Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VKF8

Protein Details
Accession A0A0A2VKF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-223HGPDNRQRKRGRCRDFDSKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-290RGGRAGRAGKKNRGGKNSSRG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045137  RBM26/27  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12257  RRM1_RBM26_like  
Amino Acid Sequences MLFPEEDAPQLKTWIVKRIENTYVPPTPRAAYAAAKSDADSDVLADYVIALLKHDGDQAAIRKLCEEEIPDFLTEDSKAFVDDVFQAIADKSYMPGATPAPKLPSASNSRTPANLPPRPSNSRKRGFDDGRDEHNYYSSSRHGERAHKQLRRGGRRNDNYSGFAPPIGMGTGLPPFDTSNPMEAFLRMHTMSMPFPGMPDYSGHGPDNRQRKRGRCRDFDSKGYCSRGSTCLYDHGQETDVFGDFNFGDGFMDMAHMMSRGPQFMGDAPRGGRAGRAGKKNRGGKNSSRGSRAAFSAEGPVQDRSKSTIVVENIPEECLSEERVRDFFAQFGNIQQVTMQTHKHLAIVKYNSWDEASAAYKSPKVIFNNRFVKVFWYKDEIKGPNLRGTKLGANGLEEGSNGGDDVGAAPELDAEEFQRRQEEAQRSHEEKESKRSELELKRQELEKQQQELLAKHRAETEKLQAKLYAKSSSGNGGGTTDENGPPTGSTDMLRAKLALLEQEAKILGIDPENPDTEEGSLGGFRGGYRGRVYRGRGSFARGGFAPRGRGSFRGSGERHAAYAQFSIDNRPKKVAIAGVDFTSTEKDEALRHFLISNGDFESVESGAEQTMVSFPDRKTAEKFYFSLQGKELPGISGKLELSWVNTPLPPVGTGGASSAPAGPSAIDKAAAESEDVGEDFGNMEDQEGEYAGIGKARQDEPKREVNMDYEMPDEEAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.37
4 0.4
5 0.46
6 0.51
7 0.49
8 0.51
9 0.5
10 0.52
11 0.5
12 0.48
13 0.43
14 0.38
15 0.36
16 0.34
17 0.29
18 0.28
19 0.29
20 0.33
21 0.32
22 0.31
23 0.3
24 0.29
25 0.27
26 0.22
27 0.18
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.16
45 0.19
46 0.27
47 0.27
48 0.26
49 0.26
50 0.27
51 0.28
52 0.25
53 0.25
54 0.19
55 0.22
56 0.24
57 0.23
58 0.22
59 0.21
60 0.2
61 0.17
62 0.15
63 0.12
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.11
83 0.14
84 0.19
85 0.21
86 0.23
87 0.25
88 0.27
89 0.28
90 0.28
91 0.32
92 0.35
93 0.39
94 0.44
95 0.44
96 0.45
97 0.44
98 0.45
99 0.47
100 0.48
101 0.47
102 0.45
103 0.49
104 0.55
105 0.62
106 0.68
107 0.69
108 0.69
109 0.74
110 0.75
111 0.73
112 0.76
113 0.73
114 0.74
115 0.73
116 0.68
117 0.65
118 0.65
119 0.6
120 0.5
121 0.46
122 0.39
123 0.3
124 0.28
125 0.24
126 0.24
127 0.24
128 0.3
129 0.33
130 0.4
131 0.46
132 0.54
133 0.6
134 0.59
135 0.62
136 0.63
137 0.68
138 0.7
139 0.72
140 0.71
141 0.73
142 0.77
143 0.79
144 0.79
145 0.72
146 0.65
147 0.58
148 0.51
149 0.4
150 0.31
151 0.25
152 0.18
153 0.15
154 0.11
155 0.09
156 0.06
157 0.07
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.18
169 0.18
170 0.17
171 0.18
172 0.15
173 0.17
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.2
193 0.25
194 0.35
195 0.37
196 0.43
197 0.47
198 0.56
199 0.65
200 0.72
201 0.76
202 0.74
203 0.77
204 0.8
205 0.79
206 0.78
207 0.73
208 0.67
209 0.63
210 0.58
211 0.51
212 0.41
213 0.39
214 0.34
215 0.31
216 0.27
217 0.23
218 0.25
219 0.26
220 0.26
221 0.24
222 0.21
223 0.2
224 0.18
225 0.17
226 0.12
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.12
252 0.16
253 0.13
254 0.15
255 0.14
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.13
260 0.14
261 0.21
262 0.26
263 0.35
264 0.39
265 0.46
266 0.54
267 0.62
268 0.64
269 0.63
270 0.62
271 0.6
272 0.64
273 0.66
274 0.61
275 0.56
276 0.51
277 0.46
278 0.42
279 0.36
280 0.28
281 0.2
282 0.17
283 0.17
284 0.16
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.14
294 0.14
295 0.17
296 0.18
297 0.2
298 0.2
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.16
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.11
319 0.13
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.1
328 0.12
329 0.12
330 0.14
331 0.17
332 0.16
333 0.21
334 0.23
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.22
339 0.19
340 0.18
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.13
350 0.15
351 0.18
352 0.26
353 0.29
354 0.38
355 0.44
356 0.45
357 0.44
358 0.39
359 0.41
360 0.37
361 0.34
362 0.27
363 0.26
364 0.26
365 0.28
366 0.35
367 0.31
368 0.3
369 0.33
370 0.33
371 0.34
372 0.34
373 0.31
374 0.26
375 0.26
376 0.25
377 0.22
378 0.22
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.12
384 0.1
385 0.08
386 0.06
387 0.06
388 0.04
389 0.04
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.04
400 0.03
401 0.04
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.13
408 0.21
409 0.28
410 0.29
411 0.36
412 0.43
413 0.44
414 0.46
415 0.49
416 0.46
417 0.41
418 0.46
419 0.42
420 0.37
421 0.35
422 0.35
423 0.39
424 0.41
425 0.49
426 0.47
427 0.45
428 0.47
429 0.48
430 0.49
431 0.48
432 0.49
433 0.45
434 0.41
435 0.39
436 0.39
437 0.39
438 0.38
439 0.35
440 0.34
441 0.28
442 0.25
443 0.3
444 0.29
445 0.3
446 0.3
447 0.35
448 0.34
449 0.35
450 0.36
451 0.33
452 0.34
453 0.35
454 0.35
455 0.29
456 0.22
457 0.22
458 0.22
459 0.22
460 0.21
461 0.17
462 0.14
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.1
473 0.11
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.12
478 0.15
479 0.16
480 0.16
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.14
485 0.12
486 0.11
487 0.13
488 0.12
489 0.13
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.09
495 0.07
496 0.09
497 0.1
498 0.12
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.13
503 0.13
504 0.11
505 0.09
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.09
513 0.09
514 0.11
515 0.15
516 0.17
517 0.22
518 0.27
519 0.32
520 0.37
521 0.39
522 0.42
523 0.4
524 0.43
525 0.44
526 0.39
527 0.37
528 0.29
529 0.3
530 0.29
531 0.3
532 0.28
533 0.24
534 0.27
535 0.26
536 0.28
537 0.29
538 0.31
539 0.32
540 0.36
541 0.36
542 0.37
543 0.4
544 0.38
545 0.34
546 0.29
547 0.27
548 0.2
549 0.2
550 0.17
551 0.14
552 0.14
553 0.21
554 0.27
555 0.33
556 0.33
557 0.35
558 0.35
559 0.33
560 0.36
561 0.32
562 0.29
563 0.28
564 0.28
565 0.25
566 0.25
567 0.24
568 0.22
569 0.19
570 0.16
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.13
575 0.16
576 0.21
577 0.2
578 0.2
579 0.2
580 0.21
581 0.24
582 0.22
583 0.21
584 0.17
585 0.17
586 0.16
587 0.16
588 0.16
589 0.12
590 0.11
591 0.09
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.05
597 0.07
598 0.08
599 0.1
600 0.14
601 0.14
602 0.22
603 0.24
604 0.26
605 0.3
606 0.37
607 0.41
608 0.41
609 0.43
610 0.39
611 0.46
612 0.45
613 0.43
614 0.36
615 0.36
616 0.32
617 0.33
618 0.29
619 0.21
620 0.22
621 0.19
622 0.18
623 0.16
624 0.15
625 0.13
626 0.15
627 0.14
628 0.16
629 0.18
630 0.19
631 0.18
632 0.19
633 0.2
634 0.2
635 0.2
636 0.17
637 0.15
638 0.14
639 0.13
640 0.12
641 0.12
642 0.12
643 0.11
644 0.11
645 0.11
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.08
650 0.09
651 0.12
652 0.12
653 0.11
654 0.11
655 0.13
656 0.15
657 0.15
658 0.13
659 0.11
660 0.12
661 0.12
662 0.12
663 0.1
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.07
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.09
674 0.08
675 0.08
676 0.07
677 0.09
678 0.09
679 0.1
680 0.1
681 0.12
682 0.17
683 0.21
684 0.3
685 0.36
686 0.44
687 0.48
688 0.57
689 0.59
690 0.56
691 0.55
692 0.49
693 0.48
694 0.42
695 0.38
696 0.31
697 0.27