Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5G627

Protein Details
Accession M5G627    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28SQTSQPGVPRGKKRESPKGKSWIDHydrophilic
330-351KTSSTTRTTKRQLKPVKVDWSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-25RGKKRESPKGKS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MDLSSQTSQPGVPRGKKRESPKGKSWIDPSERVLKKSRLEDGGEKPALIDDEAEIPTGSLSSMRISSSPSPVSSGMNEAETKELCPFCDEPWPERPSKRLTELLKQVKPRAWKDPRYSNPDGLSAPLEIFVSLCTLHRSETSHIPEGIAQGWPTTLDFNRIPKRLEQRKDSLKAIISSPSASPFFQAAKNDIFEKGTRVAGSVFGQYETFERCQPGYYGEQGMITIQRALMFMFPNMVASNTRPLSVDDFIRQVLVPEAAILLIRQDLQLSRAKALQVLLKSRKYGLAQFPDRDGGETQWQDNNHARVHRLQNSPSLHTFPDDTISPVIKTSSTTRTTKRQLKPVKVDWSYKFRDNDTASSSCPNEESVEIVDITESPLRPPTSRKDGHGDRWPLGSSDEETFHLRKPKLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.65
3 0.72
4 0.78
5 0.8
6 0.82
7 0.82
8 0.82
9 0.84
10 0.79
11 0.78
12 0.75
13 0.74
14 0.7
15 0.66
16 0.61
17 0.61
18 0.59
19 0.57
20 0.58
21 0.54
22 0.54
23 0.55
24 0.58
25 0.52
26 0.54
27 0.58
28 0.57
29 0.6
30 0.54
31 0.47
32 0.4
33 0.36
34 0.32
35 0.24
36 0.18
37 0.09
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.15
53 0.18
54 0.23
55 0.25
56 0.23
57 0.25
58 0.26
59 0.27
60 0.23
61 0.23
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.16
66 0.18
67 0.17
68 0.17
69 0.18
70 0.18
71 0.16
72 0.2
73 0.2
74 0.18
75 0.27
76 0.29
77 0.29
78 0.36
79 0.41
80 0.41
81 0.43
82 0.46
83 0.44
84 0.47
85 0.48
86 0.47
87 0.47
88 0.51
89 0.59
90 0.63
91 0.62
92 0.61
93 0.61
94 0.57
95 0.61
96 0.56
97 0.57
98 0.57
99 0.6
100 0.64
101 0.7
102 0.74
103 0.74
104 0.75
105 0.68
106 0.61
107 0.55
108 0.47
109 0.37
110 0.31
111 0.22
112 0.17
113 0.13
114 0.11
115 0.08
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.13
126 0.16
127 0.23
128 0.28
129 0.3
130 0.29
131 0.29
132 0.28
133 0.26
134 0.24
135 0.17
136 0.11
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.11
144 0.13
145 0.21
146 0.28
147 0.3
148 0.31
149 0.35
150 0.45
151 0.5
152 0.55
153 0.53
154 0.55
155 0.62
156 0.64
157 0.6
158 0.53
159 0.46
160 0.41
161 0.36
162 0.3
163 0.21
164 0.18
165 0.17
166 0.16
167 0.15
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.13
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.17
233 0.18
234 0.18
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.14
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.09
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.19
263 0.2
264 0.19
265 0.26
266 0.31
267 0.31
268 0.32
269 0.32
270 0.34
271 0.32
272 0.35
273 0.35
274 0.38
275 0.41
276 0.42
277 0.43
278 0.42
279 0.4
280 0.35
281 0.28
282 0.21
283 0.23
284 0.23
285 0.23
286 0.24
287 0.24
288 0.27
289 0.31
290 0.32
291 0.29
292 0.29
293 0.3
294 0.34
295 0.42
296 0.46
297 0.45
298 0.44
299 0.48
300 0.5
301 0.53
302 0.47
303 0.42
304 0.34
305 0.31
306 0.3
307 0.23
308 0.22
309 0.18
310 0.17
311 0.17
312 0.18
313 0.16
314 0.15
315 0.16
316 0.13
317 0.15
318 0.17
319 0.22
320 0.26
321 0.32
322 0.36
323 0.45
324 0.55
325 0.63
326 0.66
327 0.69
328 0.73
329 0.78
330 0.82
331 0.82
332 0.82
333 0.77
334 0.78
335 0.73
336 0.72
337 0.67
338 0.65
339 0.59
340 0.52
341 0.54
342 0.5
343 0.49
344 0.46
345 0.43
346 0.37
347 0.39
348 0.37
349 0.3
350 0.27
351 0.24
352 0.19
353 0.18
354 0.18
355 0.15
356 0.16
357 0.15
358 0.14
359 0.13
360 0.11
361 0.13
362 0.15
363 0.13
364 0.13
365 0.19
366 0.22
367 0.24
368 0.29
369 0.36
370 0.42
371 0.46
372 0.5
373 0.54
374 0.6
375 0.66
376 0.71
377 0.68
378 0.6
379 0.59
380 0.55
381 0.46
382 0.39
383 0.33
384 0.26
385 0.24
386 0.24
387 0.22
388 0.26
389 0.27
390 0.31
391 0.37