FuNGI

M5GCW5

Protein Details

Accession

M5GCW5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1107-1132	LYPPNWKMREERQKPFKPVKGREQPV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 6.5, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MDLVSDCGTPLLTSVSQLSDLSSPPLTPPHTTADRHLKHALSTDDEPFLDDESPHAIKRRKIATRQSASDDNIQLWAEPLITTESGSVPDTFIDAFSTHRINDYAHEKGLLNEHEIFDASNANVLDVAADDGHTCDPARDSSSREATYCQATSTKPENSIQCIKPDPVEDTINEAKSGNSIQIISPIVTGTPKFAFDNRNLTGRVQSRDSASGITQSDDPPTYPPNVSNKLDGISAPVFASSTEIMLWKKEHMDEEWNAASRVPPQVKQDVLHYDQLHSLPFIGTPASKGAQDAGDISPGFTDCSAETRPHTNISPTTHEISHHSDVLEMFEEYNVAFGGQWELARLQSLKLFKWEDLLRPRCGERWLPNVTLFTGSCKDIGPKILRLVKDKVARWNKPSDTSMDTYRDEAFSHERQVKSPWGELDKEDDALEKQDKSSNKHEGMGCFSQSSDVFHGKIRFGISVTWTGRDTQLKLDPLEIDRFTRLTRRFGSRRLIRMKNVSSYPPNEFMKNFFLQKFVFMGRVYRSFFVKENTVFLIETNETHCGTKARDRFRLSLWEFVNWHNPLYCNQQQIMTKWAARFALMLSTTSPGVSIEPENIHFIPDEEPGKPQSHHVLTDGAGYLNGSAMLQICNRLKWGKVQAAVQARFGGAKGMFLLHPDLDFEGPPTIWLRPSQVKLKYAEDPEEWDPAMRILDVVKPPYLRSPARLSMETIVALADRQVSRSVILSYLRDGLLEQIQSLFDFQNASPLQQWLELSREGAVISARLKRSALGTARSKGLTREEDENELRTDDDLIEDQGEQRSSAWWPDEISGCPSTLEESALFALDSGFTLETCSYLRRKVGKILEQILTSHISKFKLVVPPSAEGFAIPSPIPSALKPGEIFLRMSRERVDSRTGMATDVVVGDVLIVRHPCKLPSDIQLVKAVDCPELRHWKDVIITSVDRSQPRSLLSKLAGGDYDGDTVVIYWDKDLIAGFKPASDECLDPPDRVKDCFEYSMGSVEDFLKTSGTLPEAEKMLEIQKRLLWSFTLPSPGKWSMYHDTLAYLEGLDDARSIFMAHVCAAFSAGRSLTGHYRFTTALDGAKSGLQVKPAVERAFQQALGRLYPPNWKMREERQKPFKPVKGREQPVLKPGFIMEQLVEEGSKLEKEHLAAFRARCEKVIVPPDGDPDLIEPYNSLLRLGHELGADVHLKIEKERGTNFPFDMAMRELGRLKADPRGGGGGGGWKMVKQEFYVC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.16
4	0.16
5	0.17
6	0.15
7	0.15
8	0.17
9	0.17
10	0.16
11	0.16
12	0.22
13	0.23
14	0.24
15	0.26
16	0.31
17	0.36
18	0.38
19	0.45
20	0.5
21	0.5
22	0.53
23	0.56
24	0.49
25	0.45
26	0.48
27	0.43
28	0.39
29	0.39
30	0.36
31	0.33
32	0.32
33	0.31
34	0.26
35	0.24
36	0.19
37	0.16
38	0.14
39	0.17
40	0.2
41	0.2
42	0.28
43	0.31
44	0.34
45	0.43
46	0.52
47	0.55
48	0.62
49	0.71
50	0.74
51	0.78
52	0.79
53	0.77
54	0.73
55	0.67
56	0.65
57	0.56
58	0.46
59	0.39
60	0.34
61	0.27
62	0.22
63	0.19
64	0.12
65	0.1
66	0.1
67	0.11
68	0.11
69	0.11
70	0.11
71	0.11
72	0.13
73	0.15
74	0.14
75	0.11
76	0.11
77	0.12
78	0.11
79	0.1
80	0.1
81	0.09
82	0.11
83	0.14
84	0.16
85	0.15
86	0.17
87	0.18
88	0.17
89	0.23
90	0.27
91	0.27
92	0.26
93	0.28
94	0.26
95	0.27
96	0.33
97	0.28
98	0.27
99	0.25
100	0.25
101	0.24
102	0.23
103	0.22
104	0.16
105	0.16
106	0.12
107	0.13
108	0.12
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.1
113	0.08
114	0.09
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.08
119	0.08
120	0.09
121	0.09
122	0.09
123	0.11
124	0.13
