Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5G6T2

Protein Details
Accession M5G6T2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
473-492VLRRWREGKGGRRAEKRAARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
464-464R
466-466R
473-492VLRRWREGKGGRRAEKRAAR
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10.5, nucl 8.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
Amino Acid Sequences MAQANLAKYDTWSRLQLIARLNELDIQKEKAENEKDLTAKARELPRPYVVSSRPKRKIALKFCYHGWEYCGLEKQKGYTPIPTVESVLESALIATRLIDPVEGFEGAGYGKSGRTDRGVSAAGQVVSLWVRSMVAGGANDGERKEAEEVNLALDDEEVDDSFEPLTESMELVSQLLAEQDTPEVLVDDTQHLLPTEGEIPYARVLNRVLPPSIRVLAWSPVHSDFEARFSCIGRHYKYFFRLHPGLDLSRMRDAAARMKGTHDWRNFCRLDGSKGDVRYVRTIEDVTLEPVAKDEDPTLYVLNVQGHGFLWHQIRHIAAVLFLVGQGLEHPSVVTSMLNTDQSNPLPPFREDEPLPEIVEGKPNYEMADALPLVLWDCRYSDEDLNWIPDEPGYSQGFVQSLETTYTQSLMQSTILSYFTRAAELRPPPVSASAGEFGRRDCVLLDMGAGRFKVNIKYKPLLKRERGSTPDEVLRRWREGKGGRRAEKRAARAEQDEMRETGDGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.39
4 0.4
5 0.39
6 0.38
7 0.37
8 0.35
9 0.34
10 0.32
11 0.32
12 0.27
13 0.27
14 0.26
15 0.28
16 0.29
17 0.33
18 0.36
19 0.35
20 0.36
21 0.38
22 0.38
23 0.38
24 0.41
25 0.35
26 0.33
27 0.36
28 0.4
29 0.41
30 0.45
31 0.48
32 0.49
33 0.5
34 0.5
35 0.51
36 0.5
37 0.54
38 0.59
39 0.64
40 0.66
41 0.67
42 0.71
43 0.72
44 0.76
45 0.75
46 0.76
47 0.72
48 0.68
49 0.66
50 0.67
51 0.6
52 0.51
53 0.43
54 0.38
55 0.33
56 0.34
57 0.39
58 0.33
59 0.34
60 0.34
61 0.34
62 0.36
63 0.4
64 0.38
65 0.35
66 0.37
67 0.38
68 0.4
69 0.38
70 0.32
71 0.26
72 0.25
73 0.2
74 0.16
75 0.13
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.15
102 0.17
103 0.17
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.21
108 0.22
109 0.18
110 0.16
111 0.15
112 0.12
113 0.11
114 0.1
115 0.08
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.09
128 0.1
129 0.08
130 0.1
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.15
193 0.18
194 0.19
195 0.19
196 0.17
197 0.19
198 0.2
199 0.2
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.12
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.18
219 0.22
220 0.2
221 0.23
222 0.26
223 0.29
224 0.35
225 0.38
226 0.34
227 0.37
228 0.36
229 0.33
230 0.32
231 0.31
232 0.25
233 0.25
234 0.24
235 0.19
236 0.18
237 0.18
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.18
242 0.2
243 0.2
244 0.18
245 0.2
246 0.24
247 0.27
248 0.33
249 0.31
250 0.33
251 0.34
252 0.41
253 0.4
254 0.36
255 0.37
256 0.31
257 0.3
258 0.28
259 0.3
260 0.26
261 0.26
262 0.28
263 0.25
264 0.25
265 0.24
266 0.22
267 0.18
268 0.16
269 0.16
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.11
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.11
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.04
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.13
329 0.14
330 0.19
331 0.19
332 0.2
333 0.21
334 0.21
335 0.24
336 0.23
337 0.27
338 0.23
339 0.26
340 0.28
341 0.26
342 0.26
343 0.22
344 0.21
345 0.17
346 0.23
347 0.19
348 0.17
349 0.16
350 0.16
351 0.17
352 0.16
353 0.15
354 0.09
355 0.13
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.06
364 0.07
365 0.09
366 0.11
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.21
371 0.21
372 0.24
373 0.22
374 0.2
375 0.17
376 0.15
377 0.16
378 0.13
379 0.16
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.16
384 0.16
385 0.14
386 0.15
387 0.11
388 0.1
389 0.12
390 0.12
391 0.13
392 0.12
393 0.13
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.13
406 0.13
407 0.15
408 0.15
409 0.15
410 0.22
411 0.25
412 0.29
413 0.29
414 0.29
415 0.28
416 0.3
417 0.29
418 0.22
419 0.23
420 0.21
421 0.21
422 0.22
423 0.21
424 0.2
425 0.22
426 0.21
427 0.17
428 0.14
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.14
433 0.13
434 0.14
435 0.16
436 0.15
437 0.13
438 0.14
439 0.17
440 0.24
441 0.3
442 0.35
443 0.41
444 0.48
445 0.56
446 0.64
447 0.72
448 0.74
449 0.74
450 0.76
451 0.76
452 0.77
453 0.74
454 0.7
455 0.65
456 0.61
457 0.6
458 0.54
459 0.5
460 0.49
461 0.5
462 0.51
463 0.5
464 0.46
465 0.47
466 0.54
467 0.61
468 0.63
469 0.68
470 0.7
471 0.75
472 0.79
473 0.8
474 0.79
475 0.78
476 0.76
477 0.73
478 0.7
479 0.65
480 0.66
481 0.63
482 0.6
483 0.55
484 0.46
485 0.41
486 0.35