Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5GDE2

Protein Details
Accession M5GDE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-40SVDTTDTPRKRRRITKGSGSDSYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MRQPFFPRPFRITQYEGSVDTTDTPRKRRRITKGSGSDSYVPTGDDLSMHRMEATLRLQTCWWSLADKYSTPLDKDDEVDLFTGQVVRDRGFIRGMERVYELGDLLEGSCLGDDEYAEGSEGGYSVGGDGGSYNIRRSYSSAVDSQDDTSEDEVALSEDLSEDELGSWGEYSGLDYQYRVVPPLSAQMDSEDERDLREFEEAEKALREKFGHDYLEDHLSGEELLDTASDDLSDRRLSDDEMTSYSVWSEDEFSTFELGEGSAVRIIDDSDDSDELNSFLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.5
3 0.45
4 0.41
5 0.36
6 0.3
7 0.28
8 0.28
9 0.3
10 0.32
11 0.4
12 0.45
13 0.54
14 0.63
15 0.7
16 0.76
17 0.78
18 0.82
19 0.84
20 0.86
21 0.84
22 0.78
23 0.73
24 0.66
25 0.57
26 0.5
27 0.39
28 0.29
29 0.22
30 0.19
31 0.14
32 0.11
33 0.11
34 0.14
35 0.15
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.22
48 0.19
49 0.17
50 0.14
51 0.14
52 0.18
53 0.21
54 0.19
55 0.21
56 0.24
57 0.26
58 0.25
59 0.26
60 0.23
61 0.22
62 0.23
63 0.22
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.07
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.16
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.13
126 0.14
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.16
171 0.16
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.17
176 0.18
177 0.19
178 0.14
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.13
183 0.1
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.16
193 0.19
194 0.18
195 0.15
196 0.19
197 0.22
198 0.22
199 0.21
200 0.22
201 0.23
202 0.26
203 0.23
204 0.19
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.08
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.12
223 0.13
224 0.15
225 0.18
226 0.2
227 0.19
228 0.2
229 0.23
230 0.2
231 0.2
232 0.18
233 0.15
234 0.12
235 0.11
236 0.12
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.14