Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5GA20

Protein Details
Accession M5GA20    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-124HGITPPLKWVRKRRFRKRINRMTIESVHydrophilic
320-342RAQREEMRRGREERRRVRREVKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-115VRKRRFRKR
319-342RRAQREEMRRGREERRRVRREVKK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MRKRVQRKDVGEDVWFRFKDSRRAMFHLGTQTYPAKLVDLPSIIESQKTLNSRQLYKTADICQMLLVEPQALDSTNLGTGAGGGGEKSFNLEEFIYPHGITPPLKWVRKRRFRKRINRMTIESVEQEVERLLEVDAKALEVEFDILENVDPDMSDSEFEPRAMDAATPGSAMGEDGYAESGTGRPGEDGEEEEEDEMDMELAAEIDRAFEEEAASDSEEEVGGQREVGESESETGSEEESEEEEYESDESGEEDEEEEEAEEADAGGERQRRRLLAEEIADLERACERKAAEVARAGNPVIKKRLEDVLGKLTRDLEMRRAQREEMRRGREERRRVRREVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.51
3 0.45
4 0.44
5 0.45
6 0.5
7 0.53
8 0.57
9 0.54
10 0.61
11 0.64
12 0.6
13 0.61
14 0.59
15 0.52
16 0.44
17 0.41
18 0.37
19 0.32
20 0.31
21 0.25
22 0.18
23 0.17
24 0.19
25 0.18
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.2
30 0.19
31 0.18
32 0.16
33 0.15
34 0.19
35 0.21
36 0.22
37 0.26
38 0.32
39 0.36
40 0.39
41 0.44
42 0.43
43 0.43
44 0.46
45 0.43
46 0.43
47 0.39
48 0.35
49 0.29
50 0.25
51 0.22
52 0.18
53 0.14
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.21
90 0.28
91 0.33
92 0.39
93 0.49
94 0.58
95 0.68
96 0.78
97 0.8
98 0.83
99 0.89
100 0.93
101 0.94
102 0.94
103 0.93
104 0.89
105 0.82
106 0.78
107 0.69
108 0.6
109 0.5
110 0.39
111 0.3
112 0.22
113 0.18
114 0.11
115 0.09
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.04
128 0.05
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.08
254 0.13
255 0.14
256 0.19
257 0.22
258 0.23
259 0.27
260 0.32
261 0.33
262 0.35
263 0.36
264 0.33
265 0.33
266 0.33
267 0.3
268 0.24
269 0.2
270 0.17
271 0.15
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.18
276 0.23
277 0.25
278 0.25
279 0.29
280 0.33
281 0.34
282 0.35
283 0.31
284 0.29
285 0.31
286 0.33
287 0.34
288 0.32
289 0.3
290 0.32
291 0.38
292 0.38
293 0.38
294 0.37
295 0.42
296 0.44
297 0.43
298 0.4
299 0.35
300 0.33
301 0.33
302 0.3
303 0.28
304 0.33
305 0.39
306 0.44
307 0.46
308 0.48
309 0.53
310 0.59
311 0.62
312 0.63
313 0.65
314 0.65
315 0.69
316 0.75
317 0.77
318 0.78
319 0.79
320 0.8
321 0.8
322 0.83