Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5FRW4

Protein Details
Accession M5FRW4    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
567-607EMEKKAEKSDRKKFGNGRAESDNDDDRKKKSSTKAPVKSRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-49KGQSKGKGASPVKGATSGKKAFRGKTRG
576-579DRKK
593-607RKKKSSTKAPVKSRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences MNSEDADVKPTKKQLSSASNGKGQSKGKGASPVKGATSGKKAFRGKTRGEGRDVDESVAKKIEVHQRELFQQLHERGLEKFQAVGDKDGKDGKQSFKRYASYKGELALPKEVEDLRIHVDRRSRTVLLPVYGYAVPFHINAIKNANKSNEGDFTYLRINFQTPGQIAGKKEDTPFEDPDKTFIRSVTYRSADAARFDNLCRQITDLKKEVAKLEAEKRDKMDVVDQELIEVKSKRAPKLLEVFARPQAEGKRMPGELEIHQNGLRFHTPIGQKIQILFNNIKHLFFQPCDHELIVLIHIHLKSPIMIGKKKTKDVQFYREASDVQFDETGNRKRKYRYGDEDEIELEQEERKRRQQLNREFHQFADRIAEASDEPLEVDIPFRELSFEGVPARTNVRLQPTMTCLVHLSDTPFVVVTLDEVELCHLERVQFGLKHFDMVIVFQDFTKPPLHINSIPMSELDPVKEWLNSMDIPISEGPVNLQWGPIMKHINEDPYEFFNEGGWAFLRGDEEDEDSEEPDSASEFQMSSDAYHESPSSDDDESEYDENASADEGSEVSDASTGDDWDEMEKKAEKSDRKKFGNGRAESDNDDDRKKKSSTKAPVKSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.52
3 0.57
4 0.61
5 0.6
6 0.6
7 0.6
8 0.58
9 0.56
10 0.5
11 0.48
12 0.45
13 0.42
14 0.4
15 0.48
16 0.47
17 0.46
18 0.48
19 0.46
20 0.41
21 0.44
22 0.43
23 0.38
24 0.44
25 0.46
26 0.45
27 0.51
28 0.55
29 0.56
30 0.63
31 0.66
32 0.62
33 0.66
34 0.72
35 0.68
36 0.68
37 0.65
38 0.6
39 0.6
40 0.55
41 0.47
42 0.41
43 0.37
44 0.34
45 0.31
46 0.26
47 0.18
48 0.25
49 0.33
50 0.32
51 0.38
52 0.41
53 0.42
54 0.46
55 0.51
56 0.45
57 0.38
58 0.42
59 0.38
60 0.37
61 0.35
62 0.33
63 0.29
64 0.32
65 0.31
66 0.23
67 0.22
68 0.19
69 0.24
70 0.24
71 0.28
72 0.28
73 0.26
74 0.28
75 0.32
76 0.31
77 0.31
78 0.35
79 0.38
80 0.43
81 0.48
82 0.52
83 0.54
84 0.59
85 0.56
86 0.61
87 0.6
88 0.55
89 0.51
90 0.46
91 0.46
92 0.43
93 0.43
94 0.39
95 0.31
96 0.27
97 0.29
98 0.27
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.19
103 0.24
104 0.24
105 0.25
106 0.31
107 0.31
108 0.36
109 0.4
110 0.37
111 0.33
112 0.4
113 0.4
114 0.35
115 0.33
116 0.28
117 0.25
118 0.24
119 0.23
120 0.16
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.14
127 0.16
128 0.23
129 0.27
130 0.28
131 0.32
132 0.33
133 0.31
134 0.32
135 0.33
136 0.31
137 0.28
138 0.28
139 0.25
140 0.24
141 0.26
142 0.24
143 0.22
144 0.19
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.2
149 0.15
150 0.19
151 0.21
152 0.23
153 0.22
154 0.26
155 0.28
156 0.25
157 0.26
158 0.25
159 0.27
160 0.29
161 0.32
162 0.32
163 0.35
164 0.33
165 0.36
166 0.36
167 0.33
168 0.3
169 0.26
170 0.26
171 0.22
172 0.26
173 0.29
174 0.28
175 0.26
176 0.27
177 0.3
178 0.26
179 0.27
180 0.25
181 0.2
182 0.19
183 0.19
184 0.24
185 0.24
186 0.24
187 0.22
188 0.22
189 0.27
190 0.3
191 0.35
192 0.32
193 0.32
194 0.32
195 0.33
196 0.32
197 0.27
198 0.25
199 0.24
200 0.29
201 0.35
202 0.36
203 0.37
204 0.38
205 0.37
206 0.36
207 0.32
208 0.3
209 0.23
210 0.25
211 0.26
212 0.23
213 0.22
214 0.23
215 0.22
216 0.2
217 0.18
218 0.14
219 0.16
220 0.21
221 0.22
222 0.25
223 0.26
224 0.28
225 0.34
226 0.4
227 0.39
228 0.38
229 0.39
230 0.39
231 0.39
232 0.34
