Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5FXC3

Protein Details
Accession M5FXC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-297TGGKRHSSGGKVKRRKKSRALSAMNVPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-288APLPTGGKRHSSGGKVKRRKKSR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 11, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MSAPSEDELLTTSWLFSEWIAAFGPLTHAQKALDYFSLSIFWDKQSTNQVLRMQTQHALGPDGLGGSGVDEESELRKFTGVEFAVVHGRPPGLWVIHKRERFSPDEVRPLAAYFILNNTIYPSPSLYSVLSTSLSTTLHHLSASLALLRAQKPAYNPRVGTSWPIAPPRDPTRSLAAGRSRAGSVIPEEGGSVEPRAGGETVERKKEEEVVPLWHAFLTASSYAQAAAVTRESVVLTPEDEDSPLEEPARERGGTRERERESATPAPLPTGGKRHSSGGKVKRRKKSRALSAMNVPPGEREGWMESPLRGELPLAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.08
4 0.13
5 0.11
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.17
12 0.17
13 0.19
14 0.18
15 0.19
16 0.19
17 0.22
18 0.24
19 0.22
20 0.18
21 0.17
22 0.17
23 0.16
24 0.17
25 0.15
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.17
30 0.17
31 0.2
32 0.27
33 0.32
34 0.32
35 0.37
36 0.4
37 0.4
38 0.44
39 0.43
40 0.38
41 0.35
42 0.33
43 0.29
44 0.25
45 0.24
46 0.2
47 0.17
48 0.14
49 0.11
50 0.1
51 0.08
52 0.06
53 0.04
54 0.05
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.05
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.17
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.17
71 0.2
72 0.2
73 0.2
74 0.13
75 0.13
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.1
80 0.14
81 0.2
82 0.28
83 0.36
84 0.39
85 0.4
86 0.44
87 0.47
88 0.47
89 0.47
90 0.47
91 0.44
92 0.49
93 0.47
94 0.43
95 0.38
96 0.35
97 0.29
98 0.2
99 0.16
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.12
139 0.15
140 0.23
141 0.26
142 0.27
143 0.26
144 0.26
145 0.27
146 0.26
147 0.26
148 0.2
149 0.18
150 0.18
151 0.2
152 0.2
153 0.19
154 0.23
155 0.26
156 0.29
157 0.27
158 0.27
159 0.29
160 0.32
161 0.32
162 0.32
163 0.31
164 0.3
165 0.29
166 0.28
167 0.23
168 0.2
169 0.19
170 0.14
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.08
187 0.16
188 0.2
189 0.24
190 0.25
191 0.25
192 0.25
193 0.31
194 0.3
195 0.26
196 0.24
197 0.24
198 0.26
199 0.26
200 0.25
201 0.19
202 0.18
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.15
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.22
240 0.3
241 0.38
242 0.43
243 0.48
244 0.48
245 0.52
246 0.56
247 0.52
248 0.5
249 0.47
250 0.44
251 0.39
252 0.36
253 0.33
254 0.31
255 0.31
256 0.28
257 0.3
258 0.3
259 0.31
260 0.33
261 0.36
262 0.39
263 0.44
264 0.5
265 0.52
266 0.61
267 0.66
268 0.74
269 0.79
270 0.84
271 0.87
272 0.88
273 0.88
274 0.88
275 0.89
276 0.87
277 0.83
278 0.82
279 0.8
280 0.74
281 0.63
282 0.52
283 0.42
284 0.37
285 0.31
286 0.23
287 0.19
288 0.19
289 0.21
290 0.24
291 0.25
292 0.23
293 0.25
294 0.25
295 0.22
296 0.17