Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EX04

Protein Details
Accession A7EX04    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-315IASPTRSERARSRRRREEDGDDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-308MSRPDSRSGSRPGSRSGSRGRSKSRIASPTRSERARSRRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008501  THOC7/Mft1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0000445  C:THO complex part of transcription export complex  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051569  P:regulation of histone H3-K4 methylation  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ssl:SS1G_09863  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05615  THOC7  
Amino Acid Sequences MTSYQLLDQREEDELHKSRLLNVEEKPFKRITKRLLSPGSLVITPSKLPTPPLDTTEETGESDRQKFLDERRQLREDVLLDFGAFNSSLARIQFLRNSNERERERYKADKEHILETAQAVRDSTAQLRIQLEEARKTLEQRKKFDELAEKITNNMLLRPRKDQEINLRKLEEECKELERESRTYGETWKERREQFGRIVEEGMQLRRLIRDEKEEVERREGMDGGEEDGEVGDGQTPRRNSTSGDATPRQGSPERGTLKPRPMPSGSMSRPDSRSGSRPGSRSGSRGRSKSRIASPTRSERARSRRRREEDGDDSAMEDTNSRQLDMDPTVDTPMVDGMNSTQDEAQEGTPQVTINEPEEGAVGEGEIGDKMDTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.33
4 0.32
5 0.33
6 0.39
7 0.42
8 0.39
9 0.4
10 0.47
11 0.53
12 0.54
13 0.54
14 0.51
15 0.53
16 0.56
17 0.59
18 0.57
19 0.59
20 0.65
21 0.7
22 0.71
23 0.68
24 0.62
25 0.59
26 0.52
27 0.42
28 0.35
29 0.28
30 0.23
31 0.21
32 0.21
33 0.19
34 0.17
35 0.19
36 0.22
37 0.27
38 0.27
39 0.3
40 0.34
41 0.33
42 0.35
43 0.36
44 0.33
45 0.27
46 0.26
47 0.26
48 0.25
49 0.25
50 0.24
51 0.21
52 0.23
53 0.25
54 0.31
55 0.37
56 0.43
57 0.47
58 0.54
59 0.56
60 0.54
61 0.52
62 0.49
63 0.4
64 0.33
65 0.28
66 0.21
67 0.18
68 0.17
69 0.15
70 0.11
71 0.09
72 0.08
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.1
79 0.13
80 0.19
81 0.23
82 0.28
83 0.32
84 0.39
85 0.43
86 0.51
87 0.52
88 0.54
89 0.53
90 0.53
91 0.54
92 0.56
93 0.56
94 0.55
95 0.57
96 0.56
97 0.54
98 0.52
99 0.47
100 0.39
101 0.33
102 0.26
103 0.26
104 0.19
105 0.17
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.17
114 0.18
115 0.18
116 0.19
117 0.21
118 0.22
119 0.2
120 0.2
121 0.21
122 0.21
123 0.24
124 0.32
125 0.36
126 0.4
127 0.42
128 0.47
129 0.49
130 0.49
131 0.5
132 0.49
133 0.45
134 0.45
135 0.44
136 0.38
137 0.34
138 0.34
139 0.31
140 0.22
141 0.22
142 0.21
143 0.22
144 0.24
145 0.29
146 0.3
147 0.33
148 0.35
149 0.36
150 0.41
151 0.46
152 0.49
153 0.46
154 0.45
155 0.41
156 0.41
157 0.4
158 0.3
159 0.22
160 0.19
161 0.19
162 0.19
163 0.19
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.21
172 0.22
173 0.25
174 0.28
175 0.31
176 0.36
177 0.36
178 0.41
179 0.41
180 0.39
181 0.4
182 0.42
183 0.39
184 0.34
185 0.33
186 0.27
187 0.27
188 0.25
189 0.19
190 0.14
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.18
198 0.2
199 0.23
200 0.3
201 0.35
202 0.35
203 0.36
204 0.35
205 0.3
206 0.29
207 0.26
208 0.18
209 0.15
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.05
218 0.04
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.12
223 0.13
224 0.15
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.21
229 0.27
230 0.27
231 0.34
232 0.33
233 0.34
234 0.35
235 0.34
236 0.33
237 0.28
238 0.28
239 0.24
240 0.3
241 0.32
242 0.33
243 0.39
244 0.42
245 0.47
246 0.5
247 0.49
248 0.46
249 0.44
250 0.44
251 0.42
252 0.46
253 0.4
254 0.41
255 0.42
256 0.41
257 0.41
258 0.41
259 0.41
260 0.35
261 0.38
262 0.37
263 0.41
264 0.42
265 0.42
266 0.44
267 0.47
268 0.45
269 0.45
270 0.47
271 0.49
272 0.51
273 0.56
274 0.58
275 0.58
276 0.62
277 0.64
278 0.64
279 0.64
280 0.63
281 0.64
282 0.65
283 0.68
284 0.7
285 0.65
286 0.61
287 0.62
288 0.66
289 0.69
290 0.72
291 0.73
292 0.77
293 0.81
294 0.85
295 0.83
296 0.81
297 0.78
298 0.74
299 0.66
300 0.55
301 0.49
302 0.4
303 0.34
304 0.24
305 0.17
306 0.11
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.19
313 0.2
314 0.21
315 0.17
316 0.17
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.13
321 0.13
322 0.11
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.13
327 0.14
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.15
332 0.17
333 0.17
334 0.16
335 0.17
336 0.16
337 0.16
338 0.17
339 0.16
340 0.17
341 0.18
342 0.15
343 0.17
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.15
348 0.13
349 0.1
350 0.08
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06