FuNGI

M5G8M7

Protein Details

Accession

M5G8M7

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
13-43	PMEFRPLGRRAQPNRPPPPRPPPLRPGQSKA	Hydrophilic
96-121	NPMEWPRPVKLNRKELKKNYKTVDKV	Hydrophilic
159-189	PKDNGKGKDKDQQKRKFKRTKTRQVFRVSDE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-37	RRAQPNRPPPPRPPPLR
155-180	GRPRPKDNGKGKDKDQQKRKFKRTKT

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 5, mito 1, pero 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MASRIKTELKNEPMEFRPLGRRAQPNRPPPPRPPPLRPGQSKAFVQPDVKPKVEMKPLPEDPPGTYSDFVITSTGISEWRHDMMSFRPTSVKSAVNPMEWPRPVKLNRKELKKNYKTVDKVEPAKPLLGLDGKPVIGPDGKVVMVGGVDGLQPNGRPRPKDNGKGKDKDQQKRKFKRTKTRQVFRVSDEVRQLRREERHPWVLESGDGQQLWEGRMEDRGPPLQVLLFENNKGPGGFLAVPLNKWYTFKEPPKHTILTLDQAEQFEKDIAKNSDIQRWMMRRTGGKVSDATQMTLKRESSAEPTRPRTTSDGSVLSRSGMRVLQVRTGNTADYNNTGDDDEGDEGAAAARRRRDRGGGGDGDYDEFEFEEEFADDDEGAIFPEDEEEDEETKALKEKEARMMRAANVTNDENRMDETAQDEEEESDEDELNDAGKAMKKALRLWEKGAYADDDDDDNKNPYLSSDEEEEEQEGTDSGTNTPLPTGVLPQPGTPPKPTTNAKPNGSASKPGFRPLSRATSPVPGKPATNGISGAHLLAQRATSPPPGTNRVPPAGTPQRALSPLAAEAGGKRAGSPPRTSPVSGSLKRKAPDEGSSPPSGRASSPGGTATSPGPSTTPNKRPRTLPKVTVPANLQFDKAIPPGPIIAFLRIKPRTTGDCVKNFKDWFKEDGRNKGVLSFWIKQIARLDNSGGEAVLKLHDDAKLAQMGIEF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.5
3	0.45
4	0.47
5	0.42
6	0.46
7	0.49
8	0.56
9	0.57
10	0.67
11	0.72
12	0.73
13	0.8
14	0.84
15	0.82
16	0.81
17	0.85
18	0.84
19	0.83
20	0.81
21	0.79
22	0.8
23	0.83
24	0.82
25	0.78
26	0.76
27	0.74
28	0.69
29	0.67
30	0.62
31	0.56
32	0.52
33	0.52
34	0.53
35	0.53
36	0.51
37	0.47
38	0.44
39	0.48
40	0.54
41	0.51
42	0.47
43	0.5
44	0.53
45	0.55
46	0.55
47	0.49
48	0.42
49	0.41
50	0.38
51	0.31
52	0.28
53	0.23
54	0.22
55	0.2
56	0.18
57	0.16
58	0.13
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.13
65	0.15
66	0.16
67	0.17
68	0.16
69	0.18
70	0.2
71	0.28
72	0.27
73	0.26
74	0.29
75	0.29
76	0.33
77	0.35
78	0.34
79	0.27
80	0.36
81	0.37
82	0.34
83	0.37
84	0.38
85	0.42
86	0.41
87	0.42
88	0.36
89	0.42
90	0.47
91	0.54
92	0.58
93	0.61
94	0.66
95	0.73
96	0.81
97	0.82
98	0.87
99	0.85
100	0.84
101	0.82
102	0.84
103	0.78
104	0.74
105	0.73
106	0.7
107	0.68
108	0.64
109	0.62
110	0.54
111	0.5
112	0.44
113	0.34
114	0.3
115	0.26
116	0.22
117	0.19
118	0.19
119	0.18
120	0.18
121	0.17
122	0.16
123	0.14
124	0.14
125	0.12
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.11
130	0.1
131	0.08
132	0.07
133	0.06
134	0.04
135	0.04
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.07
140	0.11
141	0.2
142	0.23
143	0.27
144	0.31
145	0.42
146	0.5
147	0.59
148	0.65
149	0.68
150	0.73
151	0.76
152	0.76
153	0.74
154	0.75
155	0.74
156	0.74
157	0.75
158	0.76
159	0.8
160	0.87
161	0.89
162	0.89
163	0.91
164	0.92
165	0.93
166	0.93
167	0.92
168	0.89
169	0.88
170	0.82
171	0.75
172	0.74
173	0.64
174	0.57
175	0.55
176	0.53
177	0.47
178	0.45
179	0.44
180	0.41
181	0.45
182	0.45
183	0.44
184	0.46
185	0.52
186	0.51
187	0.5
188	0.45
189	0.4
190	0.35
191	0.3
192	0.24
193	0.18
194	0.16
195	0.14
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.13
200	0.11
201	0.09
202	0.12
203	0.13
204	0.14
205	0.17
206	0.18
207	0.17
208	0.16
209	0.16
210	0.14
211	0.15
212	0.15
213	0.17
214	0.16
215	0.16
216	0.17
217	0.18
218	0.17
219	0.16
220	0.13
221	0.09
222	0.11
223	0.11
224	0.11
225	0.15
226	0.15
227	0.16
228	0.17
229	0.19
230	0.15
231	0.16
232	0.18
233	0.19
234	0.27
235	0.35
236	0.43
237	0.46
238	0.51
239	0.56
240	0.54
241	0.48
242	0.45
243	0.39
244	0.36
245	0.32
246	0.28
247	0.24
248	0.23
249	0.24
250	0.19
251	0.17
252	0.12
253	0.12
254	0.1
255	0.14
256	0.15
257	0.16
258	0.21
259	0.23
260	0.27
261	0.28
