Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VQX1

Protein Details
Accession A0A0A2VQX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-78DESERWDKRLKKKAAHRDNNAFQDHydrophilic
165-186RAEAQSLKKRRDRQAKNGDDGDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MKEVTRESQRLAEDPSQLTALRRRHDIAAHKLLKAETEDAGEDFERKRAWDWTVDESERWDKRLKKKAAHRDNNAFQDYQAESSKVYKRQLRNLDVDLDAYTKQKLAAIEKAAAAGSLEIVETEDGEMIAVDKDGTFYATADSTSFAQNKPDKAAIDRLVADIERAEAQSLKKRRDRQAKNGDDGDITYINEKNKQFNQKLARFYDKYTSDIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.3
4 0.28
5 0.29
6 0.31
7 0.33
8 0.32
9 0.35
10 0.35
11 0.37
12 0.43
13 0.48
14 0.5
15 0.54
16 0.53
17 0.5
18 0.5
19 0.46
20 0.41
21 0.36
22 0.28
23 0.18
24 0.17
25 0.17
26 0.14
27 0.16
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.15
32 0.14
33 0.14
34 0.16
35 0.18
36 0.2
37 0.24
38 0.27
39 0.31
40 0.36
41 0.36
42 0.34
43 0.35
44 0.41
45 0.36
46 0.35
47 0.35
48 0.37
49 0.45
50 0.56
51 0.58
52 0.59
53 0.68
54 0.77
55 0.82
56 0.84
57 0.82
58 0.81
59 0.81
60 0.78
61 0.7
62 0.59
63 0.47
64 0.41
65 0.34
66 0.27
67 0.21
68 0.15
69 0.13
70 0.18
71 0.23
72 0.24
73 0.29
74 0.33
75 0.36
76 0.45
77 0.52
78 0.52
79 0.51
80 0.49
81 0.46
82 0.39
83 0.36
84 0.27
85 0.2
86 0.16
87 0.12
88 0.1
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.15
98 0.16
99 0.13
100 0.12
101 0.09
102 0.06
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.02
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.1
132 0.12
133 0.11
134 0.18
135 0.21
136 0.22
137 0.25
138 0.26
139 0.25
140 0.26
141 0.32
142 0.28
143 0.27
144 0.26
145 0.23
146 0.22
147 0.21
148 0.18
149 0.12
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.12
156 0.21
157 0.27
158 0.34
159 0.41
160 0.49
161 0.59
162 0.68
163 0.74
164 0.76
165 0.81
166 0.81
167 0.81
168 0.74
169 0.65
170 0.55
171 0.46
172 0.39
173 0.29
174 0.21
175 0.17
176 0.18
177 0.18
178 0.24
179 0.25
180 0.29
181 0.36
182 0.46
183 0.46
184 0.52
185 0.61
186 0.61
187 0.67
188 0.67
189 0.68
190 0.6
191 0.6
192 0.6
193 0.52
194 0.49
195 0.46
196 0.44
197 0.4
198 0.4
199 0.4
200 0.36
201 0.38
202 0.36