Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7F6F3

Protein Details
Accession A7F6F3    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-28GAGASRAERKAKRRKLENSIPDIPDHydrophilic
63-88KGGLAKNKESNRKSKKPKTSAETPSLHydrophilic
100-123ETELAPKKSKKERKAERKAKEAAEBasic
264-287GGNTKDRRSKIKGKNEKLNEQRADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-18AERKAKRRK
67-80AKNKESNRKSKKPK
105-119PKKSKKERKAERKAK
270-277RRSKIKGK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG ssl:SS1G_13182  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGFGAGASRAERKAKRRKLENSIPDIPDDIDIESINDSAVSSKRKRALEDDANEDQDIPLDHKGGLAKNKESNRKSKKPKTSAETPSLPTRTRESSHVMETELAPKKSKKERKAERKAKEAAENTISTNQEAEAAARGKDQDTNATGSSDQTTAEKKRVKSKKQGGVSGANTESKAARFIVFIGNLPFTATTASIKNHFAAVKPASVRHLTEKGNPTKSRGCAFLEFEGYDYMKTCLKQFHQSTFNDGISAPRKINVELTAGGGGNTKDRRSKIKGKNEKLNEQRADNPKVSKNKAVDGAQHVLAEDSGVHPSRKARIGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.7
3 0.76
4 0.82
5 0.84
6 0.88
7 0.88
8 0.86
9 0.84
10 0.75
11 0.66
12 0.58
13 0.48
14 0.38
15 0.29
16 0.21
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.13
27 0.19
28 0.22
29 0.29
30 0.36
31 0.39
32 0.43
33 0.46
34 0.52
35 0.54
36 0.56
37 0.57
38 0.53
39 0.52
40 0.49
41 0.43
42 0.33
43 0.24
44 0.2
45 0.15
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.15
51 0.19
52 0.24
53 0.27
54 0.3
55 0.36
56 0.44
57 0.52
58 0.55
59 0.61
60 0.65
61 0.71
62 0.77
63 0.8
64 0.84
65 0.83
66 0.87
67 0.84
68 0.84
69 0.81
70 0.77
71 0.72
72 0.64
73 0.62
74 0.57
75 0.51
76 0.43
77 0.4
78 0.37
79 0.34
80 0.34
81 0.33
82 0.32
83 0.34
84 0.32
85 0.29
86 0.25
87 0.24
88 0.29
89 0.28
90 0.26
91 0.26
92 0.27
93 0.33
94 0.43
95 0.51
96 0.52
97 0.57
98 0.67
99 0.76
100 0.85
101 0.88
102 0.85
103 0.84
104 0.81
105 0.74
106 0.71
107 0.61
108 0.54
109 0.47
110 0.41
111 0.34
112 0.32
113 0.28
114 0.2
115 0.18
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.09
138 0.08
139 0.12
140 0.13
141 0.19
142 0.24
143 0.24
144 0.34
145 0.43
146 0.49
147 0.56
148 0.64
149 0.65
150 0.66
151 0.68
152 0.61
153 0.58
154 0.53
155 0.45
156 0.37
157 0.29
158 0.24
159 0.2
160 0.17
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.11
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.1
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.21
194 0.22
195 0.22
196 0.26
197 0.25
198 0.31
199 0.39
200 0.43
201 0.5
202 0.49
203 0.49
204 0.5
205 0.51
206 0.46
207 0.4
208 0.37
209 0.32
210 0.34
211 0.31
212 0.28
213 0.25
214 0.23
215 0.22
216 0.18
217 0.15
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.18
224 0.21
225 0.3
226 0.33
227 0.39
228 0.44
229 0.44
230 0.49
231 0.47
232 0.44
233 0.35
234 0.32
235 0.3
236 0.27
237 0.29
238 0.23
239 0.21
240 0.23
241 0.23
242 0.26
243 0.22
244 0.21
245 0.19
246 0.2
247 0.19
248 0.17
249 0.16
250 0.15
251 0.14
252 0.17
253 0.19
254 0.2
255 0.24
256 0.28
257 0.35
258 0.42
259 0.53
260 0.57
261 0.66
262 0.74
263 0.77
264 0.85
265 0.85
266 0.87
267 0.85
268 0.85
269 0.78
270 0.71
271 0.71
272 0.68
273 0.67
274 0.61
275 0.58
276 0.56
277 0.61
278 0.62
279 0.61
280 0.56
281 0.56
282 0.58
283 0.55
284 0.54
285 0.51
286 0.5
287 0.44
288 0.4
289 0.34
290 0.28
291 0.24
292 0.18
293 0.12
294 0.09
295 0.12
296 0.15
297 0.15
298 0.17
299 0.21
300 0.27