FuNGI

M5G3B9

Protein Details

Accession

M5G3B9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-115	GWEGSAKRGTKRKRSLEPERTITS	Hydrophilic
513-541	MLDLPKPSKLKKRELKRHPIERKDIARAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
98-105	KRGTKRKR
518-556	KPSKLKKRELKRHPIERKDIARAAGAGVGRNLANKKRDM
559-566	ASKRRKTE

Subcellular Location(s)

cyto 10, nucl 8.5, mito_nucl 8, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044764 DDX52/Rok1_DEADc IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17957 DEADc_DDX52 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MDAFALLSRGGTQFDKRRFNKEVNLFSGHKKHAETVASTSHTTDEFPEELDFFKYAESGVLGTKGEGAANGKSRAADSERTVGVERQSQGSGWEGSAKRGTKRKRSLEPERTITSARRVRCTGESVPTPIHSFVSLQDRYGLAPELRKNIAEKGYLTPTDVQTQCIPVLLEKRDLAAIAPTGSGKTLAYLLPVFCLLGAPGRSGASEKQAGARALIVSPTRELAMQIHNEALKLAKGRKWKVVVLNKATGNALRDKAARKKVDLLITTPLSLVSALDEGILNLDNIRHLILDEADRLLEEGFLKQIEAILAACSYPEIQKAVFSATLPAAVEAIANTFLRRPIRVIVGVKDSATDTIHQELLFCGSEIGKLQALRNLVVEGIQPPVLIFVQSIERAQELFHELLYDGLNVDVVHSERTKAQREDAVRRFRKGEVWVLIATELMARGMDFKGVNLVVNYDFPQTVQSYIHRIGRTGRAGRQGKAVTYFTKEDAPYVKSVANVLKASGQDVPQYMLDLPKPSKLKKRELKRHPIERKDIARAAGAGVGRNLANKKRDMICASKRRKTEPAGDKGGKGDSVVRRQVVLTEDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.5
3	0.52
4	0.6
5	0.63
6	0.67
7	0.69
8	0.7
9	0.7
10	0.65
11	0.68
12	0.62
13	0.63
14	0.64
15	0.58
16	0.52
17	0.46
18	0.43
19	0.43
20	0.44
21	0.39
22	0.36
23	0.39
24	0.38
25	0.36
26	0.34
27	0.29
28	0.26
29	0.24
30	0.21
31	0.19
32	0.16
33	0.17
34	0.17
35	0.16
36	0.17
37	0.19
38	0.17
39	0.12
40	0.12
41	0.11
42	0.1
43	0.1
44	0.09
45	0.08
46	0.08
47	0.1
48	0.1
49	0.1
50	0.11
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.12
55	0.14
56	0.19
57	0.21
58	0.21
59	0.21
60	0.21
61	0.24
62	0.26
63	0.26
64	0.25
65	0.29
66	0.29
67	0.3
68	0.32
69	0.3
70	0.28
71	0.3
72	0.28
73	0.25
74	0.25
75	0.23
76	0.22
77	0.23
78	0.21
79	0.15
80	0.22
81	0.2
82	0.23
83	0.29
84	0.31
85	0.35
86	0.43
87	0.52
88	0.54
89	0.64
90	0.7
91	0.74
92	0.81
93	0.85
94	0.87
95	0.86
96	0.82
97	0.75
98	0.69
99	0.61
100	0.54
101	0.52
102	0.47
103	0.42
104	0.42
105	0.4
106	0.41
107	0.42
108	0.45
109	0.4
110	0.41
111	0.4
112	0.37
113	0.37
114	0.35
115	0.33
116	0.28
117	0.24
118	0.18
119	0.16
120	0.16
121	0.23
122	0.22
123	0.2
124	0.21
125	0.2
126	0.2
127	0.21
128	0.2
129	0.13
130	0.18
131	0.21
132	0.24
133	0.25
134	0.25
135	0.26
136	0.28
137	0.3
138	0.26
139	0.25
140	0.25
141	0.29
142	0.28
143	0.28
144	0.26
145	0.24
146	0.3
147	0.28
148	0.26
149	0.23
150	0.24
151	0.22
152	0.2
153	0.19
154	0.13
155	0.19
156	0.18
157	0.2
158	0.18
159	0.19
160	0.18
161	0.18
162	0.16
163	0.12
164	0.11
165	0.08
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.06
172	0.06
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.08
181	0.07
182	0.07
183	0.05
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.12
192	0.13
193	0.14
194	0.14
195	0.17
196	0.2
197	0.2
198	0.19
199	0.19
200	0.15
201	0.13
202	0.15
203	0.13