233 0.3
234 0.26
235 0.25
236 0.24
237 0.23
238 0.22
239 0.21
240 0.21
241 0.2
242 0.2
243 0.18
244 0.23
245 0.21
246 0.19
247 0.2
248 0.21
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.12
253 0.12
254 0.17
255 0.17
256 0.19
257 0.23
258 0.22
259 0.22
260 0.23
261 0.27
262 0.22
263 0.25
264 0.24
265 0.21
266 0.27
267 0.27
268 0.26
269 0.22
270 0.23
271 0.21
272 0.2
273 0.21
274 0.17
275 0.18
276 0.19
277 0.18
278 0.16
279 0.14
280 0.14
281 0.12
282 0.09
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.1
292 0.12
293 0.15
294 0.19
295 0.28
296 0.32
297 0.35
298 0.4
299 0.42
300 0.47
301 0.5
302 0.53
303 0.52
304 0.5
305 0.49
306 0.45
307 0.4
308 0.31
309 0.27
310 0.2
311 0.14
312 0.13
313 0.1
314 0.11
315 0.17
316 0.24
317 0.3
318 0.32
319 0.34
320 0.37
321 0.43
322 0.48
323 0.51
324 0.52
325 0.53
326 0.57
327 0.55
328 0.53
329 0.48
330 0.4
331 0.31
332 0.22
333 0.14
334 0.1
335 0.12
336 0.16
337 0.19
338 0.24
339 0.32
340 0.39
341 0.47
342 0.56
343 0.63
344 0.67
345 0.71
346 0.74
347 0.66
348 0.6
349 0.57
350 0.46
351 0.36
352 0.31
353 0.23
354 0.16
355 0.15
356 0.15
357 0.1
358 0.11
359 0.1
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.14
380 0.13
381 0.14
382 0.15
383 0.19
384 0.21
385 0.22
386 0.23
387 0.25
388 0.29
389 0.27
390 0.25
391 0.2
392 0.18
393 0.18
394 0.16
395 0.15
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.09
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.23
420 0.22
421 0.23
422 0.23
423 0.22
424 0.17
425 0.16
426 0.17
427 0.11
428 0.12
429 0.1
430 0.13
431 0.12
432 0.14
433 0.15
434 0.13
435 0.13
436 0.17
437 0.23
438 0.22
439 0.25
440 0.27
441 0.27
442 0.27
443 0.25
444 0.22
445 0.19
446 0.18
447 0.16
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.15
452 0.14
453 0.12
454 0.15
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.14
460 0.14
461 0.14
462 0.12
463 0.11
464 0.12
465 0.11
466 0.14
467 0.11
468 0.11
469 0.1
470 0.12
471 0.14
472 0.18
473 0.21
474 0.18
475 0.22
476 0.24
477 0.29
478 0.27
479 0.28
480 0.26
481 0.25
482 0.28
483 0.24
484 0.23
485 0.18
486 0.18
487 0.15
488 0.14
489 0.11
490 0.1
491 0.1
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.13
496 0.13
497 0.15
498 0.14
499 0.16
500 0.15
501 0.15
502 0.15
503 0.13
504 0.12
505 0.09
506 0.1
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.11
513 0.11
514 0.1
515 0.11
516 0.12
517 0.11
518 0.13
519 0.13
520 0.12
521 0.13
522 0.14
523 0.16
524 0.15
525 0.14
526 0.15
527 0.16
528 0.19
529 0.19
530 0.18
531 0.15
532 0.15
533 0.14
534 0.13
535 0.12
536 0.08
537 0.07
538 0.07
539 0.06
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.06
544 0.08
545 0.07
546 0.09
547 0.1
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.12
553 0.15
554 0.14
555 0.17
556 0.22
557 0.22
558 0.3
559 0.37
560 0.44
561 0.52
562 0.61
563 0.67
564 0.69
565 0.77
566 0.78
567 0.81
568 0.81
569 0.75
570 0.7
571 0.66
572 0.63
573 0.57
574 0.54
575 0.51
576 0.45
577 0.48
578 0.46
579 0.43
580 0.46
581 0.46
582 0.49
583 0.52
584 0.58
585 0.62
586 0.7
587 0.77