125	0.17
126	0.18
127	0.22
128	0.29
129	0.37
130	0.37
131	0.36
132	0.36
133	0.35
134	0.38
135	0.34
136	0.28
137	0.24
138	0.23
139	0.29
140	0.33
141	0.34
142	0.32
143	0.37
144	0.38
145	0.43
146	0.51
147	0.46
148	0.45
149	0.45
150	0.43
151	0.4
152	0.39
153	0.36
154	0.31
155	0.31
156	0.26
157	0.29
158	0.33
159	0.31
160	0.29
161	0.26
162	0.21
163	0.21
164	0.21
165	0.15
166	0.12
167	0.12
168	0.11
169	0.15
170	0.16
171	0.15
172	0.14
173	0.13
174	0.12
175	0.13
176	0.13
177	0.12
178	0.12
179	0.14
180	0.15
181	0.19
182	0.23
183	0.26
184	0.34
185	0.33
186	0.36
187	0.36
188	0.35
189	0.39
190	0.4
191	0.4
192	0.35
193	0.35
194	0.33
195	0.35
196	0.34
197	0.28
198	0.23
199	0.24
200	0.21
201	0.21
202	0.19
203	0.17
204	0.19
205	0.18
206	0.19
207	0.17
208	0.18
209	0.2
210	0.2
211	0.24
212	0.29
213	0.35
214	0.36
215	0.36
216	0.35
217	0.33
218	0.32
219	0.27
220	0.24
221	0.18
222	0.17
223	0.14
224	0.13
225	0.11
226	0.11
227	0.13
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.1
232	0.11
233	0.13
234	0.14
235	0.14
236	0.16
237	0.18
238	0.2
239	0.2
240	0.26
241	0.25
242	0.29
243	0.31
244	0.29
245	0.27
246	0.25
247	0.23
248	0.2
249	0.26
250	0.24
251	0.25
252	0.28
253	0.33
254	0.35
255	0.35
256	0.37
257	0.36
258	0.36
259	0.4
260	0.36
261	0.32
262	0.32
263	0.32
264	0.28
265	0.21
266	0.18
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.12
278	0.11
279	0.12
280	0.13
281	0.11
282	0.13
283	0.12
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.11
288	0.09
289	0.09
290	0.06
291	0.11
292	0.12
293	0.14
294	0.16
295	0.2
296	0.22
297	0.24
298	0.25
299	0.25
300	0.28
301	0.3
302	0.35
303	0.34
304	0.35
305	0.32
306	0.32
307	0.32
308	0.35
309	0.33
310	0.28
311	0.24
312	0.22
313	0.22
314	0.22
315	0.19
316	0.13
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.08
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.13
336	0.15
337	0.15
338	0.2
339	0.22
340	0.2
341	0.26
342	0.27
343	0.31
344	0.39
345	0.43
346	0.4
347	0.41
348	0.42
349	0.39
350	0.4
351	0.39
352	0.35
353	0.38
354	0.39
355	0.39
356	0.39
357	0.37
358	0.34
359	0.31
360	0.25
361	0.21
362	0.18
363	0.17
364	0.15
365	0.15
366	0.16
367	0.15
368	0.21
369	0.21
370	0.21
371	0.27
372	0.31
373	0.33
374	0.36
375	0.38
376	0.39
377	0.43
378	0.43
379	0.47
380	0.53
381	0.55
382	0.55
383	0.59
384	0.55
385	0.53
386	0.51
387	0.45
388	0.4
389	0.38
390	0.38
391	0.33
392	0.32
393	0.28
394	0.28
395	0.24
396	0.2
397	0.2
398	0.21
399	0.18
400	0.24
401	0.28
402	0.27
403	0.28
404	0.31
405	0.34
406	0.31
407	0.32
408	0.3
409	0.27
410	0.28
411	0.27
412	0.3
413	0.25
414	0.23
415	0.2
416	0.17
417	0.15
418	0.16
419	0.18
420	0.13
421	0.13
422	0.17
423	0.2
424	0.25
425	0.31
426	0.36
427	0.35
428	0.4
429	0.41
430	0.38
431	0.41
432	0.38
433	0.32
434	0.24
435	0.22
436	0.19
437	0.17
438	0.17
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.17
443	0.19
444	0.17
445	0.19
446	0.18
447	0.15
448	0.14
449	0.14
450	0.13
451	0.18
452	0.19
453	0.18
454	0.18
455	0.18
456	0.21
457	0.22
458	0.21
459	0.18
460	0.22
461	0.23
462	0.23
463	0.23
464	0.22
465	0.21
466	0.24
467	0.2
468	0.17
469	0.15
470	0.16
471	0.15
472	0.21
473	0.22
474	0.24
475	0.27
476	0.35
477	0.38
478	0.42
479	0.52
480	0.51
481	0.57
482	0.61
483	0.61
484	0.57
485	0.61
486	0.58
487	0.53
488	0.48
489	0.44
490	0.39
491	0.37
492	0.36
493	0.34
494	0.33
495	0.29
496	0.28
497	0.27
498	0.27
499	0.27
500	0.26
501	0.21
502	0.22
503	0.2
504	0.21
505	0.2
506	0.16
507	0.15
508	0.13
509	0.15
510	0.15
511	0.18
512	0.19
513	0.18
514	0.19
515	0.18
516	0.2
517	0.2
518	0.21
519	0.18
520	0.18
521	0.18
522	0.17
523	0.15
524	0.14
525	0.15
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.12
533	0.11
534	0.13
535	0.19
536	0.25
537	0.29
538	0.36
539	0.39
540	0.4
541	0.41
542	0.49
543	0.43
544	0.43
545	0.38
546	0.33
547	0.31
548	0.3
549	0.35
550	0.26
551	0.24
552	0.18
553	0.18
554	0.18
555	0.24
556	0.26
557	0.22
558	0.22
559	0.25
560	0.26
561	0.26
562	0.28
563	0.22
564	0.21
565	0.19
566	0.21
567	0.17
568	0.15
569	0.14
570	0.11
571	0.12
572	0.1
573	0.1
574	0.09
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.08
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.07
584	0.08
585	0.08
586	0.11
587	0.11
588	0.11
589	0.1
590	0.1
591	0.1
592	0.12
593	0.13
594	0.1
595	0.12
596	0.13
597	0.15
598	0.15
599	0.15
600	0.18
601	0.17
602	0.18
603	0.18
604	0.17
605	0.15
606	0.16
607	0.15
608	0.09
609	0.08
610	0.07
611	0.06
612	0.05
613	0.04
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.04
618	0.05
619	0.08
620	0.09
621	0.09
622	0.11
623	0.12
624	0.12
625	0.16
626	0.21
627	0.21
628	0.23
629	0.24
630	0.29
631	0.36
632	0.36
633	0.31
634	0.26
635	0.23
636	0.2
637	0.19
638	0.15
639	0.07
640	0.07
641	0.06
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.07
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.06
654	0.06
655	0.07
656	0.08
657	0.07
658	0.08
659	0.09
660	0.12
661	0.15
662	0.19
663	0.25
664	0.28
665	0.31
666	0.33
667	0.36
668	0.36
669	0.34
670	0.34
671	0.27
672	0.27
673	0.26
674	0.24
675	0.21
676	0.16
677	0.15
678	0.12
679	0.12
680	0.07
681	0.06
682	0.05
683	0.09
684	0.1
685	0.12
686	0.13
687	0.13
688	0.14
689	0.17
690	0.22
691	0.19
692	0.21
693	0.26
694	0.3
695	0.32
696	0.32
697	0.31
