Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VFK5

Protein Details
Accession A0A0A2VFK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
468-496AAAAGNKPKAQKKRASKRGGKQTNVHMTHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
465-488RKIAAAAGNKPKAQKKRASKRGGK
Subcellular Location(s) nucl 10.5cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001199  Cyt_B5-like_heme/steroid-bd  
IPR036400  Cyt_B5-like_heme/steroid_sf  
IPR018506  Cyt_B5_heme-BS  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0020037  F:heme binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF00173  Cyt-b5  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00191  CYTOCHROME_B5_1  
PS50255  CYTOCHROME_B5_2  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MSEVKEFSFQDVAEHNTKKDCFLVVHDKVYDCSKFIDEHPGGEEVILDVAGQDASEAFEDVGHSDEARESLDELLVGTLKRQPGDPAPRATPAAKTANNGNADSTGLGIGLYGIVLIGGILGYAGYQTAHAQLMLRLRASLLMVEFQLPTKVSVLLATPYLTTPAFIGCQHRFSSPFIDRLAHRTHKGNHRQQDAAAARGHPPVVAMSSYLEKQSAAFKGTLASAASKLSNPMSVKAAALAPPSPSPSAASDGATPTPTAKRKREAHPEVYSQPQLTGYGVDVKSHMKFAVDFLKARGASKSMKDIIDHLSVRNTSDEHKQQLAEGLRGHPRVEWRPDTSLSEQTWQTGTYSYRAVVPGVTDATSLLAFLQRKTDASSLAVRDLKDGWPDCEDTLARLEAEHKILVTRTNRENFPRHVWLDDASLHHAIQPEFQALWRRVQIPSVDDMHRKLTNASLKPTSEDPRKIAAAAGNKPKAQKKRASKRGGKQTNVHMTHLLQDYSNLRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.36
4 0.37
5 0.36
6 0.35
7 0.31
8 0.25
9 0.3
10 0.39
11 0.37
12 0.41
13 0.42
14 0.41
15 0.4
16 0.44
17 0.37
18 0.28
19 0.27
20 0.23
21 0.23
22 0.24
23 0.33
24 0.28
25 0.28
26 0.29
27 0.28
28 0.26
29 0.23
30 0.21
31 0.11
32 0.11
33 0.09
34 0.06
35 0.04
36 0.05
37 0.05
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.07
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.18
70 0.26
71 0.36
72 0.41
73 0.43
74 0.43
75 0.46
76 0.48
77 0.45
78 0.38
79 0.34
80 0.36
81 0.32
82 0.31
83 0.34
84 0.37
85 0.39
86 0.37
87 0.32
88 0.25
89 0.23
90 0.21
91 0.17
92 0.1
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.03
100 0.02
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.15
121 0.16
122 0.15
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.13
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.16
155 0.15
156 0.19
157 0.2
158 0.21
159 0.22
160 0.23
161 0.29
162 0.26
163 0.27
164 0.25
165 0.27
166 0.26
167 0.29
168 0.34
169 0.31
170 0.31
171 0.33
172 0.39
173 0.47
174 0.57
175 0.6
176 0.61
177 0.61
178 0.6
179 0.54
180 0.57
181 0.48
182 0.4
183 0.33
184 0.26
185 0.23
186 0.23
187 0.23
188 0.13
189 0.12
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.08
217 0.12
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.13
245 0.19
246 0.25
247 0.27
248 0.36
249 0.42
250 0.5
251 0.59
252 0.61
253 0.63
254 0.61
255 0.62
256 0.56
257 0.53
258 0.46
259 0.36
260 0.29
261 0.21
262 0.17
263 0.13
264 0.11
265 0.07
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.17
278 0.17
279 0.17
280 0.17
281 0.23
282 0.22
283 0.23
284 0.21
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.24
289 0.21
290 0.22
291 0.22
292 0.23
293 0.24
294 0.27
295 0.26
296 0.21
297 0.21
298 0.2
299 0.21
300 0.19
301 0.16
302 0.13
303 0.2
304 0.24
305 0.24
306 0.26
307 0.25
308 0.24
309 0.29
310 0.29
311 0.24
312 0.21
313 0.21
314 0.24
315 0.25
316 0.25
317 0.21
318 0.25
319 0.29
320 0.34
321 0.34
322 0.33
323 0.36
324 0.38
325 0.41
326 0.39
327 0.38
328 0.33
329 0.33
330 0.29
331 0.26
332 0.25
333 0.21
334 0.18
335 0.15
336 0.15
337 0.13
338 0.14
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.18
361 0.19
362 0.16
363 0.18
364 0.23
365 0.21
366 0.25
367 0.27
368 0.24
369 0.24
370 0.25
371 0.24
372 0.26
373 0.26
374 0.22
375 0.22
376 0.24
377 0.22
378 0.24
379 0.23
380 0.17
381 0.18
382 0.17
383 0.14
384 0.13
385 0.15
386 0.14
387 0.16
388 0.15
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.2
393 0.23
394 0.26
395 0.32
396 0.37
397 0.42
398 0.47
399 0.52
400 0.52
401 0.55
402 0.56
403 0.5
404 0.46
405 0.43
406 0.38
407 0.35
408 0.32
409 0.27
410 0.23
411 0.23
412 0.21
413 0.21
414 0.23
415 0.21
416 0.2
417 0.2
418 0.18
419 0.17
420 0.19
421 0.26
422 0.24
423 0.29
424 0.31
425 0.32
426 0.3
427 0.34
428 0.34
429 0.29
430 0.32
431 0.31
432 0.32
433 0.33
434 0.34
435 0.36
436 0.35
437 0.33
438 0.3
439 0.32
440 0.37
441 0.38
442 0.42
443 0.42
444 0.41
445 0.44
446 0.48
447 0.49
448 0.49
449 0.5
450 0.47
451 0.47
452 0.48
453 0.45
454 0.42
455 0.38
456 0.38
457 0.41
458 0.47
459 0.46
460 0.48
461 0.54
462 0.61
463 0.65
464 0.66
465 0.67
466 0.69
467 0.75
468 0.83
469 0.87
470 0.89
471 0.9
472 0.92
473 0.92
474 0.88
475 0.84
476 0.84
477 0.84
478 0.77
479 0.69
480 0.6
481 0.51
482 0.51
483 0.47
484 0.37
485 0.27
486 0.27