262	0.29
263	0.29
264	0.3
265	0.31
266	0.29
267	0.3
268	0.27
269	0.29
270	0.34
271	0.3
272	0.29
273	0.28
274	0.27
275	0.3
276	0.28
277	0.25
278	0.22
279	0.22
280	0.23
281	0.24
282	0.22
283	0.16
284	0.17
285	0.17
286	0.21
287	0.26
288	0.31
289	0.34
290	0.4
291	0.42
292	0.42
293	0.43
294	0.4
295	0.36
296	0.33
297	0.3
298	0.29
299	0.26
300	0.27
301	0.24
302	0.21
303	0.18
304	0.15
305	0.13
306	0.09
307	0.09
308	0.12
309	0.13
310	0.18
311	0.19
312	0.2
313	0.21
314	0.21
315	0.2
316	0.17
317	0.17
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.07
334	0.06
335	0.08
336	0.12
337	0.15
338	0.17
339	0.19
340	0.21
341	0.22
342	0.27
343	0.31
344	0.28
345	0.27
346	0.25
347	0.24
348	0.22
349	0.19
350	0.13
351	0.08
352	0.06
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.11
380	0.1
381	0.11
382	0.14
383	0.17
384	0.27
385	0.31
386	0.32
387	0.31
388	0.33
389	0.32
390	0.33
391	0.31
392	0.23
393	0.21
394	0.21
395	0.2
396	0.19
397	0.18
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.1
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.07
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.08
422	0.08
423	0.1
424	0.13
425	0.14
426	0.18
427	0.26
428	0.33
429	0.33
430	0.36
431	0.39
432	0.37
433	0.36
434	0.35
435	0.27
436	0.2
437	0.18
438	0.15
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.12
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.12
449	0.12
450	0.13
451	0.14
452	0.15
453	0.16
454	0.16
455	0.16
456	0.13
457	0.12
458	0.1
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.1
472	0.11
473	0.15
474	0.16
475	0.17
476	0.22
477	0.26
478	0.28
479	0.27
480	0.29
481	0.28
482	0.35
483	0.37
484	0.4
485	0.46
486	0.52
487	0.52
488	0.53
489	0.53
490	0.53
491	0.52
492	0.5
493	0.43
494	0.43
495	0.42
496	0.41
497	0.42
498	0.35
499	0.4
500	0.37
501	0.43
502	0.36
503	0.38
504	0.35
505	0.39
506	0.41
507	0.38
508	0.38
509	0.3
510	0.3
511	0.28
512	0.32
513	0.25
514	0.24
515	0.23
516	0.19
517	0.2
518	0.19
519	0.18
520	0.15
521	0.13
522	0.12
523	0.11
524	0.11
525	0.1
526	0.12
527	0.13
528	0.15
529	0.16
530	0.19
531	0.24
532	0.29
533	0.32
534	0.36
535	0.4
536	0.39
537	0.39
538	0.35
539	0.4
540	0.43
541	0.42
542	0.38
543	0.34
544	0.34
545	0.35
546	0.36
547	0.27
548	0.19
549	0.18
550	0.17
551	0.15
552	0.11
553	0.1
554	0.12
555	0.13
556	0.11
557	0.11
558	0.16
559	0.22
560	0.26
561	0.29
562	0.31
563	0.36
564	0.4
565	0.4
566	0.37
567	0.4
568	0.46
569	0.48
570	0.51
571	0.51
572	0.54
573	0.55
574	0.55
575	0.5
576	0.45
577	0.44
578	0.42
579	0.42
580	0.41
581	0.43
582	0.42
583	0.39
584	0.37
585	0.33
586	0.27
587	0.25
588	0.24
589	0.21
590	0.22
591	0.21
592	0.21
593	0.2
594	0.21
595	0.18
596	0.16
597	0.15
598	0.14
599	0.14
600	0.16
601	0.23
602	0.31
603	0.4
604	0.47
605	0.54
606	0.58
607	0.66
608	0.73
609	0.76
610	0.75
611	0.73
612	0.72
613	0.74
614	0.73
615	0.7
616	0.63
617	0.6
618	0.58
619	0.51
620	0.42
621	0.33
622	0.31
623	0.3
624	0.27
625	0.23
626	0.17
627	0.17
628	0.19
629	0.18
630	0.22
631	0.2
632	0.24
633	0.24
634	0.26
635	0.34
636	0.35
637	0.37
638	0.35
639	0.39
640	0.39
641	0.44
642	0.52
643	0.51
644	0.57
645	0.63
646	0.63
647	0.65
648	0.63
649	0.61
650	0.59
651	0.54
652	0.51
653	0.52
654	0.58
655	0.57
656	0.64
657	0.63
658	0.58
659	0.55
660	0.52
661	0.45
662	0.41
663	0.42
664	0.36
665	0.34
666	0.4
667	0.39
668	0.4
669	0.45
670	0.46
671	0.42
672	0.41
673	0.4
674	0.32
675	0.35
676	0.31
677	0.24
678	0.17
679	0.14
680	0.13
681	0.12
682	0.12
683	0.1
684	0.12
685	0.13
686	0.15
687	0.16
688	0.19
689	0.2
690	0.19

M5G8M7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer