Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VBC1

Protein Details
Accession A0A0A2VBC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-276VLEAPAPKKKKKKQQQPLRRWVLEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-265APKKKKKKQ
Subcellular Location(s) mito 9.5, cyto_mito 8.833, nucl 8.5, cyto_nucl 8.333, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010378  TRAPPC13  
Pfam View protein in Pfam  
PF06159  DUF974  
Amino Acid Sequences MSHQRYLSHDPIKEPHSVSVKVLRFVLSPQCLAPKSFRLEPSSHLLILTDPLSRIHSLSCPSLVPQYPIEPPFKPSSTTTTAAAAASPLPASLAYHPSSSNPSPFLLSPILNLPVSFGSAYVGETFSCTLCANNDLDDSSSSSSTATTKRQIRDVRVEAEMKTPGQAKAQSLELGPALSSQEYAAGAATDLAPGGTLQKIVSFDLKEEGNHVLAVTVSYYEAAETSGRTRTFRKLYQFICKPSLIVRTKVGVLEAPAPKKKKKKQQQPLRRWVLEAQLENCSDDTMQLDRVVMELEPGLTCRDCNWTAGAGTGSGTGSAGVQKPVLQPGEVEQVCFVIETRRGGNEEEEEDVDVVARARAAGGPDARVVFGVLGIGWRGEMGNRGFLSTGKLGTRVVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.43
4 0.42
5 0.41
6 0.44
7 0.45
8 0.41
9 0.4
10 0.35
11 0.29
12 0.31
13 0.36
14 0.3
15 0.28
16 0.28
17 0.33
18 0.33
19 0.34
20 0.35
21 0.34
22 0.37
23 0.41
24 0.44
25 0.43
26 0.44
27 0.45
28 0.48
29 0.45
30 0.39
31 0.33
32 0.28
33 0.23
34 0.24
35 0.21
36 0.15
37 0.11
38 0.12
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.15
43 0.18
44 0.19
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.2
49 0.26
50 0.25
51 0.24
52 0.23
53 0.24
54 0.28
55 0.31
56 0.34
57 0.28
58 0.31
59 0.35
60 0.34
61 0.33
62 0.3
63 0.34
64 0.35
65 0.36
66 0.33
67 0.29
68 0.29
69 0.26
70 0.23
71 0.17
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.09
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.15
84 0.17
85 0.23
86 0.24
87 0.24
88 0.21
89 0.21
90 0.22
91 0.22
92 0.23
93 0.2
94 0.18
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.16
99 0.16
100 0.14
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.14
133 0.15
134 0.21
135 0.28
136 0.29
137 0.37
138 0.41
139 0.45
140 0.5
141 0.5
142 0.46
143 0.43
144 0.43
145 0.36
146 0.34
147 0.29
148 0.21
149 0.19
150 0.18
151 0.15
152 0.16
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.11
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.07
213 0.11
214 0.11
215 0.13
216 0.16
217 0.22
218 0.27
219 0.32
220 0.37
221 0.4
222 0.43
223 0.52
224 0.55
225 0.52
226 0.51
227 0.46
228 0.4
229 0.35
230 0.41
231 0.34
232 0.31
233 0.28
234 0.26
235 0.27
236 0.26
237 0.24
238 0.15
239 0.13
240 0.18
241 0.2
242 0.23
243 0.28
244 0.32
245 0.39
246 0.48
247 0.56
248 0.6
249 0.66
250 0.73
251 0.79
252 0.86
253 0.91
254 0.92
255 0.94
256 0.93
257 0.83
258 0.73
259 0.65
260 0.6
261 0.54
262 0.45
263 0.36
264 0.31
265 0.3
266 0.28
267 0.26
268 0.2
269 0.15
270 0.12
271 0.12
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.17
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.12
310 0.14
311 0.19
312 0.2
313 0.17
314 0.16
315 0.18
316 0.28
317 0.26
318 0.24
319 0.2
320 0.19
321 0.19
322 0.18
323 0.15
324 0.1
325 0.13
326 0.15
327 0.17
328 0.19
329 0.21
330 0.23
331 0.26
332 0.25
333 0.24
334 0.24
335 0.23
336 0.21
337 0.2
338 0.18
339 0.15
340 0.12
341 0.1
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.08
347 0.1
348 0.14
349 0.15
350 0.17
351 0.19
352 0.2
353 0.2
354 0.18
355 0.17
356 0.12
357 0.1
358 0.09
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.13
368 0.14
369 0.2
370 0.2
371 0.21
372 0.22
373 0.22
374 0.27
375 0.24
376 0.25
377 0.2
378 0.22