698	0.27
699	0.27
700	0.23
701	0.17
702	0.11
703	0.08
704	0.07
705	0.06
706	0.07
707	0.06
708	0.07
709	0.08
710	0.09
711	0.09
712	0.1
713	0.11
714	0.1
715	0.11
716	0.11
717	0.11
718	0.12
719	0.12
720	0.11
721	0.1
722	0.1
723	0.1
724	0.1
725	0.09
726	0.07
727	0.08
728	0.08
729	0.09
730	0.07
731	0.06
732	0.07
733	0.07
734	0.14
735	0.14
736	0.15
737	0.15
738	0.16
739	0.16
740	0.15
741	0.16
742	0.09
743	0.12
744	0.11
745	0.11
746	0.11
747	0.1
748	0.09
749	0.09
750	0.08
751	0.07
752	0.09
753	0.13
754	0.13
755	0.14
756	0.14
757	0.14
758	0.16
759	0.21
760	0.21
761	0.23
762	0.27
763	0.29
764	0.31
765	0.31
766	0.3
767	0.26
768	0.28
769	0.25
770	0.23
771	0.27
772	0.26
773	0.31
774	0.31
775	0.31
776	0.27
777	0.24
778	0.21
779	0.15
780	0.14
781	0.09
782	0.09
783	0.08
784	0.07
785	0.08
786	0.07
787	0.08
788	0.09
789	0.09
790	0.08
791	0.08
792	0.09
793	0.09
794	0.11
795	0.11
796	0.1
797	0.11
798	0.13
799	0.15
800	0.14
801	0.17
802	0.16
803	0.15
804	0.14
805	0.13
806	0.13
807	0.11
808	0.12
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.08
813	0.08
814	0.06
815	0.06
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.05
820	0.04
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.07
825	0.1
826	0.11
827	0.14
828	0.19
829	0.23
830	0.26
831	0.33
832	0.39
833	0.44
834	0.48
835	0.5
836	0.47
837	0.42
838	0.41
839	0.35
840	0.3
841	0.24
842	0.2
843	0.18
844	0.16
845	0.16
846	0.17
847	0.2
848	0.24
849	0.25
850	0.27
851	0.27
852	0.28
853	0.29
854	0.28
855	0.23
856	0.16
857	0.17
858	0.13
859	0.11
860	0.09
861	0.08
862	0.08
863	0.09
864	0.11
865	0.09
866	0.14
867	0.13
868	0.16
869	0.16
870	0.16
871	0.18
872	0.18
873	0.2
874	0.16
875	0.23
876	0.22
877	0.23
878	0.24
879	0.26
880	0.27
881	0.29
882	0.32
883	0.25
884	0.27
885	0.29
886	0.27
887	0.23
888	0.2
889	0.17
890	0.13
891	0.12
892	0.09
893	0.05
894	0.05
895	0.04
896	0.05
897	0.05
898	0.06
899	0.07
900	0.08
901	0.11
902	0.12
903	0.13
904	0.16
905	0.19
906	0.21
907	0.25
908	0.33
909	0.32
910	0.33
911	0.38
912	0.35
913	0.32
914	0.33
915	0.28
916	0.22
917	0.21
918	0.22
919	0.24
920	0.33
921	0.34
922	0.35
923	0.34
924	0.33
925	0.36
926	0.36
927	0.31
928	0.26
929	0.25
930	0.23
931	0.28
932	0.3
933	0.28
934	0.3
935	0.29
936	0.26
937	0.28
938	0.31
939	0.27
940	0.28
941	0.28
942	0.28
943	0.26
944	0.25
945	0.23
946	0.18
947	0.19
948	0.14
949	0.14
950	0.1
951	0.09
952	0.08
953	0.08
954	0.08
955	0.07
956	0.07
957	0.06
958	0.07
959	0.07
960	0.07
961	0.08
962	0.09
963	0.09
964	0.12
965	0.12
966	0.12
967	0.13
968	0.13
969	0.16
970	0.15
971	0.15
972	0.14
973	0.22
974	0.22
975	0.22
976	0.25
977	0.3
978	0.3
