Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5GCN3

Protein Details
Accession M5GCN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-260FAGKTKKDPVSKPKKEKPVMIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-97EVKEGRGERRGRGEGRGEGRGRSRGGRGRGRG
243-257TKKDPVSKPKKEKPV
264-308RFAPVERGGRGRGRGGERGGPRGRGEGRGRGGAGAPRGRGVSRGG
Subcellular Location(s) cyto 20.5, cyto_nucl 13.5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVASKNPFALLDDDETVEQTSVAVAVPASAVKPNEQPKVQENRSRQTNGRAPRTPRPERTADGFEVKEGRGERRGRGEGRGEGRGRSRGGRGRGRGGFQNMDRHSNTGITDSHKQVHQGWGGDTGAAEHAAETEGAADAIKEEAAPEAAVNGQEAPVTPAGEAKPTEEAEGKPRVEEEEDNTVSYDEYLKKQKGTPGVLDNLIPKLEVRQVGEGEGYEDGVLSRGGAEVLKKEDQAFFAGKTKKDPVSKPKKEKPVMIEIDARFAPVERGGRGRGRGGERGGPRGRGEGRGRGGAGAPRGRGVSRGGAGRGVDVDDAAAFPSLTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.2
4 0.19
5 0.16
6 0.13
7 0.09
8 0.08
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.04
13 0.05
14 0.05
15 0.06
16 0.06
17 0.09
18 0.11
19 0.13
20 0.21
21 0.27
22 0.34
23 0.36
24 0.39
25 0.44
26 0.54
27 0.59
28 0.6
29 0.6
30 0.62
31 0.68
32 0.69
33 0.64
34 0.63
35 0.64
36 0.65
37 0.67
38 0.66
39 0.65
40 0.69
41 0.75
42 0.75
43 0.75
44 0.72
45 0.68
46 0.65
47 0.65
48 0.61
49 0.54
50 0.5
51 0.43
52 0.38
53 0.35
54 0.31
55 0.28
56 0.24
57 0.24
58 0.26
59 0.29
60 0.31
61 0.36
62 0.43
63 0.41
64 0.44
65 0.46
66 0.45
67 0.46
68 0.5
69 0.43
70 0.4
71 0.41
72 0.4
73 0.37
74 0.33
75 0.36
76 0.35
77 0.42
78 0.47
79 0.47
80 0.51
81 0.53
82 0.52
83 0.51
84 0.48
85 0.45
86 0.4
87 0.45
88 0.38
89 0.4
90 0.38
91 0.35
92 0.31
93 0.28
94 0.25
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.21
99 0.22
100 0.23
101 0.23
102 0.24
103 0.24
104 0.27
105 0.25
106 0.22
107 0.21
108 0.21
109 0.2
110 0.18
111 0.16
112 0.11
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.1
153 0.1
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.15
158 0.2
159 0.19
160 0.17
161 0.17
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.16
166 0.18
167 0.19
168 0.19
169 0.19
170 0.18
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.09
175 0.12
176 0.18
177 0.19
178 0.21
179 0.23
180 0.26
181 0.3
182 0.31
183 0.31
184 0.29
185 0.31
186 0.3
187 0.29
188 0.26
189 0.21
190 0.18
191 0.14
192 0.1
193 0.09
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.14
202 0.12
203 0.1
204 0.08
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.19
224 0.18
225 0.16
226 0.23
227 0.27
228 0.26
229 0.3
230 0.34
231 0.37
232 0.42
233 0.48
234 0.51
235 0.58
236 0.68
237 0.74
238 0.78
239 0.83
240 0.81
241 0.8
242 0.75
243 0.74
244 0.68
245 0.61
246 0.6
247 0.49
248 0.48
249 0.42
250 0.36
251 0.25
252 0.21
253 0.19
254 0.15
255 0.18
256 0.15
257 0.19
258 0.23
259 0.27
260 0.29
261 0.32
262 0.35
263 0.37
264 0.4
265 0.4
266 0.44
267 0.43
268 0.49
269 0.49
270 0.46
271 0.42
272 0.44
273 0.43
274 0.43
275 0.45
276 0.44
277 0.44
278 0.45
279 0.44
280 0.38
281 0.38
282 0.34
283 0.36
284 0.32
285 0.28
286 0.27
287 0.28
288 0.27
289 0.27
290 0.26
291 0.25
292 0.24
293 0.27
294 0.27
295 0.28
296 0.28
297 0.27
298 0.25
299 0.2
300 0.16
301 0.12
302 0.11
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08