Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

M5FSX9

Protein Details
Accession M5FSX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-281GEGDTRARNRRRTRPPHPTSGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
385-396GRGRGGSRGRER
432-451RGGRGRGRGRGRGRGGPRGA
Subcellular Location(s) mito 22, nucl 2.5, cyto_nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019050  FDF_dom  
IPR025609  Lsm14-like_N  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR025768  TFG_box  
Pfam View protein in Pfam  
PF09532  FDF  
PF12701  LSM14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
PS51536  TFG  
Amino Acid Sequences MADNFIGARISLTSMRGVRYLGTLHSFSKDDSTISLSDVLSMGTEHRRPQNEYIAPSERAYPFIVFRVSDVADVSVEQPAPPQAINQVPEDPAIVAPGFPPGPSGVGPLPGGRPLPQAPGQPLPAPSQGPLPVPAPAPHAPIPASQPIPVPPAPLAPAPVSQAQAPTTVEAPKPRHPQPKGARVPSRSRSGQAVAVNAESASVRAASASLENVERALEGLRLERETEARQGPPSAGHKGPPPSANGASFPVRPANGTAAGEGDTRARNRRRTRPPHPTSGTFGTQTRAPLPAADFDFSAANSHFDKAALFADVVGDEEGSYSSDLEEGEEGEVESGTKSPGEGKDAGGKKLKSPVYDKSKSFFDQLSEAAPPSSGPDPAHAPAAGRGRGGSRGRERREQERNLNMTTFGEAGVGRYGDGVKVGLGMGGYGWRGGRGRGRGRGRGRGGPRGAPAQAPVAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.22
4 0.22
5 0.2
6 0.21
7 0.21
8 0.19
9 0.21
10 0.22
11 0.22
12 0.25
13 0.25
14 0.24
15 0.26
16 0.24
17 0.2
18 0.19
19 0.21
20 0.19
21 0.19
22 0.21
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.14
27 0.1
28 0.1
29 0.12
30 0.15
31 0.18
32 0.23
33 0.3
34 0.35
35 0.4
36 0.45
37 0.52
38 0.52
39 0.52
40 0.54
41 0.52
42 0.5
43 0.45
44 0.46
45 0.36
46 0.33
47 0.32
48 0.26
49 0.22
50 0.23
51 0.24
52 0.18
53 0.18
54 0.2
55 0.19
56 0.17
57 0.16
58 0.14
59 0.12
60 0.13
61 0.13
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.14
71 0.18
72 0.2
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.22
77 0.22
78 0.17
79 0.13
80 0.13
81 0.1
82 0.08
83 0.07
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.1
88 0.08
89 0.1
90 0.1
91 0.13
92 0.11
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.13
100 0.17
101 0.16
102 0.21
103 0.23
104 0.25
105 0.27
106 0.3
107 0.31
108 0.29
109 0.3
110 0.29
111 0.28
112 0.25
113 0.22
114 0.22
115 0.21
116 0.2
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.2
124 0.23
125 0.22
126 0.23
127 0.22
128 0.22
129 0.24
130 0.23
131 0.23
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.23
136 0.22
137 0.2
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.15
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.19
158 0.23
159 0.3
160 0.36
161 0.43
162 0.52
163 0.51
164 0.6
165 0.63
166 0.69
167 0.7
168 0.71
169 0.7
170 0.66
171 0.72
172 0.66
173 0.64
174 0.55
175 0.48
176 0.43
177 0.38
178 0.37
179 0.3
180 0.27
181 0.21
182 0.19
183 0.17
184 0.14
185 0.12
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.14
219 0.16
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.17
224 0.2
225 0.23
226 0.25
227 0.23
228 0.22
229 0.22
230 0.23
231 0.22
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.17
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.12
252 0.2
253 0.24
254 0.33
255 0.41
256 0.51
257 0.6
258 0.68
259 0.77
260 0.8
261 0.81
262 0.82
263 0.79
264 0.71
265 0.66
266 0.6
267 0.52
268 0.43
269 0.38
270 0.29
271 0.25
272 0.23
273 0.19
274 0.16
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.16
279 0.16
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.13
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.09
327 0.11
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.26
332 0.29
333 0.33
334 0.35
335 0.35
336 0.33
337 0.4
338 0.41
339 0.37
340 0.39
341 0.45
342 0.48
343 0.54
344 0.54
345 0.49
346 0.52
347 0.49
348 0.47
349 0.39
350 0.31
351 0.27
352 0.26
353 0.25
354 0.21
355 0.19
356 0.16
357 0.15
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.14
364 0.18
365 0.19
366 0.22
367 0.19
368 0.18
369 0.22
370 0.27
371 0.26
372 0.22
373 0.22
374 0.21
375 0.29
376 0.32
377 0.35
378 0.39
379 0.48
380 0.54
381 0.62
382 0.66
383 0.68
384 0.75
385 0.76
386 0.75
387 0.75
388 0.74
389 0.68
390 0.63
391 0.54
392 0.45
393 0.37
394 0.28
395 0.18
396 0.14
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.1
406 0.09
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.1
419 0.11
420 0.15
421 0.22
422 0.3
423 0.38
424 0.47
425 0.55
426 0.62
427 0.69
428 0.75
429 0.74
430 0.75
431 0.73
432 0.73
433 0.7
434 0.66
435 0.63
436 0.59
437 0.54
438 0.46
439 0.41