Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VP40

Protein Details
Accession A0A0A2VP40    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-290EDERKGRHGGREHRSRRHRSRSPMSDERRGGBasic
300-344RGEDERERHRHRDRDRSRERSRDERRRRHRSHSRDRDRHGRQDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-91RPRK
235-340KVRELKQERKKFQDERERELRQLKREDERKGRHGGREHRSRRHRSRSPMSDERRGGSGHGGGSRGRGEDERERHRHRDRDRSRERSRDERRRRHRSHSRDRDRHGR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNKDNIERVRRDEAKAKAAEEAEEQRMQEVDAARRLAILRGEVPPPIEQDEEAAAPDQEAAGGSRPSHSLGTGRRPRKRHGEDDTDFELRIAKERELTVSRAATEAKRTTSSAPIVDRRGHIDLFGTDNKRHAHTEKNEDAEREASRKRREYEDQYTMRFANAGGQPGLDAPWYSADGRKEQQTMAVMKNVWGRDDPQRKERDEKRIVASDPLAMMKQGAAKVRELKQERKKFQDERERELRQLKREDERKGRHGGREHRSRRHRSRSPMSDERRGGSGHGGGSRGRGEDERERHRHRDRDRSRERSRDERRRRHRSHSRDRDRHGRQDDETGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.58
3 0.61
4 0.63
5 0.62
6 0.64
7 0.63
8 0.62
9 0.62
10 0.59
11 0.58
12 0.59
13 0.59
14 0.59
15 0.56
16 0.51
17 0.46
18 0.42
19 0.38
20 0.35
21 0.34
22 0.3
23 0.3
24 0.29
25 0.25
26 0.24
27 0.23
28 0.22
29 0.21
30 0.21
31 0.23
32 0.24
33 0.23
34 0.25
35 0.25
36 0.24
37 0.21
38 0.19
39 0.17
40 0.19
41 0.2
42 0.2
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.21
47 0.19
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.16
70 0.21
71 0.31
72 0.39
73 0.48
74 0.54
75 0.58
76 0.64
77 0.69
78 0.72
79 0.7
80 0.69
81 0.7
82 0.65
83 0.67
84 0.65
85 0.55
86 0.47
87 0.38
88 0.33
89 0.22
90 0.26
91 0.21
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.24
96 0.23
97 0.25
98 0.23
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.21
103 0.18
104 0.21
105 0.21
106 0.2
107 0.2
108 0.21
109 0.22
110 0.25
111 0.26
112 0.23
113 0.25
114 0.27
115 0.28
116 0.3
117 0.28
118 0.28
119 0.28
120 0.25
121 0.21
122 0.18
123 0.15
124 0.17
125 0.21
126 0.2
127 0.18
128 0.22
129 0.23
130 0.24
131 0.26
132 0.24
133 0.28
134 0.31
135 0.39
136 0.4
137 0.43
138 0.42
139 0.4
140 0.39
141 0.33
142 0.29
143 0.23
144 0.24
145 0.26
146 0.3
147 0.35
148 0.36
149 0.4
150 0.45
151 0.5
152 0.53
153 0.56
154 0.53
155 0.49
156 0.49
157 0.43
158 0.36
159 0.28
160 0.2
161 0.16
162 0.14
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.09
176 0.11
177 0.14
178 0.16
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.19
183 0.2
184 0.21
185 0.19
186 0.2
187 0.18
188 0.19
189 0.23
190 0.21
191 0.18
192 0.16
193 0.17
194 0.24
195 0.33
196 0.35
197 0.39
198 0.45
199 0.47
200 0.55
201 0.6
202 0.6
203 0.58
204 0.59
205 0.56
206 0.56
207 0.54
208 0.47
209 0.41
210 0.31
211 0.25
212 0.21
213 0.16
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.14
220 0.14
221 0.17
222 0.24
223 0.28
224 0.36
225 0.39
226 0.47
227 0.54
228 0.63
229 0.66
230 0.68
231 0.73
232 0.71
233 0.75
234 0.77
235 0.71
236 0.69
237 0.73
238 0.67
239 0.63
240 0.65
241 0.61
242 0.57
243 0.59
244 0.56
245 0.57
246 0.6
247 0.65
248 0.67
249 0.68
250 0.66
251 0.69
252 0.68
253 0.65
254 0.67
255 0.68
256 0.68
257 0.71
258 0.74
259 0.75
260 0.81
261 0.84
262 0.86
263 0.87
264 0.86
265 0.85
266 0.87
267 0.86
268 0.86
269 0.85
270 0.82
271 0.81
272 0.75
273 0.66
274 0.58
275 0.49
276 0.4
277 0.33
278 0.29
279 0.22
280 0.21
281 0.21
282 0.18
283 0.21
284 0.21
285 0.19
286 0.18
287 0.17
288 0.21
289 0.29
290 0.37
291 0.45
292 0.52
293 0.58
294 0.65
295 0.73
296 0.77
297 0.76
298 0.8
299 0.8
300 0.82
301 0.86
302 0.87
303 0.87
304 0.88
305 0.86
306 0.86
307 0.87
308 0.87
309 0.88
310 0.89
311 0.9
312 0.91
313 0.91
314 0.91
315 0.91
316 0.91
317 0.91
318 0.92
319 0.92
320 0.91
321 0.92
322 0.92
323 0.89
324 0.89
325 0.85
326 0.8
327 0.71
328 0.72