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.14
215	0.14
216	0.14
217	0.14
218	0.12
219	0.09
220	0.11
221	0.13
222	0.15
223	0.23
224	0.26
225	0.32
226	0.35
227	0.38
228	0.44
229	0.5
230	0.54
231	0.51
232	0.53
233	0.48
234	0.45
235	0.42
236	0.33
237	0.27
238	0.22
239	0.18
240	0.14
241	0.17
242	0.21
243	0.28
244	0.35
245	0.35
246	0.33
247	0.38
248	0.41
249	0.44
250	0.4
251	0.34
252	0.31
253	0.3
254	0.28
255	0.22
256	0.17
257	0.12
258	0.11
259	0.09
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.05
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.08
313	0.09
314	0.08
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.09
326	0.1
327	0.11
328	0.12
329	0.13
330	0.15
331	0.19
332	0.21
333	0.21
334	0.23
335	0.23
336	0.22
337	0.2
338	0.18
339	0.15
340	0.13
341	0.12
342	0.09
343	0.11
344	0.12
345	0.11
346	0.11
347	0.1
348	0.12
349	0.11
350	0.09
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.09
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.12
360	0.13
361	0.13
362	0.13
363	0.12
364	0.1
365	0.1
366	0.1
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.07
371	0.06
372	0.08
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.08
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.09
390	0.1
391	0.11
392	0.09
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.08
401	0.08
402	0.1
403	0.14
404	0.19
405	0.26
406	0.26
407	0.29
408	0.32
409	0.38
410	0.47
411	0.51
412	0.57
413	0.55
414	0.56
415	0.56
416	0.51
417	0.5
418	0.44
419	0.43
420	0.35
421	0.35
422	0.32
423	0.3
424	0.28
425	0.23
426	0.19
427	0.11
428	0.08
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.06
433	0.06
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.11
438	0.12
439	0.13
440	0.11
441	0.13
442	0.11
443	0.12
444	0.14
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.14
452	0.15
453	0.19
454	0.23
455	0.29
456	0.26
457	0.27
458	0.3
459	0.35
460	0.41
461	0.41
462	0.42
463	0.46
464	0.49
465	0.5
466	0.53
467	0.48
468	0.42
469	0.42
470	0.4
471	0.32
472	0.33
473	0.34
474	0.28
475	0.31
476	0.29
477	0.27
478	0.28
479	0.28
480	0.25
481	0.25
482	0.24
483	0.2
484	0.23
485	0.23
486	0.25
487	0.22
488	0.22
489	0.23
490	0.22
491	0.23
492	0.23
493	0.2
494	0.18
495	0.19
496	0.2
497	0.17
498	0.18
499	0.17
500	0.17
501	0.18
502	0.21
503	0.22
504	0.27
505	0.33
506	0.38
507	0.47
508	0.52
509	0.61
510	0.65
511	0.75
512	0.79
513	0.84
514	0.89
515	0.89
516	0.93
517	0.92
518	0.92
519	0.89
520	0.88
521	0.84
522	0.81
523	0.74
524	0.64
525	0.56
526	0.47
527	0.39
528	0.33
529	0.27
530	0.19
531	0.16
532	0.16
533	0.14
534	0.18
535	0.23
536	0.26
537	0.3
538	0.32
539	0.38
540	0.41
541	0.48
542	0.49
543	0.53
544	0.57
545	0.63
546	0.71
547	0.71
548	0.72
549	0.72
550	0.74
551	0.72
552	0.72
553	0.71
554	0.71
555	0.73
556	0.71
557	0.66
558	0.61
559	0.56
560	0.46
561	0.37
562	0.35
563	0.33
564	0.39
565	0.43
566	0.41
567	0.4
568	0.4
569	0.42

M5G3B9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer