Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VYN0

Protein Details
Accession A0A0A2VYN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-225HDPEERRRRQRDSRSRYRDRDSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-235RRRRQRDSRSRYRDRDSGYRRGSGHRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MQIQSLASKPPGHLAHYLLPSYRPESQVPCGTSPAAMDLDIEMGDAVEGSHDAQVAHDPVADDILQPDEVDEPGEIADDEPKPDEDATIVPNKINISGVDSLHTDDIKAYVKSHFAPVDRVEWVDDTSANLVFGSDSTARDALVALSSIEIADATALPIGEALPAKPVEGRSEITIHVRFAVARDRKQAGAALRSRYYLLHPEHDPEERRRRQRDSRSRYRDRDSGYRRGSGHRRRDSDEEVETFEASMYDDAPRQATRRRSQSRERQDSYARENRGKELFADRASRRDRSASPLRDDDGDAAMDSIQGSSRNKESARAVKERLRTGNRSKELFPSKAGSGSGQLDRLEDAIGSAHLREEDMPKVVSVPVGSTGGGFNIRGAANQTSQSSRGFNIKGSANARELFPGKLGNDNAGKELFDGSRTKQRQKAQDLFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.39
4 0.4
5 0.33
6 0.33
7 0.33
8 0.35
9 0.35
10 0.31
11 0.31
12 0.34
13 0.4
14 0.45
15 0.45
16 0.43
17 0.4
18 0.38
19 0.34
20 0.29
21 0.25
22 0.19
23 0.15
24 0.13
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.06
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.04
34 0.03
35 0.04
36 0.05
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.1
50 0.09
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.1
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.11
73 0.12
74 0.15
75 0.19
76 0.19
77 0.18
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.19
82 0.15
83 0.14
84 0.16
85 0.17
86 0.16
87 0.16
88 0.17
89 0.17
90 0.17
91 0.12
92 0.1
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.16
99 0.17
100 0.21
101 0.22
102 0.2
103 0.24
104 0.24
105 0.26
106 0.24
107 0.24
108 0.2
109 0.18
110 0.17
111 0.14
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.15
160 0.16
161 0.19
162 0.19
163 0.17
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.21
169 0.21
170 0.22
171 0.27
172 0.28
173 0.28
174 0.29
175 0.31
176 0.25
177 0.27
178 0.29
179 0.28
180 0.26
181 0.27
182 0.27
183 0.24
184 0.23
185 0.23
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.23
190 0.24
191 0.27
192 0.29
193 0.3
194 0.38
195 0.42
196 0.5
197 0.53
198 0.59
199 0.64
200 0.72
201 0.76
202 0.75
203 0.79
204 0.81
205 0.84
206 0.83
207 0.78
208 0.72
209 0.65
210 0.66
211 0.61
212 0.6
213 0.54
214 0.52
215 0.48
216 0.5
217 0.55
218 0.54
219 0.59
220 0.57
221 0.58
222 0.58
223 0.61
224 0.59
225 0.53
226 0.47
227 0.37
228 0.32
229 0.28
230 0.24
231 0.19
232 0.14
233 0.1
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.11
243 0.17
244 0.25
245 0.3
246 0.4
247 0.48
248 0.53
249 0.63
250 0.71
251 0.76
252 0.78
253 0.75
254 0.7
255 0.68
256 0.66
257 0.64
258 0.61
259 0.54
260 0.49
261 0.46
262 0.45
263 0.41
264 0.37
265 0.31
266 0.28
267 0.27
268 0.25
269 0.31
270 0.28
271 0.34
272 0.37
273 0.37
274 0.34
275 0.35
276 0.34
277 0.35
278 0.44
279 0.42
280 0.43
281 0.44
282 0.44
283 0.4
284 0.39
285 0.32
286 0.24
287 0.18
288 0.13
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.08
296 0.1
297 0.12
298 0.14
299 0.18
300 0.18
301 0.22
302 0.28
303 0.34
304 0.39
305 0.43
306 0.46
307 0.48
308 0.54
309 0.56
310 0.58
311 0.57
312 0.58
313 0.61
314 0.66
315 0.65
316 0.63
317 0.59
318 0.59
319 0.59
320 0.54
321 0.47
322 0.41
323 0.36
324 0.35
325 0.33
326 0.25
327 0.21
328 0.23
329 0.22
330 0.21
331 0.2
332 0.18
333 0.18
334 0.17
335 0.14
336 0.1
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.12
347 0.14
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.17
352 0.16
353 0.15
354 0.13
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.1
364 0.08
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.15
369 0.16
370 0.17
371 0.2
372 0.22
373 0.22
374 0.23
375 0.25
376 0.24
377 0.23
378 0.28
379 0.27
380 0.26
381 0.28
382 0.3
383 0.34
384 0.36
385 0.38
386 0.34
387 0.34
388 0.33
389 0.33
390 0.32
391 0.27
392 0.25
393 0.25
394 0.22
395 0.27
396 0.28
397 0.28
398 0.31
399 0.31
400 0.32
401 0.29
402 0.28
403 0.22
404 0.24
405 0.19
406 0.18
407 0.21
408 0.23
409 0.33
410 0.4
411 0.47
412 0.51
413 0.6
414 0.66
415 0.73