Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074YEJ4

Protein Details
Accession A0A074YEJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-428DTWKSGKRGAYFRKRRRWARCKQIVDETRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-416KRGAYFRKRRR
557-567RGKYNKKRKIG
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 10, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSRVHPGDYVLLRLPSDTLKLVHIVPNTVVSIGKFGSFPCNLLIGRPYYFTYEITDKQSDSDVSRLRVVPASELNAEVLAEDALPSENPSEKADESFDIVADDGSLLLKNNRLTVDDASRQVLTMDEIEELKKAGTGSGRDIIEKILKSHTHLGEKTSFALAKYTLRKHKKYLRRFTVLPMNVSMLTEYMIAEKESSRVMELREESLGLVGSWANVHYHPDAEPTLTEEGTQLGGGRWLVVDDTGGLVVASVAEKMGILYHPDNEDEDSEDDAEAATQTAVEEAAPAEDDADVEMQDTSKDEATNGEPREGEEVRANGKKRPMNRHNTNLASTNTITVLHANAQPNVSLLKYFSYDTNIPNATHPLHTNLKTLTWLQLIDPSADPTYDEPERVPQAELDTWKSGKRGAYFRKRRRWARCKQIVDETRAGGFDGLIIASSMNPATILKNTVHLLRGSAHIAIYSPTVEPLTEIMDLYSKDRKAAFLDHITNDTTPPEEDFPLDPRLVLAPTLQTTRIRPWQVLPGRTHPLMMWRGGAEGYLFTARRVLPVDGKVEARGKYNKKRKIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.19
4 0.2
5 0.19
6 0.17
7 0.17
8 0.19
9 0.21
10 0.24
11 0.24
12 0.23
13 0.22
14 0.23
15 0.22
16 0.2
17 0.19
18 0.14
19 0.16
20 0.14
21 0.14
22 0.12
23 0.12
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.18
28 0.21
29 0.2
30 0.22
31 0.25
32 0.22
33 0.22
34 0.23
35 0.23
36 0.24
37 0.25
38 0.24
39 0.26
40 0.28
41 0.3
42 0.34
43 0.35
44 0.3
45 0.3
46 0.32
47 0.29
48 0.26
49 0.3
50 0.28
51 0.29
52 0.33
53 0.33
54 0.32
55 0.34
56 0.32
57 0.28
58 0.26
59 0.28
60 0.24
61 0.23
62 0.22
63 0.18
64 0.17
65 0.13
66 0.1
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.11
76 0.13
77 0.14
78 0.17
79 0.18
80 0.19
81 0.21
82 0.2
83 0.2
84 0.19
85 0.17
86 0.14
87 0.13
88 0.11
89 0.09
90 0.08
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.11
97 0.12
98 0.15
99 0.15
100 0.17
101 0.19
102 0.22
103 0.28
104 0.29
105 0.3
106 0.29
107 0.28
108 0.26
109 0.24
110 0.2
111 0.14
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.12
124 0.13
125 0.16
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.22
130 0.22
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.24
137 0.32
138 0.34
139 0.36
140 0.36
141 0.38
142 0.36
143 0.37
144 0.34
145 0.29
146 0.25
147 0.19
148 0.2
149 0.17
150 0.2
151 0.26
152 0.32
153 0.39
154 0.47
155 0.51
156 0.58
157 0.67
158 0.71
159 0.75
160 0.79
161 0.78
162 0.76
163 0.73
164 0.71
165 0.71
166 0.63
167 0.54
168 0.44
169 0.36
170 0.3
171 0.28
172 0.22
173 0.12
174 0.1
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.08
291 0.1
292 0.17
293 0.17
294 0.17
295 0.16
296 0.17
297 0.21
298 0.2
299 0.18
300 0.14
301 0.15
302 0.18
303 0.22
304 0.23
305 0.22
306 0.28
307 0.3
308 0.35
309 0.45
310 0.5
311 0.56
312 0.63
313 0.67
314 0.68
315 0.67
316 0.62
317 0.55
318 0.47
319 0.39
320 0.32
321 0.25
322 0.18
323 0.16
324 0.14
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.12
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.11
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.13
343 0.15
344 0.16
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.2
349 0.22
350 0.19
351 0.19
352 0.19
353 0.19
354 0.24
355 0.25
356 0.26
357 0.24
358 0.23
359 0.23
360 0.24
361 0.21
362 0.16
363 0.15
364 0.13
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.14
373 0.11
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.12
378 0.16
379 0.19
380 0.19
381 0.19
382 0.15
383 0.17
384 0.2
385 0.21
386 0.21
387 0.22
388 0.22
389 0.23
390 0.23
391 0.23
392 0.24
393 0.27
394 0.32
395 0.4
396 0.5
397 0.59
398 0.69
399 0.77
400 0.83
401 0.88
402 0.9
403 0.9
404 0.89
405 0.9
406 0.9
407 0.86
408 0.81
409 0.82
410 0.77
411 0.73
412 0.66
413 0.56
414 0.46
415 0.39
416 0.34
417 0.23
418 0.16
419 0.1
420 0.07
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.08
433 0.11
434 0.11
435 0.14
436 0.16
437 0.18
438 0.19
439 0.18
440 0.18
441 0.17
442 0.19
443 0.17
444 0.17
445 0.14
446 0.12
447 0.13
448 0.12
449 0.11
450 0.1
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.11
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.11
462 0.12
463 0.15
464 0.21
465 0.19
466 0.21
467 0.22
468 0.23
469 0.24
470 0.28
471 0.31
472 0.32
473 0.37
474 0.36
475 0.38
476 0.38
477 0.35
478 0.31
479 0.26
480 0.19
481 0.15
482 0.16
483 0.16
484 0.15
485 0.17
486 0.19
487 0.21
488 0.24
489 0.23
490 0.2
491 0.18
492 0.19
493 0.18
494 0.16
495 0.14
496 0.13
497 0.16
498 0.19
499 0.2
500 0.22
501 0.24
502 0.31
503 0.39
504 0.38
505 0.38
506 0.39
507 0.47
508 0.52
509 0.55
510 0.54
511 0.52
512 0.56
513 0.54
514 0.52
515 0.42
516 0.42
517 0.39
518 0.34
519 0.29
520 0.23
521 0.24
522 0.22
523 0.22
524 0.15
525 0.11
526 0.12
527 0.15
528 0.15
529 0.14
530 0.18
531 0.18
532 0.21
533 0.24
534 0.25
535 0.26
536 0.3
537 0.33
538 0.32
539 0.33
540 0.35
541 0.37
542 0.35
543 0.36
544 0.41
545 0.48
546 0.56
547 0.65