Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074YNC2

Protein Details
Accession A0A074YNC2    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-116GAPAAPEKKTRKKAEPRDPNQPKRPLTHydrophilic
288-310EAVAEEPKKKRGRKAKEEEVAVPBasic
313-339TPAEPPASAKKEKKEKKKGRKSVGGEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-108PEKKTRKKAEPRDP
235-269PPVKTPKSALKGGRKKAAPPASSPPLPASSPVKKG
278-283NKRKSK
292-335EEPKKKRGRKAKEEEVAVPASTPAEPPASAKKEKKEKKKGRKSV
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.999, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPRAKSVKPEVAPKTEADLKQITIDKAEFVRTRDALVTSWITLQNALKNATSAYIDHSNAVLGGTVDLDPSQMDLGAFLQSGDLVTVGGGAPAAPEKKTRKKAEPRDPNQPKRPLTAYLLWLGENREKIHSELGPEQKRGEISSEGTKRWKMLPEEVKQKYKDAYQASREIYNKEFADFKANGAPVAADSPDAEEDVEAEEEAAPAAAGADSDDESDDDSTSDEEEAPPKEPTPPPVKTPKSALKGGRKKAAPPASSPPLPASSPVKKGAFTAVNGSNKRKSKTTDAEAVAEEPKKKRGRKAKEEEVAVPASTPAEPPASAKKEKKEKKKGRKSVGGEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.47
4 0.42
5 0.38
6 0.33
7 0.37
8 0.4
9 0.34
10 0.29
11 0.29
12 0.27
13 0.25
14 0.31
15 0.28
16 0.26
17 0.32
18 0.29
19 0.31
20 0.3
21 0.3
22 0.24
23 0.26
24 0.25
25 0.19
26 0.22
27 0.21
28 0.19
29 0.2
30 0.22
31 0.22
32 0.23
33 0.24
34 0.21
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.14
40 0.16
41 0.19
42 0.19
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.11
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.03
72 0.03
73 0.04
74 0.04
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.14
83 0.22
84 0.33
85 0.43
86 0.49
87 0.58
88 0.67
89 0.78
90 0.83
91 0.86
92 0.82
93 0.84
94 0.87
95 0.87
96 0.85
97 0.83
98 0.74
99 0.67
100 0.64
101 0.56
102 0.51
103 0.45
104 0.38
105 0.32
106 0.31
107 0.26
108 0.24
109 0.23
110 0.21
111 0.19
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.18
116 0.2
117 0.18
118 0.19
119 0.23
120 0.31
121 0.33
122 0.33
123 0.32
124 0.3
125 0.3
126 0.27
127 0.23
128 0.16
129 0.14
130 0.22
131 0.24
132 0.24
133 0.27
134 0.27
135 0.26
136 0.27
137 0.29
138 0.24
139 0.3
140 0.36
141 0.4
142 0.5
143 0.53
144 0.56
145 0.52
146 0.51
147 0.43
148 0.37
149 0.37
150 0.32
151 0.32
152 0.3
153 0.34
154 0.34
155 0.37
156 0.36
157 0.32
158 0.28
159 0.27
160 0.23
161 0.19
162 0.19
163 0.15
164 0.2
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.02
193 0.03
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.18
218 0.19
219 0.24
220 0.29
221 0.3
222 0.34
223 0.43
224 0.47
225 0.44
226 0.5
227 0.54
228 0.51
229 0.55
230 0.58
231 0.59
232 0.64
233 0.68
234 0.68
235 0.61
236 0.59
237 0.62
238 0.62
239 0.53
240 0.49
241 0.51
242 0.5
243 0.49
244 0.47
245 0.4
246 0.34
247 0.32
248 0.31
249 0.3
250 0.29
251 0.32
252 0.37
253 0.36
254 0.33
255 0.33
256 0.37
257 0.33
258 0.28
259 0.3
260 0.31
261 0.38
262 0.41
263 0.45
264 0.47
265 0.49
266 0.52
267 0.51
268 0.49
269 0.51
270 0.57
271 0.59
272 0.6
273 0.57
274 0.56
275 0.52
276 0.48
277 0.43
278 0.38
279 0.36
280 0.29
281 0.35
282 0.41
283 0.46
284 0.54
285 0.6
286 0.67
287 0.74
288 0.82
289 0.84
290 0.83
291 0.83
292 0.76
293 0.69
294 0.6
295 0.49
296 0.39
297 0.28
298 0.21
299 0.17
300 0.14
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.15
305 0.24
306 0.3
307 0.38
308 0.44
309 0.53
310 0.62
311 0.71
312 0.79
313 0.81
314 0.86
315 0.89
316 0.94
317 0.94
318 0.94
319 0.94