Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7F8V8

Protein Details
Accession A7F8V8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-88GREPSLRAPKRQRVDDNYDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
798-843GSIKVPGLRPAKMTKADRSVAARKAKRGEKEEEKAPEGERVRKQRK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, cysk 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG ssl:SS1G_14039  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17949  DEADc_DDX31  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MADDGMLMNFEIGEVPIVTKQSFKGGRWKDRLAAKKTAQHRVSRSTSKPSTREIFSERQHDTGAEEYIGREPSLRAPKRQRVDDNYDSYGGRNESTAAYASGKLPSGSINLGRGRKTTFQEETRPAFVAGKLPPGSINISGKKATPIQEETRPAFVSGKLPPGSINSGARKAISFQEEKKPAYISGKLPHGSIDGMRNREMAAVHREIAEGGRKPGQVVSSLFTFNPTSKKKFDEPEEESEPAKPSNAPLTEEMATFTNLGLSRRLAAHLSTKLDMKAPTAIQKASVTQLISDDSDAFIQAETGSGKTLAYLLPIVERILALSDNGIQIHRDSGLFAIILSPTRELCKQIAAVLEKVLRCAPWIVGTTVNGGESKQSEKARLRKGVNILVATPGRLADHLDNTEVLNVATVRWLVLDEGDRLMELGFEEEIKGIVEKIGRRSVASGSSEMMSLPKRRVTILCSATMKMNVQRLGEISLKDAVHIQADPSEQEKQDKANGIEADDKAFSAPTQLKQSYAIVPAKLRLVTLTALLKRAFARKGSVMKAIVFMSCADSVDFHFSLFSRSAEKSAEASEEGKVDPPTLPKSELIKETITHGATISNNSNPVILHKLHGSLAQNIRTATLKAYSESADPCVLICTDVASRGLDLPNVDFVIEYDPPFSAEDHLHRVGRTARAGREGRALIFLMPGTEEEYVSILASGYREGRKALTHHTAEDLIQKGFGGTGREWEERATNFQLEVERWSLDSPRYLEMARRGFQSHIRAYATHVANERHIFNMQELHLGHLAKAFALRDKPGSIKVPGLRPAKMTKADRSVAARKAKRGEKEEEKAPEGERVRKQRKMELDLPTVDSNEVAARMKRKMKEHMSAASEFNIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.08
3 0.1
4 0.12
5 0.12
6 0.14
7 0.15
8 0.23
9 0.28
10 0.29
11 0.38
12 0.46
13 0.56
14 0.62
15 0.66
16 0.64
17 0.68
18 0.75
19 0.71
20 0.71
21 0.67
22 0.68
23 0.71
24 0.75
25 0.71
26 0.7
27 0.7
28 0.69
29 0.71
30 0.72
31 0.69
32 0.69
33 0.71
34 0.72
35 0.69
36 0.68
37 0.65
38 0.6
39 0.6
40 0.57
41 0.57
42 0.54
43 0.58
44 0.53
45 0.49
46 0.46
47 0.41
48 0.36
49 0.3
50 0.26
51 0.19
52 0.17
53 0.16
54 0.19
55 0.19
56 0.17
57 0.15
58 0.15
59 0.23
60 0.33
61 0.36
62 0.43
63 0.52
64 0.62
65 0.7
66 0.77
67 0.78
68 0.76
69 0.81
70 0.8
71 0.76
72 0.69
73 0.63
74 0.54
75 0.46
76 0.41
77 0.33
78 0.24
79 0.18
80 0.16
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.17
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.16
95 0.17
96 0.2
97 0.26
98 0.3
99 0.31
100 0.32
101 0.35
102 0.38
103 0.41
104 0.43
105 0.44
106 0.46
107 0.52
108 0.58
109 0.58
110 0.54
111 0.51
112 0.44
113 0.38
114 0.33
115 0.31
116 0.25
117 0.27
118 0.25
119 0.24
120 0.24
121 0.24
122 0.26
123 0.25
124 0.3
125 0.26
126 0.29
127 0.29
128 0.3
129 0.31
130 0.33
131 0.33
132 0.32
133 0.35
134 0.37
135 0.43
136 0.48
137 0.47
138 0.47
139 0.43
140 0.38
141 0.34
142 0.3
143 0.27
144 0.24
145 0.29
146 0.25
147 0.25
148 0.24
149 0.26
150 0.28
151 0.28
152 0.31
153 0.28
154 0.31
155 0.31
156 0.31
157 0.28
158 0.27
159 0.28
160 0.27
161 0.28
162 0.29
163 0.38
164 0.44
165 0.44
166 0.44
167 0.41
168 0.37
169 0.37
170 0.38
171 0.33
172 0.33
173 0.38
174 0.37
175 0.35
176 0.34
177 0.3
178 0.26
179 0.23
180 0.26
181 0.25
182 0.27
183 0.27
184 0.27
185 0.26
186 0.26
187 0.25
188 0.21
189 0.21
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.2
194 0.19
195 0.2
196 0.22
197 0.17
198 0.18
199 0.22
200 0.22
201 0.22
202 0.24
203 0.23
204 0.2
205 0.2
206 0.2
207 0.17
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.17
213 0.24
214 0.27
215 0.3
216 0.32
217 0.37
218 0.41
219 0.46
220 0.51
221 0.52
222 0.53
223 0.55
224 0.57
225 0.54
226 0.49
227 0.44
228 0.39
229 0.29
230 0.24
231 0.17
232 0.14
233 0.19
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.24
238 0.24
239 0.23
240 0.23
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.15
253 0.12
254 0.13
255 0.17
256 0.2
257 0.22
258 0.21
259 0.22
260 0.22
261 0.24
262 0.23
263 0.19
264 0.19
265 0.17
266 0.22
267 0.23
268 0.22
269 0.21
270 0.22
271 0.21
272 0.19
273 0.2
274 0.15
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.19
342 0.17
343 0.18
344 0.16
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.1
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.14
363 0.15
364 0.2
365 0.26
366 0.34
367 0.41
368 0.47
369 0.47
370 0.47
371 0.5
372 0.49
373 0.45
374 0.38
375 0.31
376 0.27
377 0.24
378 0.2
379 0.15
380 0.11
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.07
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.03
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.03
421 0.05
422 0.07
423 0.08
424 0.11
425 0.14
426 0.15
427 0.15
428 0.16
429 0.16
430 0.17
431 0.17
432 0.15
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.11
437 0.11
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.14
442 0.14
443 0.15
444 0.16
445 0.18
446 0.24
447 0.25
448 0.27
449 0.26
450 0.26
451 0.26
452 0.26
453 0.24
454 0.18
455 0.2
456 0.18
457 0.16
458 0.16
459 0.16
460 0.18
461 0.19
462 0.16
463 0.14
464 0.15
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.12
469 0.11
470 0.11
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.1
476 0.12
477 0.12
478 0.14
479 0.15
480 0.15
481 0.17
482 0.21
483 0.19
484 0.22
485 0.21
486 0.21
487 0.24
488 0.22
489 0.21
490 0.17
491 0.16
492 0.11
493 0.11
494 0.09
495 0.09
496 0.11
497 0.12
498 0.18
499 0.19
500 0.19
501 0.21
502 0.23
503 0.21
504 0.24
505 0.23
506 0.18
507 0.19
508 0.19
509 0.2
510 0.18
511 0.16
512 0.11
513 0.1
514 0.09
515 0.11
516 0.14
517 0.13
518 0.16
519 0.16
520 0.17
521 0.17
522 0.21
523 0.21
524 0.18
525 0.2
526 0.23
527 0.28
528 0.29
529 0.31
530 0.28
531 0.27
532 0.28
533 0.25
534 0.2
535 0.15
536 0.13
537 0.11
538 0.1
539 0.1
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.13
544 0.13
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.13
549 0.13
550 0.13
551 0.12
552 0.13
553 0.14
554 0.15
555 0.16
556 0.14
557 0.14
558 0.15
559 0.12
560 0.13
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.13
565 0.12
566 0.12
567 0.12
568 0.14
569 0.17
570 0.18
571 0.2
572 0.2
573 0.24
574 0.27
575 0.27
576 0.27
577 0.25
578 0.23
579 0.25
580 0.26
581 0.22
582 0.19
583 0.17
584 0.16
585 0.15
586 0.18
587 0.17
588 0.14
589 0.15
590 0.15
591 0.15
592 0.13
593 0.15
594 0.16
595 0.14
596 0.14
597 0.14
598 0.16
599 0.16
600 0.19
601 0.19
602 0.21
603 0.25
604 0.27
605 0.27
606 0.26
607 0.27
608 0.24
609 0.23
610 0.18
611 0.17
612 0.15
613 0.14
614 0.15
615 0.15
616 0.16
617 0.17
618 0.17
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.12
623 0.11
624 0.09
625 0.08
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.1
630 0.09
631 0.09
632 0.11
633 0.12
634 0.11
635 0.11
636 0.11
637 0.12
638 0.11
639 0.11
640 0.08
641 0.08
642 0.11
643 0.12
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.12
648 0.12
649 0.12
650 0.11
651 0.13
652 0.16
653 0.21
654 0.24
655 0.24
656 0.23
657 0.26
658 0.28
659 0.29
660 0.32
661 0.32
662 0.31
663 0.38
664 0.4
665 0.38
666 0.41
667 0.38
668 0.32
669 0.29
670 0.27
671 0.19
672 0.18
673 0.16
674 0.1
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.09
682 0.09
683 0.08
684 0.08
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.07
689 0.11
690 0.12
691 0.13
692 0.14
693 0.16
694 0.19
695 0.22
696 0.27
697 0.32
698 0.32
699 0.33
700 0.34
701 0.34
702 0.31
703 0.34
704 0.29
705 0.2
706 0.18
707 0.17
708 0.14
709 0.14
710 0.15
711 0.13
712 0.11
713 0.16
714 0.22
715 0.23
716 0.24
717 0.24
718 0.27
719 0.25
720 0.3
721 0.28
722 0.23
723 0.22
724 0.24
725 0.25
726 0.22
727 0.24
728 0.2
729 0.17
730 0.17
731 0.18
732 0.19
733 0.18
734 0.22
735 0.2
736 0.21
737 0.22
738 0.22
739 0.26
740 0.32
741 0.37
742 0.34
743 0.35
744 0.34
745 0.35
746 0.4
747 0.44
748 0.4
749 0.38
750 0.38
751 0.35
752 0.38
753 0.44
754 0.4
755 0.36
756 0.36
757 0.33
758 0.36
759 0.39
760 0.35
761 0.29
762 0.28
763 0.25
764 0.22
765 0.26
766 0.22
767 0.24
768 0.23
769 0.24
770 0.26
771 0.25
772 0.24
773 0.21
774 0.2
775 0.15
776 0.17
777 0.15
778 0.17
779 0.19
780 0.22
781 0.22
782 0.25
783 0.28
784 0.31
785 0.34
786 0.32
787 0.36
788 0.39
789 0.43
790 0.48
791 0.5
792 0.46
793 0.46
794 0.49
795 0.49
796 0.53
797 0.51
798 0.51
799 0.54
800 0.55
801 0.55
802 0.57
803 0.57
804 0.56
805 0.61
806 0.59
807 0.58
808 0.65
809 0.68
810 0.69
811 0.68
812 0.7
813 0.69
814 0.71
815 0.72
816 0.7
817 0.66
818 0.6
819 0.55
820 0.53
821 0.48
822 0.5
823 0.51
824 0.56
825 0.61
826 0.65
827 0.69
828 0.69
829 0.74
830 0.73
831 0.72
832 0.7
833 0.68
834 0.64
835 0.63
836 0.56
837 0.48
838 0.39
839 0.31
840 0.23
841 0.18
842 0.17
843 0.16
844 0.19
845 0.22
846 0.3
847 0.38
848 0.44
849 0.49
850 0.58
851 0.63
852 0.68
853 0.7
854 0.7
855 0.67
856 0.64
857 0.59