Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0A2WFH5

Protein Details
Accession A0A0A2WFH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-196RAELKKKTPGNKRKREEEEDBasic
208-281GGAKMKSEEERKKKKKYGGVKEPNPLSVKKTKKNPQQVEEERRRKQKEEAKEAAEKPKKKRRRRAKGTGDGTTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-191EEKAKFRAELKKKTPGNKRKR
211-274KMKSEEERKKKKKYGGVKEPNPLSVKKTKKNPQQVEEERRRKQKEEAKEAAEKPKKKRRRRAKG
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 12.5, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRGKRSKQYRKLMEQYCMTFGFREAYQVLVDAEMVQDACRFKMDLTAGLERTVHGKVKPMITQCEIRKLYEKKNEPGIRDAIELAKNYERRRCGHHPDEYPKPLSTLECLSSVVDPKQTGQNKHRYVVASQSQEVRRALRGVRAVPLIYIKRSVMILEPMADDSAEVRLREEKAKFRAELKKKTPGNKRKREEEEDGDEGEGGDGEEGGAKMKSEEERKKKKKYGGVKEPNPLSVKKTKKNPQQVEEERRRKQKEEAKEAAEKPKKKRRRRAKGTGDGTTGESGGGDAGPEGDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.71
3 0.64
4 0.56
5 0.46
6 0.37
7 0.31
8 0.27
9 0.2
10 0.21
11 0.17
12 0.16
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.12
17 0.12
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.06
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.17
30 0.18
31 0.2
32 0.24
33 0.29
34 0.28
35 0.29
36 0.29
37 0.23
38 0.24
39 0.22
40 0.2
41 0.15
42 0.22
43 0.25
44 0.29
45 0.34
46 0.35
47 0.38
48 0.38
49 0.46
50 0.41
51 0.47
52 0.44
53 0.41
54 0.46
55 0.47
56 0.52
57 0.55
58 0.59
59 0.54
60 0.63
61 0.65
62 0.59
63 0.58
64 0.52
65 0.44
66 0.38
67 0.34
68 0.27
69 0.25
70 0.23
71 0.21
72 0.23
73 0.26
74 0.28
75 0.33
76 0.33
77 0.33
78 0.41
79 0.46
80 0.5
81 0.54
82 0.59
83 0.61
84 0.64
85 0.7
86 0.66
87 0.61
88 0.52
89 0.45
90 0.38
91 0.3
92 0.26
93 0.2
94 0.17
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.19
105 0.24
106 0.29
107 0.34
108 0.43
109 0.44
110 0.45
111 0.47
112 0.4
113 0.37
114 0.38
115 0.37
116 0.3
117 0.28
118 0.33
119 0.31
120 0.32
121 0.32
122 0.26
123 0.21
124 0.21
125 0.2
126 0.18
127 0.2
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.16
133 0.19
134 0.15
135 0.13
136 0.13
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.08
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.07
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.11
156 0.12
157 0.17
158 0.2
159 0.24
160 0.28
161 0.32
162 0.32
163 0.37
164 0.46
165 0.5
166 0.56
167 0.55
168 0.6
169 0.61
170 0.69
171 0.73
172 0.73
173 0.76
174 0.77
175 0.78
176 0.78
177 0.82
178 0.8
179 0.76
180 0.72
181 0.67
182 0.59
183 0.53
184 0.43
185 0.34
186 0.27
187 0.2
188 0.13
189 0.07
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.08
200 0.13
201 0.21
202 0.31
203 0.41
204 0.53
205 0.62
206 0.72
207 0.77
208 0.8
209 0.8
210 0.81
211 0.82
212 0.82
213 0.84
214 0.81
215 0.82
216 0.76
217 0.72
218 0.64
219 0.54
220 0.48
221 0.47
222 0.49
223 0.49
224 0.57
225 0.62
226 0.69
227 0.79
228 0.82
229 0.79
230 0.81
231 0.83
232 0.84
233 0.85
234 0.85
235 0.82
236 0.83
237 0.82
238 0.75
239 0.74
240 0.72
241 0.72
242 0.72
243 0.71
244 0.67
245 0.7
246 0.72
247 0.73
248 0.73
249 0.69
250 0.69
251 0.73
252 0.77
253 0.79
254 0.86
255 0.86
256 0.89
257 0.93
258 0.94
259 0.94
260 0.95
261 0.92
262 0.87
263 0.78
264 0.68
265 0.6
266 0.5
267 0.38
268 0.27
269 0.19
270 0.13
271 0.1
272 0.08
273 0.06
274 0.05
275 0.05