Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5GAQ7

Protein Details
Accession M5GAQ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
427-449GGEDDQPKKKKKKEGPGVAARNMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
433-444PKKKKKKEGPGV
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 7, cyto_nucl 6.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSRQQASKRPKLDGGLALPQQSTGWPTTVGTPARVHTPGQPANGGLALPAGGVTGYTRAQWTTVQPTQVQQQMDPTIDPALQAAAYPQAMTTSPPLQRSASSASQPNASQPQAVPRLTAAEQAAWDEYVRKYYEYYGAPPPAPTPSGTQTPAVTAAAYQQQSTAAAYQVYQQRVASQQSQSSQSQSSQPAQQESQQSAQSSQSALQQPAYSQYAQQLFQQQQQQQAHAQYALPGTGVRRGRPVAQKPENKETINDALGSAGVDLRAEEDAIHRTYDAVPGSYPAVLNPRDDRTRKQTFIPPNAMMKRVNGIASGYSVKNVTSDASSYIALAAQAHISTLLRGALAASKNRQLAATGVMRPPGLYPQPAASEEDSLAPPLPMWSQEVTRDVGKQLAAIERVQRANELQARLKKREREDAANGANGEAGGEDDQPKKKKKKEGPGVAARNMSEGVRKRLSDAVAMRAAGNASSKYSWLQAGAAAAQGPIQPLKKLNKNKEKDAEAAPAPAASSTVATAKTKGPAGGWGRAYQNLKEEAKDNRRKVEVRDVIWAMEGRAGSGIPSGGEKGVGRGGRGGTRWRGWEAWSRIRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.49
4 0.45
5 0.4
6 0.36
7 0.3
8 0.25
9 0.22
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.18
15 0.24
16 0.25
17 0.25
18 0.26
19 0.26
20 0.31
21 0.31
22 0.3
23 0.29
24 0.37
25 0.38
26 0.39
27 0.39
28 0.33
29 0.33
30 0.32
31 0.26
32 0.16
33 0.12
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.04
39 0.04
40 0.05
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.14
48 0.19
49 0.25
50 0.28
51 0.31
52 0.31
53 0.34
54 0.38
55 0.41
56 0.38
57 0.29
58 0.31
59 0.31
60 0.31
61 0.28
62 0.23
63 0.2
64 0.18
65 0.18
66 0.12
67 0.1
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.14
79 0.18
80 0.21
81 0.23
82 0.26
83 0.26
84 0.26
85 0.29
86 0.32
87 0.3
88 0.3
89 0.33
90 0.32
91 0.34
92 0.34
93 0.35
94 0.33
95 0.29
96 0.27
97 0.23
98 0.3
99 0.33
100 0.33
101 0.29
102 0.24
103 0.28
104 0.26
105 0.29
106 0.21
107 0.16
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.17
120 0.23
121 0.22
122 0.26
123 0.29
124 0.31
125 0.31
126 0.3
127 0.29
128 0.26
129 0.25
130 0.22
131 0.19
132 0.2
133 0.24
134 0.25
135 0.26
136 0.23
137 0.23
138 0.23
139 0.19
140 0.15
141 0.1
142 0.11
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.15
150 0.13
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.13
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.2
160 0.23
161 0.26
162 0.25
163 0.22
164 0.24
165 0.26
166 0.3
167 0.29
168 0.29
169 0.27
170 0.24
171 0.27
172 0.27
173 0.27
174 0.27
175 0.29
176 0.29
177 0.29
178 0.32
179 0.31
180 0.3
181 0.3
182 0.28
183 0.27
184 0.24
185 0.24
186 0.21
187 0.17
188 0.16
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.21
196 0.22
197 0.16
198 0.13
199 0.17
200 0.19
201 0.19
202 0.21
203 0.24
204 0.23
205 0.28
206 0.34
207 0.31
208 0.37
209 0.37
210 0.37
211 0.34
212 0.33
213 0.3
214 0.24
215 0.22
216 0.15
217 0.14
218 0.12
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.13
223 0.15
224 0.14
225 0.16
226 0.18
227 0.24
228 0.32
229 0.38
230 0.43
231 0.5
232 0.56
233 0.59
234 0.65
235 0.64
236 0.56
237 0.5
238 0.43
239 0.37
240 0.32
241 0.26
242 0.18
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.08
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.12
263 0.11
264 0.09
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.17
276 0.23
277 0.25
278 0.28
279 0.32
280 0.38
281 0.39
282 0.4
283 0.44
284 0.46
285 0.5
286 0.51
287 0.45
288 0.45
289 0.45
290 0.43
291 0.36
292 0.29
293 0.24
294 0.2
295 0.18
296 0.12
297 0.11
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.08
331 0.1
332 0.12
333 0.13
334 0.17
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.15
339 0.14
340 0.16
341 0.18
342 0.17
343 0.17
344 0.18
345 0.17
346 0.17
347 0.17
348 0.16
349 0.14
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.16
354 0.17
355 0.18
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.13
372 0.15
373 0.16
374 0.17
375 0.17
376 0.15
377 0.16
378 0.14
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.17
385 0.2
386 0.21
387 0.2
388 0.19
389 0.17
390 0.22
391 0.26
392 0.26
393 0.28
394 0.35
395 0.4
396 0.46
397 0.52
398 0.53
399 0.53
400 0.59
401 0.58
402 0.58
403 0.58
404 0.6
405 0.56
406 0.51
407 0.46
408 0.36
409 0.31
410 0.23
411 0.17
412 0.09
413 0.07
414 0.05
415 0.06
416 0.09
417 0.13
418 0.2
419 0.27
420 0.36
421 0.44
422 0.51
423 0.6
424 0.67
425 0.74
426 0.79
427 0.83
428 0.84
429 0.86
430 0.85
431 0.79
432 0.71
433 0.6
434 0.5
435 0.4
436 0.3
437 0.26
438 0.24
439 0.27
440 0.28
441 0.29
442 0.3
443 0.33
444 0.34
445 0.34
446 0.32
447 0.31
448 0.29
449 0.29
450 0.26
451 0.23
452 0.22
453 0.16
454 0.16
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.12
460 0.14
461 0.14
462 0.13
463 0.13
464 0.11
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.11
474 0.12
475 0.13
476 0.19
477 0.28
478 0.37
479 0.46
480 0.56
481 0.64
482 0.69
483 0.77
484 0.79
485 0.75
486 0.7
487 0.64
488 0.6
489 0.5
490 0.45
491 0.36
492 0.28
493 0.24
494 0.19
495 0.15
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.09
500 0.12
501 0.13
502 0.15
503 0.17
504 0.2
505 0.21
506 0.21
507 0.2
508 0.25
509 0.29
510 0.34
511 0.34
512 0.34
513 0.34
514 0.4
515 0.42
516 0.36
517 0.37
518 0.38
519 0.37
520 0.35
521 0.37
522 0.42
523 0.49
524 0.58
525 0.57
526 0.57
527 0.63
528 0.64
529 0.66
530 0.67
531 0.64
532 0.56
533 0.59
534 0.53
535 0.46
536 0.45
537 0.4
538 0.29
539 0.24
540 0.21
541 0.14
542 0.13
543 0.12
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.07
548 0.09
549 0.1
550 0.09
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.19
555 0.19
556 0.19
557 0.21
558 0.24
559 0.26
560 0.3
561 0.35
562 0.36
563 0.4
564 0.43
565 0.44
566 0.43
567 0.42
568 0.49
569 0.5