.22
277 0.25
278 0.24
279 0.23
280 0.23
281 0.22
282 0.26
283 0.28
284 0.25
285 0.22
286 0.21
287 0.22
288 0.21
289 0.22
290 0.17
291 0.13
292 0.15
293 0.18
294 0.19
295 0.18
296 0.2
297 0.24
298 0.3
299 0.29
300 0.28
301 0.27
302 0.31
303 0.35
304 0.36
305 0.34
306 0.34
307 0.42
308 0.47
309 0.49
310 0.48
311 0.49
312 0.51
313 0.52
314 0.51
315 0.44
316 0.4
317 0.4
318 0.38