Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5FQD0

Protein Details
Accession M5FQD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
599-622MYGIRAGKGRRQKHRDKLAHDVWAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
606-612KGRRQKH
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 6.5, cyto_mito 6.5, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004364  Aa-tRNA-synt_II  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004524  Asp-tRNA-ligase_1  
IPR002312  Asp/Asn-tRNA-synth_IIb  
IPR004115  GAD-like_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR004365  NA-bd_OB_tRNA  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004812  F:aminoacyl-tRNA ligase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006418  P:tRNA aminoacylation for protein translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00152  tRNA-synt_2  
PF01336  tRNA_anti-codon  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
Amino Acid Sequences MSFIILRDYTGTIQLVYRSADLDMPHELDLAELPPESIISIEGTVQARPSKARKEGARGQVELIVRKFTLLNPAERPLAFYPTQTDNLPSAEFRNKYRYLELRREDLANNIRKRSRVTRVIRNVLDHQGFLDVETPVLLNSTPEGAREFLVPTRLHPLNQQGEAVPHESGDPPSPPTFYALAQSPQQAKQLLICSGAIEKYYQFARCFRDEDGRKDRQPEFTQLDMEMGFVSWAPREHDLVSGWRIGGVEVKDAIEMIIRRIWEEMEGVRLPETFRTITYQEAMTKYGSDKPDTRIPLEIVDLTTLMPMEYQEEIRTAKTEQCRAVDCLRIPRESPFATRDLRFLGKKPNSEIQRITISEDNLMSWLPDHPQVRFGNNTDLMRDLNNSLSLEVGDHLFLWWRDDYHSGGSTPLGSLRLALAEQAEKLGKYTPPKEPHFLWVTEFPLFTKDVEKADLVGGEWSSSHHPFTAPMPEDIDVLMMGESRHLKKVRGQHYDLVLNGMEIGGGSVRIHDAVLQEFIMEEILKLNKPTMARFNHLLQSLRSGAPPHAGIALGFDRLMSILCNTPSIREVIAFPKTAEGRDPLFGSPSPAREGVLGMYGIRAGKGRRQKHRDKLAHDVWAGEETAGLQSVEQSSLTLMREQWKLSEDWGKDKRENNDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.17
4 0.17
5 0.15
6 0.15
7 0.17
8 0.16
9 0.17
10 0.18
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.14
17 0.12
18 0.1
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.16
33 0.18
34 0.19
35 0.25
36 0.31
37 0.36
38 0.42
39 0.5
40 0.53
41 0.6
42 0.67
43 0.71
44 0.71
45 0.64
46 0.58
47 0.55
48 0.51
49 0.48
50 0.4
51 0.33
52 0.26
53 0.25
54 0.25
55 0.21
56 0.28
57 0.25
58 0.3
59 0.31
60 0.34
61 0.37
62 0.35
63 0.39
64 0.31
65 0.34
66 0.29
67 0.26
68 0.28
69 0.29
70 0.31
71 0.27
72 0.28
73 0.23
74 0.25
75 0.25
76 0.21
77 0.22
78 0.27
79 0.29
80 0.3
81 0.36
82 0.37
83 0.39
84 0.46
85 0.5
86 0.51
87 0.59
88 0.6
89 0.57
90 0.56
91 0.56
92 0.49
93 0.48
94 0.48
95 0.47
96 0.48
97 0.5
98 0.5
99 0.5
100 0.55
101 0.56
102 0.56
103 0.57
104 0.6
105 0.64
106 0.71
107 0.78
108 0.74
109 0.7
110 0.65
111 0.62
112 0.55
113 0.44
114 0.35
115 0.28
116 0.25
117 0.21
118 0.18
119 0.11
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.05
127 0.05
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.13
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.24
141 0.25
142 0.24
143 0.26
144 0.32
145 0.32
146 0.33
147 0.33
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.27
152 0.18
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.15
160 0.16
161 0.17
162 0.16
163 0.18
164 0.18
165 0.16
166 0.18
167 0.17
168 0.18
169 0.19
170 0.23
171 0.23
172 0.24
173 0.26
174 0.25
175 0.22
176 0.24
177 0.25
178 0.22
179 0.2
180 0.18
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.13
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.13
189 0.15
190 0.16
191 0.2
192 0.24
193 0.27
194 0.29
195 0.29
196 0.36
197 0.38
198 0.45
199 0.49
200 0.52
201 0.51
202 0.55
203 0.55
204 0.53
205 0.52
206 0.5
207 0.47
208 0.41
209 0.4
210 0.34
211 0.32
212 0.24
213 0.21
214 0.13
215 0.08
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.12
261 0.09
262 0.09
263 0.12
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.19
278 0.22
279 0.28
280 0.29
281 0.29
282 0.26
283 0.25
284 0.23
285 0.22
286 0.18
287 0.12
288 0.1
289 0.09
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.13
306 0.17
307 0.21
308 0.21
309 0.23
310 0.25
311 0.27
312 0.28
313 0.27
314 0.24
315 0.28
316 0.28
317 0.27
318 0.26
319 0.25
320 0.27
321 0.24
322 0.25
323 0.2
324 0.21
325 0.23
326 0.23
327 0.22
328 0.21
329 0.23
330 0.22
331 0.22
332 0.28
333 0.3
334 0.31
335 0.34
336 0.38
337 0.37
338 0.4
339 0.39
340 0.32
341 0.32
342 0.3
343 0.29
344 0.25
345 0.22
346 0.19
347 0.18
348 0.15
349 0.11
350 0.1
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.24
364 0.27
365 0.27
366 0.21
367 0.21
368 0.19
369 0.17
370 0.17
371 0.12
372 0.09
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.1
390 0.11
391 0.13
392 0.14
393 0.15
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.07
405 0.06
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.1
415 0.12
416 0.17
417 0.22
418 0.29
419 0.36
420 0.4
421 0.44
422 0.43
423 0.46
424 0.45
425 0.41
426 0.35
427 0.3
428 0.29
429 0.26
430 0.24
431 0.19
432 0.17
433 0.16
434 0.14
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.14
440 0.13
441 0.13
442 0.13
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.11
450 0.11
451 0.12
452 0.11
453 0.12
454 0.13
455 0.15
456 0.22
457 0.21
458 0.2
459 0.22
460 0.22
461 0.22
462 0.2
463 0.18
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.05
468 0.05
469 0.07
470 0.11
471 0.13
472 0.19
473 0.21
474 0.22
475 0.28
476 0.37
477 0.45
478 0.49
479 0.52
480 0.51
481 0.54
482 0.55
483 0.5
484 0.43
485 0.32
486 0.24
487 0.2
488 0.14
489 0.09
490 0.05
491 0.05
492 0.03
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.09
507 0.08
508 0.06
509 0.05
510 0.07
511 0.09
512 0.1
513 0.11
514 0.12
515 0.14
516 0.16
517 0.2
518 0.25
519 0.28
520 0.32
521 0.36
522 0.39
523 0.41
524 0.43
525 0.42
526 0.34
527 0.34
528 0.33
529 0.3
530 0.27
531 0.23
532 0.21
533 0.22
534 0.22
535 0.17
536 0.15
537 0.14
538 0.12
539 0.15
540 0.15
541 0.12
542 0.11
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.06
548 0.07
549 0.1
550 0.11
551 0.14
552 0.15
553 0.16
554 0.17
555 0.18
556 0.17
557 0.15
558 0.17
559 0.2
560 0.23
561 0.23
562 0.22
563 0.26
564 0.27
565 0.27
566 0.27
567 0.24
568 0.23
569 0.25
570 0.27
571 0.22
572 0.24
573 0.23
574 0.26
575 0.26
576 0.26
577 0.27
578 0.25
579 0.25
580 0.22
581 0.23
582 0.18
583 0.17
584 0.14
585 0.11
586 0.1
587 0.11
588 0.11
589 0.11
590 0.13
591 0.13
592 0.21
593 0.31
594 0.4
595 0.49
596 0.59
597 0.69
598 0.77
599 0.86
600 0.87
601 0.84
602 0.85
603 0.81
604 0.78
605 0.68
606 0.59
607 0.49
608 0.42
609 0.35
610 0.25
611 0.18
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.09
616 0.07
617 0.08
618 0.1
619 0.11
620 0.1
621 0.09
622 0.1
623 0.13
624 0.15
625 0.15
626 0.17
627 0.22
628 0.26
629 0.26
630 0.28
631 0.28
632 0.28
633 0.31
634 0.36
635 0.33
636 0.4
637 0.46
638 0.5
639 0.53
640 0.59