FuNGI

A0A074YIL2

Protein Details

Accession

A0A074YIL2

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-55	QGAIRRKKPTGPFAPKPSRAQAKRPPAPPPQKL	Hydrophilic
400-426	ERREKEEKIKARKLRRKLVKIEKNYEY	Basic
512-534	GSESINHKRMKKQHRRDMSGATS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-51	IRRKKPTGPFAPKPSRAQAKRPPAPP
178-186	AKKRQPFKK
401-419	RREKEEKIKARKLRRKLVK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPPGVSPVSRQPSTTPNNGQGAIRRKKPTGPFAPKPSRAQAKRPPAPPPQKLTGTTKPLAATNAAAQLQSEPEDDPSTYHEIPIRATKKSILEGMRFHAMKFISNNTINPYDGTSFVRPVKLHRRFPKDTPNTPVTDDPELAKEREKEAIRKADRAAEREATQAQIAPTDKAAAAKKRQPFKKKTEDVYYPTDTPEAQKRARLRYEEGRPWHFEDFENKNIWVGTYEEPLSESNVMFLFQDDGSFKMVPIEKWYRFNQTGRFKLIPLQEAEDIMNKRTSNPRWFLDNDKSREQKRAELARQERLTKGRVGMRGENRVKNEDDGENENEDVADDVDELDFEAEDEFQDDDEGKLFGEDEDEAKEAASKLKKDRHNANIFAGTGVKDEKDWEKEEMEEERREKEEKIKARKLRRKLVKIEKNYEYDDDESENEFSEPEGLDESDVERERAENEHKKDEELKANGDKAASQMSTNANTPSGRVEKHSGGIQAKGSMSNLKRPGSPNLSETSGSESINHKRMKKQHRRDMSGATSPMGRLAGSGSDTETERRARPMTLNPRSNPGSPGNATPIGSRAGSPVPMPTIEEIKASIPAEGISIPELIKKFREQVPKTKEGNKAFIGLVLSVARALPGNLVGLR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.46
3	0.5
4	0.53
5	0.5
6	0.49
7	0.53
8	0.53
9	0.52
10	0.5
11	0.55
12	0.55
13	0.56
14	0.55
15	0.54
16	0.61
17	0.67
18	0.7
19	0.7
20	0.72
21	0.73
22	0.78
23	0.85
24	0.83
25	0.81
26	0.8
27	0.79
28	0.75
29	0.75
30	0.75
31	0.76
32	0.77
33	0.76
34	0.75
35	0.75
36	0.8
37	0.78
38	0.76
39	0.72
40	0.69
41	0.69
42	0.69
43	0.67
44	0.64
45	0.58
46	0.53
47	0.47
48	0.43
49	0.4
50	0.33
51	0.26
52	0.21
53	0.24
54	0.22
55	0.2
56	0.19
57	0.18
58	0.18
59	0.17
60	0.16
61	0.11
62	0.13
63	0.15
64	0.15
65	0.15
66	0.18
67	0.23
68	0.22
69	0.23
70	0.24
71	0.23
72	0.26
73	0.35
74	0.34
75	0.3
76	0.31
77	0.34
78	0.34
79	0.36
80	0.4
81	0.35
82	0.37
83	0.37
84	0.4
85	0.43
86	0.4
87	0.36
88	0.34
89	0.29
90	0.28
91	0.28
92	0.28
93	0.27
94	0.29
95	0.31
96	0.31
97	0.33
98	0.3
99	0.28
100	0.26
101	0.21
102	0.2
103	0.24
104	0.21
105	0.23
106	0.24
107	0.28
108	0.26
109	0.32
110	0.42
111	0.47
112	0.55
113	0.6
114	0.67
115	0.69
116	0.75
117	0.79
118	0.77
119	0.74
120	0.72
121	0.67
122	0.6
123	0.57
124	0.53
125	0.46
126	0.4
127	0.34
128	0.28
129	0.28
130	0.28
131	0.26
132	0.27
133	0.25
134	0.24
135	0.3
136	0.33
137	0.33
138	0.38
139	0.48
140	0.46
141	0.48
142	0.48
143	0.49
144	0.49
145	0.47
146	0.44
147	0.38
148	0.36
149	0.35
150	0.34
151	0.26
152	0.23
153	0.21
154	0.17
155	0.17
156	0.17
157	0.14
158	0.14
159	0.14
160	0.14
161	0.16
162	0.21
163	0.24
164	0.29
165	0.36
166	0.42
167	0.5
168	0.59
169	0.65
170	0.69
171	0.72
172	0.77
173	0.78
174	0.78
175	0.77
176	0.75
177	0.7
178	0.68
179	0.62
180	0.52
181	0.44
182	0.38
183	0.3
184	0.26
185	0.29
186	0.29
187	0.26
188	0.3
189	0.35
190	0.42
191	0.47
192	0.48
193	0.46
194	0.49
195	0.56
196	0.59
197	0.59
198	0.56
199	0.54
200	0.54
201	0.49
202	0.41
203	0.34
204	0.34
205	0.33
206	0.33
207	0.32
208	0.28
209	0.27
210	0.26
211	0.24
212	0.18
213	0.15
214	0.12
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.13
219	0.14
220	0.14
221	0.12
222	0.1
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.08
231	0.07
232	0.08
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.12
237	0.14
238	0.13
239	0.2
240	0.26
241	0.26
242	0.3
243	0.33
244	0.36
245	0.38
246	0.41
247	0.44
248	0.45
249	0.47
250	0.48
251	0.47
252	0.4
253	0.42
254	0.42
255	0.35
256	0.28
257	0.26
258	0.21
259	0.2
260	0.2
261	0.2
262	0.18
263	0.16
264	0.17
265	0.15
266	0.17
267	0.23
268	0.28
269	0.3
270	0.34
271	0.34
272	0.36
273	0.38
274	0.42
275	0.45
276	0.47
277	0.45
278	0.47
279	0.51
280	0.48
281	0.53
282	0.48
283	0.44
284	0.43
285	0.48
286	0.45
287	0.49
288	0.51
289	0.52
290	0.53
291	0.5
292	0.45
293	0.39
294	0.36
295	0.29
296	0.28
297	0.25
298	0.26
299	0.28
300	0.31
301	0.33
302	0.4
303	0.44
304	0.44
305	0.41
306	0.4
307	0.38
308	0.32
309	0.31
310	0.22
311	0.2
312	0.2
313	0.2
314	0.18
315	0.17
316	0.15
317	0.13
318	0.12
319	0.09
320	0.06
321	0.04
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.07
354	0.12
355	0.14
356	0.16
357	0.22
358	0.3
359	0.36
360	0.42
361	0.5
362	0.55
363	0.59
364	0.58
365	0.55
366	0.5
367	0.45
368	0.38
369	0.31
370	0.21
371	0.15
372	0.13
373	0.1
374	0.07
375	0.09
376	0.12
377	0.15
378	0.17
379	0.18
380	0.18
381	0.18
382	0.21
383	0.24
384	0.25
385	0.26
386	0.25
387	0.26
388	0.27
389	0.28
390	0.28
391	0.3
392	0.34
393	0.39
394	0.48
395	0.54
396	0.6
397	0.7
398	0.77
399	0.78
400	0.8
401	0.82
402	0.8
403	0.82
404	0.85
405	0.83
406	0.83
407	0.82
408	0.77
409	0.7
410	0.63
411	0.55
412	0.46
413	0.38
414	0.31
415	0.24
416	0.2
417	0.18
418	0.16
419	0.15
420	0.12
421	0.1
422	0.09
423	0.09
424	0.08
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.11
432	0.12
433	0.12
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.16
438	0.24
439	0.28
440	0.32
441	0.4
442	0.4
443	0.42
444	0.46
445	0.47
446	0.47
447	0.41
448	0.41
449	0.38
450	0.38
451	0.37
452	0.32
453	0.27
454	0.2
455	0.21
456	0.16
457	0.12
458	0.14
459	0.16
460	0.18
461	0.19
462	0.18
463	0.17
464	0.17
465	0.17
466	0.19
467	0.2
468	0.19
469	0.22
470	0.26
471	0.26
472	0.28
473	0.3
474	0.3
475	0.28
476	0.3
477	0.27
478	0.25
479	0.23
480	0.22
481	0.2
482	0.22
483	0.22
484	0.28
485	0.32
486	0.31
487	0.35
488	0.37
489	0.44
490	0.44
491	0.44
492	0.39
493	0.37
494	0.38
495	0.35
496	0.32
497	0.31
498	0.26
499	0.24
500	0.24
501	0.25
502	0.28
503	0.36
504	0.4
505	0.37
506	0.44
507	0.53
508	0.62
509	0.69
510	0.74
511	0.77
512	0.82
513	0.87
514	0.83
515	0.82
516	0.77
517	0.73
518	0.63
519	0.53
520	0.44
521	0.35
522	0.32
523	0.23
524	0.16
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.12
532	0.13
533	0.14
534	0.17
535	0.19
536	0.2
537	0.24
538	0.25
539	0.26
540	0.3
541	0.39
542	0.46
543	0.53
544	0.59
545	0.57
546	0.62
547	0.64
548	0.6
549	0.54
550	0.47
551	0.44
552	0.38
553	0.39
554	0.37
555	0.35
556	0.34
557	0.3
558	0.28
559	0.24
560	0.22
561	0.19
562	0.17
563	0.16
564	0.17
565	0.17
566	0.17
567	0.17
568	0.17
569	0.19
570	0.18
571	0.2
572	0.19
573	0.19
574	0.18
575	0.17
576	0.21
577	0.19
578	0.17
579	0.14
580	0.13
581	0.13
582	0.12
583	0.12
584	0.09
585	0.1
586	0.1
587	0.14
588	0.15
589	0.16
590	0.19
591	0.23
592	0.28
593	0.34
594	0.45
595	0.47
596	0.56
597	0.63
598	0.69
599	0.71
600	0.73
601	0.75
602	0.71
603	0.72
604	0.63
605	0.57
606	0.48
607	0.44
608	0.38
609	0.28
610	0.24
611	0.17
612	0.15
613	0.12
614	0.12
615	0.1
616	0.09
617	0.09
618	0.08
619	0.08

A0A074YIL2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer