FuNGI

M5GB11

Protein Details

Accession

M5GB11

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-42	ASAPASSKSSKKKRGQETVSATRLK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
260-267	PPKPKKGK
335-344	GKGKTRRGKG
373-379	RGRGRGR
449-461	GGRGRGRGSPGRG

Subcellular Location(s)

mito 17.5, cyto_mito 10.5, nucl 4, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSMAKQVAASSSPAASPASAPASSKSSKKKRGQETVSATRLKVIVRRLPPNLPEAVFWKSVEPWVNEENTTWRIFYSGKIKPKLENENVPSRAYIMFKTPEQVAQFSSAYNGHAFRDKQGRESQAVVEFAPYQKVPITNVKPDVRQGTIDQDPDFMSFMTNLNAPVEYESLASLEKGVSQAPALEPVIAPLIEALIQQKKATKGAKAAAKAAAAQAPTVASRQAAAVASQQAAMQAAAEEKAVYSRKLPGEAGPSVEPPPPKPKKGKQASEPQPTGDDTARKRPVVGANRQFDAALGAATGGRAQPRTQEKPSAATQASTAASTPAQPAAQPAPGKGKTRRGKGGGQAPQATGGPSQSQGAPQSRADAGQGGRGRGRGRGAPPPPQVQPGMIQIASRPAANAPISRIDMQPPNQVIYSSTPGEGAGGDGRPVRNAVAAQMIDKLRTGGGGRGRGRGSPGRGGASGALPG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.14
3	0.13
4	0.14
5	0.17
6	0.16
7	0.17
8	0.19
9	0.24
10	0.27
11	0.34
12	0.41
13	0.48
14	0.58
15	0.66
16	0.74
17	0.78
18	0.86
19	0.86
20	0.85
21	0.84
22	0.84
23	0.81
24	0.74
25	0.64
26	0.56
27	0.5
28	0.42
29	0.37
30	0.35
31	0.37
32	0.41
33	0.49
34	0.51
35	0.55
36	0.55
37	0.55
38	0.51
39	0.44
40	0.38
41	0.34
42	0.33
43	0.29
44	0.27
45	0.25
46	0.21
47	0.25
48	0.29
49	0.27
50	0.27
51	0.29
52	0.31
53	0.29
54	0.29
55	0.3
56	0.27
57	0.27
58	0.22
59	0.18
60	0.18
61	0.18
62	0.21
63	0.25
64	0.3
65	0.38
66	0.44
67	0.46
68	0.5
69	0.58
70	0.63
71	0.61
72	0.63
73	0.6
74	0.63
75	0.63
76	0.58
77	0.5
78	0.42
79	0.37
80	0.29
81	0.25
82	0.2
83	0.21
84	0.2
85	0.23
86	0.22
87	0.24
88	0.24
89	0.25
90	0.21
91	0.21
92	0.21
93	0.18
94	0.19
95	0.16
96	0.15
97	0.16
98	0.15
99	0.13
100	0.18
101	0.19
102	0.22
103	0.31
104	0.3
105	0.34
106	0.39
107	0.42
108	0.38
109	0.4
110	0.38
111	0.32
112	0.32
113	0.27
114	0.22
115	0.19
116	0.17
117	0.17
118	0.14
119	0.12
120	0.12
121	0.13
122	0.15
123	0.24
124	0.28
125	0.3
126	0.38
127	0.4
128	0.39
129	0.42
130	0.42
131	0.34
132	0.32
133	0.27
134	0.26
135	0.27
136	0.27
137	0.24
138	0.21
139	0.2
140	0.19
141	0.18
142	0.12
143	0.09
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.05
162	0.05
163	0.06
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.06
168	0.06
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.07
176	0.07
177	0.05
178	0.05
179	0.04
180	0.05
181	0.07
182	0.09
183	0.1
184	0.1
185	0.14
186	0.15
187	0.2
188	0.22
189	0.22
190	0.23
191	0.29
192	0.33
193	0.31
194	0.32
195	0.28
196	0.26
197	0.24
198	0.2
199	0.16
200	0.12
201	0.1
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.07
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.13
233	0.14
234	0.16
235	0.17
236	0.16
237	0.19
238	0.2
239	0.21
240	0.17
241	0.17
242	0.18
243	0.19
244	0.18
245	0.16
246	0.26
247	0.28
248	0.33
249	0.41
250	0.46
251	0.55
252	0.64
253	0.69
254	0.66
255	0.72
256	0.77
257	0.77
258	0.71
259	0.61
260	0.53
261	0.46
262	0.41
263	0.32
264	0.28
265	0.21
266	0.3
267	0.33
268	0.31
269	0.31
270	0.32
271	0.38
272	0.41
273	0.48
274	0.47
275	0.46
276	0.47
277	0.47
278	0.43
279	0.34
280	0.27
281	0.18
282	0.09
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.14
293	0.22
294	0.29
295	0.32
296	0.37
297	0.37
298	0.41
299	0.43
300	0.43
301	0.35
302	0.29
303	0.26
304	0.24
305	0.23
306	0.18
307	0.16
308	0.1
309	0.1
310	0.11
311	0.11
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.11
316	0.12
317	0.17
318	0.16
319	0.17
320	0.24
321	0.28
322	0.34
323	0.37
324	0.45
325	0.49
326	0.56
327	0.62
328	0.58
329	0.6
330	0.61
331	0.66
332	0.63
333	0.61
334	0.56
335	0.48
336	0.45
337	0.39
338	0.33
339	0.23
340	0.17
341	0.12
342	0.11
343	0.12
344	0.11
345	0.13
346	0.17
347	0.2
348	0.22
349	0.21
350	0.24
351	0.23
352	0.23
353	0.22
354	0.21
355	0.17
356	0.21
357	0.23
358	0.22
359	0.23
360	0.26
361	0.26
362	0.25
363	0.28
364	0.27
365	0.29
366	0.37
367	0.4
368	0.46
369	0.51
370	0.53
371	0.51
372	0.49
373	0.46
374	0.38
375	0.36
376	0.31
377	0.29
378	0.24
379	0.22
380	0.19
381	0.23
382	0.22
383	0.2
384	0.16
385	0.13
386	0.17
387	0.19
388	0.2
389	0.18
390	0.22
391	0.25
392	0.26
393	0.27
394	0.28
395	0.32
396	0.34
397	0.39
398	0.36
399	0.35
400	0.34
401	0.33
402	0.3
403	0.28
404	0.3
405	0.23
406	0.22
407	0.2
408	0.19
409	0.19
410	0.17
411	0.13
412	0.11
413	0.1
414	0.11
415	0.15
416	0.15
417	0.16
418	0.17
419	0.16
420	0.16
421	0.16
422	0.16
423	0.19
424	0.19
425	0.19
426	0.24
427	0.24
428	0.22
429	0.22
430	0.22
431	0.15
432	0.17
433	0.18
434	0.17
435	0.23
436	0.32
437	0.34
438	0.39
439	0.41
440	0.4
441	0.45
442	0.47
443	0.45
444	0.44
445	0.45
446	0.43
447	0.42
448	0.42
449	0.37

M5GB11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer