Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7EX05

Protein Details
Accession A7EX05    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-332QPPSRASRPPPRKVIKPISPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
392-400NRGPKKPRR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ssl:SS1G_09864  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MGEIGASSLLKIAKAACIKAAPGLTDIGDVHYELIRPILKTAVINPEQLHIIELNSPQIKGQDAELWKAFIARDIPNWRTKNYVPRDPTKWYEVYQKYKIEHEVEIARDRENLKNSMNALQQRKQDHVSKFVDIRALPKIPRDYGMRPNNGGVPLTKGRGLQGAAPSSLSWGAGSRTKMKDGTSVLTRARREAKEMSQRSKLSTPTSMLSGRLGQVKKAPAGMAQGYKIANQPGLRVLARHRSSGRSSASVSGPSLEDREQRLRDAMAGKKRDHNDNKETLVGSPPPRSPSSPNYQNFDDDAADLFDDEEELQPPSRASRPPPRKVIKPISPSARLSSSPPPYNGASKPFDVISSLVQKSNNSFSPASSSRSATPKPMMPVRKRPANVDIFNRGPKKPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.22
4 0.23
5 0.23
6 0.27
7 0.27
8 0.22
9 0.19
10 0.2
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.14
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.14
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.16
26 0.17
27 0.17
28 0.22
29 0.27
30 0.27
31 0.29
32 0.29
33 0.29
34 0.28
35 0.27
36 0.24
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.15
41 0.2
42 0.2
43 0.2
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.17
48 0.19
49 0.19
50 0.2
51 0.24
52 0.24
53 0.24
54 0.22
55 0.23
56 0.21
57 0.17
58 0.19
59 0.16
60 0.23
61 0.29
62 0.33
63 0.41
64 0.43
65 0.41
66 0.44
67 0.46
68 0.49
69 0.5
70 0.56
71 0.53
72 0.58
73 0.62
74 0.62
75 0.62
76 0.58
77 0.52
78 0.45
79 0.49
80 0.5
81 0.53
82 0.53
83 0.54
84 0.5
85 0.51
86 0.53
87 0.46
88 0.39
89 0.35
90 0.32
91 0.3
92 0.33
93 0.31
94 0.26
95 0.26
96 0.28
97 0.29
98 0.29
99 0.29
100 0.25
101 0.28
102 0.29
103 0.31
104 0.34
105 0.36
106 0.38
107 0.4
108 0.45
109 0.44
110 0.45
111 0.45
112 0.47
113 0.43
114 0.45
115 0.42
116 0.41
117 0.4
118 0.38
119 0.37
120 0.29
121 0.29
122 0.25
123 0.25
124 0.22
125 0.26
126 0.28
127 0.25
128 0.28
129 0.3
130 0.3
131 0.38
132 0.45
133 0.43
134 0.41
135 0.41
136 0.4
137 0.36
138 0.32
139 0.22
140 0.19
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.17
148 0.15
149 0.16
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.1
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.1
161 0.12
162 0.17
163 0.19
164 0.21
165 0.22
166 0.22
167 0.25
168 0.23
169 0.25
170 0.21
171 0.23
172 0.24
173 0.28
174 0.27
175 0.27
176 0.31
177 0.29
178 0.3
179 0.31
180 0.35
181 0.41
182 0.46
183 0.47
184 0.47
185 0.47
186 0.46
187 0.45
188 0.4
189 0.32
190 0.29
191 0.26
192 0.2
193 0.22
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.14
198 0.13
199 0.18
200 0.17
201 0.15
202 0.18
203 0.2
204 0.19
205 0.19
206 0.18
207 0.13
208 0.15
209 0.16
210 0.14
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.13
220 0.12
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.16
225 0.24
226 0.25
227 0.28
228 0.28
229 0.29
230 0.32
231 0.37
232 0.36
233 0.29
234 0.29
235 0.28
236 0.28
237 0.25
238 0.22
239 0.17
240 0.15
241 0.13
242 0.14
243 0.12
244 0.14
245 0.18
246 0.24
247 0.24
248 0.25
249 0.25
250 0.24
251 0.25
252 0.28
253 0.3
254 0.32
255 0.36
256 0.37
257 0.43
258 0.46
259 0.53
260 0.56
261 0.57
262 0.57
263 0.57
264 0.57
265 0.52
266 0.49
267 0.4
268 0.35
269 0.31
270 0.27
271 0.26
272 0.26
273 0.28
274 0.29
275 0.31
276 0.33
277 0.35
278 0.42
279 0.48
280 0.5
281 0.51
282 0.5
283 0.49
284 0.45
285 0.4
286 0.31
287 0.21
288 0.18
289 0.13
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.13
303 0.17
304 0.2
305 0.26
306 0.36
307 0.46
308 0.54
309 0.64
310 0.68
311 0.72
312 0.78
313 0.81
314 0.79
315 0.76
316 0.76
317 0.73
318 0.72
319 0.66
320 0.6
321 0.54
322 0.45
323 0.43
324 0.44
325 0.44
326 0.43
327 0.42
328 0.42
329 0.41
330 0.45
331 0.44
332 0.41
333 0.37
334 0.33
335 0.34
336 0.31
337 0.28
338 0.24
339 0.22
340 0.21
341 0.24
342 0.25
343 0.26
344 0.27
345 0.28
346 0.3
347 0.35
348 0.33
349 0.31
350 0.3
351 0.28
352 0.35
353 0.36
354 0.37
355 0.34
356 0.34
357 0.34
358 0.41
359 0.42
360 0.4
361 0.42
362 0.43
363 0.47
364 0.53
365 0.58
366 0.59
367 0.68
368 0.72
369 0.76
370 0.73
371 0.72
372 0.72
373 0.72
374 0.69
375 0.66
376 0.65
377 0.61
378 0.67
379 0.66
380 0.61