979	0.31
980	0.33
981	0.29
982	0.32
983	0.33
984	0.31
985	0.25
986	0.24
987	0.25
988	0.22
989	0.18
990	0.15
991	0.14
992	0.14
993	0.12
994	0.12
995	0.09
996	0.09
997	0.1
998	0.1
999	0.11
1000	0.12
1001	0.13
1002	0.15
1003	0.16
1004	0.16
1005	0.15
1006	0.14
1007	0.2
1008	0.2
1009	0.2
1010	0.19
1011	0.21
1012	0.24
1013	0.25
1014	0.25
1015	0.19
1016	0.19
1017	0.21
1018	0.22
1019	0.29
1020	0.26
1021	0.26
1022	0.31
1023	0.33
1024	0.32
1025	0.3
1026	0.34
1027	0.31
1028	0.34
1029	0.34
1030	0.28
1031	0.27
1032	0.25
1033	0.24
1034	0.18
1035	0.12
1036	0.09
1037	0.08
1038	0.08
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.06
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.07
1045	0.06
1046	0.07
1047	0.08
1048	0.09
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.09
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.09
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.11
1058	0.11
1059	0.14
1060	0.2
1061	0.24
1062	0.26
1063	0.25
1064	0.27
1065	0.26
1066	0.27
1067	0.27
1068	0.21
1069	0.21
1070	0.19
1071	0.19
1072	0.17
1073	0.18
1074	0.18
1075	0.17
1076	0.16
1077	0.15
1078	0.16
1079	0.17
1080	0.22
1081	0.27
1082	0.28
1083	0.26
1084	0.28
1085	0.32
1086	0.33
1087	0.33
1088	0.29
1089	0.28
1090	0.28
1091	0.29
1092	0.28
1093	0.24
1094	0.22
1095	0.3
1096	0.33
1097	0.36
1098	0.37
1099	0.4
1100	0.44
1101	0.53
1102	0.63
1103	0.63
1104	0.69
1105	0.71
1106	0.78
1107	0.83
1108	0.86
1109	0.83
1110	0.83
1111	0.83
1112	0.83
1113	0.83
1114	0.79
1115	0.79
1116	0.77
1117	0.73
1118	0.71
1119	0.67
1120	0.56
1121	0.46
1122	0.41
1123	0.37
1124	0.29
1125	0.26
1126	0.18
1127	0.14
1128	0.15
1129	0.15
1130	0.14
1131	0.1
1132	0.1
1133	0.1
1134	0.11
1135	0.1
1136	0.12
1137	0.14
1138	0.15
1139	0.22
1140	0.25
1141	0.28
1142	0.32
1143	0.33
1144	0.39
1145	0.43
1146	0.43
1147	0.37
1148	0.38
1149	0.37
1150	0.4
1151	0.48
1152	0.42
1153	0.39
1154	0.39
1155	0.42
1156	0.39
1157	0.35
1158	0.27
1159	0.2
1160	0.22
1161	0.2
1162	0.18
1163	0.14
1164	0.16
1165	0.19
1166	0.19
1167	0.18
1168	0.13
1169	0.16
1170	0.21
1171	0.22
1172	0.21
1173	0.18
1174	0.19
1175	0.19
1176	0.21
1177	0.2
1178	0.15
1179	0.15
1180	0.15
1181	0.16
1182	0.16
1183	0.22
1184	0.23
1185	0.27
1186	0.31
1187	0.37
1188	0.39
1189	0.43
1190	0.42
1191	0.38
1192	0.35
1193	0.31
1194	0.31
1195	0.26
1196	0.25
1197	0.21
1198	0.23
1199	0.24
1200	0.24
1201	0.27
1202	0.26
1203	0.25
1204	0.29
1205	0.31
1206	0.29
1207	0.3
1208	0.32
1209	0.29
1210	0.27
1211	0.25
1212	0.24
1213	0.21
1214	0.22
1215	0.19
1216	0.16
1217	0.19
1218	0.21
1219	0.22

M5GCW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer