Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VTZ9

Protein Details
Accession A0A0A2VTZ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-42ADRVRDEPKHIRDRLNRDHEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
784-792KVKKRGRKA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR031774  SF3A3_dom  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
IPR021966  SF3a60_bindingd  
IPR027520  Slx1  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PF16837  SF3A3  
PF12108  SF3a60_bindingd  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
PS50171  ZF_MATRIN  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MLVLEEQRYIQEDLERLEQAIADRVRDEPKHIRDRLNRDHEVAQLLDQIQSQSKALLAIYKDETGSRAQEIQQIGTGDPFAEFYKEVENIRAHHARYPNEQAENSEQRYRSRRPDETDMPSIVDTIFSGEEAYGRFFDLNSAYDAYLNLPNVKRSNYLQYLEIFDHFTPGQGGLKRADKMTDQYFSYVGGLADYLESFLRRTRPLEDVDKILSSFDDDFDAQWQKDEVEGWQNTAPANGSANNLSSPDAVWCEDCEKEFKNENVYKNHLTGRKHIKAAEQRKARQNESAHNSTGGGVVSATRLKERAIAQREYRVKRLASAMSTERSDTRVNVERKQGMTERERQQELENLFHSTEEQRQPTGDGEDEDDDDDDKIYNPLKLPPGWDGKPIPYWLYRLHGLGVELECEICGNYVYMGRRSFDKHFNEARHLYGLKCLGITNTTLFRDITKIDEALKLWEKIQKTEKKAKVDEGSVVQMEDGEGNVMPEKVYYDLQKQVYVLRSTVRHASLYIGSTPNPPRRLKQHNGETKGGAARTARDKLRPWEMVALVSGFPSSIAALKFEWALANPHLSLHIPADERLAVSTQTKRNGRPRRPALSMRSVMSNIHLLTGVASFVRWPLTLHFFAEEAHKAWKTWLKRAENPARPGLRVLTDFVDDTAGILGPHDDQAGIQALPLDYAPVKDYVQKAQDVVMFEKEGRCVHCDEEMASGQGLHAMCPNGDCVAMGHLDCWSKHALAGEGDPEAILPQTCFCPSCGGEVRWGEMMKELTLRVRGQSEIDKLLKVKKRGRKAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.23
4 0.22
5 0.22
6 0.19
7 0.25
8 0.22
9 0.19
10 0.2
11 0.22
12 0.29
13 0.29
14 0.35
15 0.37
16 0.46
17 0.55
18 0.59
19 0.66
20 0.68
21 0.77
22 0.81
23 0.8
24 0.74
25 0.69
26 0.67
27 0.6
28 0.54
29 0.45
30 0.35
31 0.3
32 0.27
33 0.23
34 0.21
35 0.2
36 0.19
37 0.2
38 0.19
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.17
44 0.15
45 0.18
46 0.21
47 0.21
48 0.21
49 0.21
50 0.22
51 0.2
52 0.22
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.25
57 0.26
58 0.26
59 0.26
60 0.25
61 0.23
62 0.2
63 0.19
64 0.14
65 0.12
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.15
72 0.17
73 0.18
74 0.22
75 0.24
76 0.24
77 0.32
78 0.36
79 0.33
80 0.36
81 0.41
82 0.41
83 0.45
84 0.52
85 0.5
86 0.5
87 0.49
88 0.48
89 0.5
90 0.53
91 0.5
92 0.48
93 0.44
94 0.46
95 0.53
96 0.55
97 0.57
98 0.58
99 0.61
100 0.63
101 0.7
102 0.71
103 0.71
104 0.7
105 0.61
106 0.53
107 0.46
108 0.39
109 0.29
110 0.21
111 0.14
112 0.1
113 0.09
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.11
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.19
136 0.19
137 0.24
138 0.26
139 0.28
140 0.28
141 0.29
142 0.37
143 0.37
144 0.37
145 0.35
146 0.34
147 0.36
148 0.34
149 0.32
150 0.26
151 0.2
152 0.21
153 0.18
154 0.17
155 0.14
156 0.13
157 0.17
158 0.16
159 0.18
160 0.19
161 0.24
162 0.25
163 0.25
164 0.26
165 0.24
166 0.27
167 0.3
168 0.29
169 0.25
170 0.25
171 0.24
172 0.23
173 0.21
174 0.17
175 0.12
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.1
186 0.13
187 0.15
188 0.17
189 0.2
190 0.24
191 0.29
192 0.35
193 0.34
194 0.34
195 0.33
196 0.32
197 0.29
198 0.25
199 0.19
200 0.15
201 0.13
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.14
207 0.17
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.17
216 0.17
217 0.19
218 0.19
219 0.2
220 0.19
221 0.19
222 0.18
223 0.1
224 0.12
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.15
243 0.15
244 0.19
245 0.24
246 0.24
247 0.32
248 0.37
249 0.41
250 0.43
251 0.47
252 0.44
253 0.42
254 0.47
255 0.42
256 0.39
257 0.42
258 0.47
259 0.47
260 0.47
261 0.46
262 0.48
263 0.53
264 0.6
265 0.61
266 0.59
267 0.6
268 0.66
269 0.7
270 0.64
271 0.6
272 0.55
273 0.54
274 0.53
275 0.51
276 0.43
277 0.38
278 0.36
279 0.3
280 0.27
281 0.18
282 0.11
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.13
292 0.16
293 0.24
294 0.28
295 0.33
296 0.34
297 0.42
298 0.5
299 0.49
300 0.49
301 0.45
302 0.39
303 0.37
304 0.39
305 0.32
306 0.25
307 0.26
308 0.24
309 0.22
310 0.23
311 0.21
312 0.18
313 0.19
314 0.18
315 0.15
316 0.18
317 0.24
318 0.27
319 0.3
320 0.35
321 0.36
322 0.35
323 0.38
324 0.36
325 0.33
326 0.35
327 0.4
328 0.41
329 0.43
330 0.43
331 0.4
332 0.38
333 0.38
334 0.35
335 0.29
336 0.23
337 0.2
338 0.19
339 0.18
340 0.17
341 0.13
342 0.17
343 0.18
344 0.19
345 0.18
346 0.18
347 0.19
348 0.19
349 0.19
350 0.13
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.11
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.18
371 0.23
372 0.23
373 0.25
374 0.24
375 0.23
376 0.24
377 0.23
378 0.21
379 0.17
380 0.18
381 0.16
382 0.18
383 0.17
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.03
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.06
401 0.08
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.18
407 0.21
408 0.27
409 0.3
410 0.33
411 0.38
412 0.4
413 0.43
414 0.41
415 0.38
416 0.33
417 0.3
418 0.23
419 0.21
420 0.2
421 0.14
422 0.13
423 0.12
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.09
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.11
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.13
441 0.16
442 0.18
443 0.16
444 0.17
445 0.2
446 0.19
447 0.22
448 0.31
449 0.34
450 0.39
451 0.48
452 0.53
453 0.56
454 0.58
455 0.59
456 0.53
457 0.47
458 0.43
459 0.34
460 0.3
461 0.23
462 0.21
463 0.15
464 0.11
465 0.1
466 0.07
467 0.05
468 0.04
469 0.03
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.06
477 0.08
478 0.1
479 0.13
480 0.19
481 0.2
482 0.21
483 0.2
484 0.22
485 0.25
486 0.24
487 0.22
488 0.19
489 0.19
490 0.21
491 0.24
492 0.22
493 0.18
494 0.17
495 0.19
496 0.17
497 0.18
498 0.18
499 0.15
500 0.15
501 0.19
502 0.25
503 0.3
504 0.34
505 0.35
506 0.37
507 0.44
508 0.53
509 0.55
510 0.59
511 0.62
512 0.66
513 0.69
514 0.68
515 0.6
516 0.53
517 0.48
518 0.38
519 0.3
520 0.21
521 0.19
522 0.21
523 0.26
524 0.26
525 0.27
526 0.32
527 0.35
528 0.42
529 0.41
530 0.37
531 0.37
532 0.35
533 0.31
534 0.28
535 0.24
536 0.16
537 0.14
538 0.12
539 0.07
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.07
545 0.08
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.08
552 0.11
553 0.1
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.13
560 0.11
561 0.14
562 0.13
563 0.13
564 0.15
565 0.14
566 0.14
567 0.13
568 0.13
569 0.1
570 0.13
571 0.19
572 0.22
573 0.3
574 0.34
575 0.41
576 0.5
577 0.6
578 0.66
579 0.7
580 0.74
581 0.74
582 0.77
583 0.77
584 0.74
585 0.73
586 0.67
587 0.58
588 0.52
589 0.45
590 0.38
591 0.32
592 0.28
593 0.19
594 0.16
595 0.14
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.09
600 0.06
601 0.06
602 0.05
603 0.06
604 0.07
605 0.07
606 0.08
607 0.11
608 0.17
609 0.19
610 0.19
611 0.2
612 0.18
613 0.19
614 0.22
615 0.2
616 0.16
617 0.19
618 0.19
619 0.18
620 0.22
621 0.29
622 0.29
623 0.36
624 0.44
625 0.47
626 0.54
627 0.64
628 0.7
629 0.72
630 0.73
631 0.73
632 0.67
633 0.6
634 0.54
635 0.46
636 0.39
637 0.32
638 0.29
639 0.22
640 0.21
641 0.2
642 0.18
643 0.17
644 0.13
645 0.12
646 0.1
647 0.08
648 0.06
649 0.06
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.06
655 0.06
656 0.08
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.1
661 0.1
662 0.1
663 0.1
664 0.1
665 0.08
666 0.09
667 0.11
668 0.11
669 0.12
670 0.16
671 0.19
672 0.24
673 0.27
674 0.28
675 0.27
676 0.28
677 0.3
678 0.29
679 0.28
680 0.25
681 0.23
682 0.22
683 0.24
684 0.23
685 0.23
686 0.22
687 0.22
688 0.21
689 0.22
690 0.24
691 0.24
692 0.22
693 0.24
694 0.23
695 0.22
696 0.2
697 0.18
698 0.14
699 0.17
700 0.16
701 0.11
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.13
706 0.15
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.09
711 0.1
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.12
716 0.15
717 0.15
718 0.17
719 0.18
720 0.16
721 0.18
722 0.2
723 0.2
724 0.19
725 0.21
726 0.2
727 0.17
728 0.17
729 0.15
730 0.13
731 0.11
732 0.1
733 0.08
734 0.07
735 0.08
736 0.11
737 0.13
738 0.14
739 0.15
740 0.2
741 0.2
742 0.28
743 0.34
744 0.33
745 0.38
746 0.39
747 0.41
748 0.39
749 0.39
750 0.31
751 0.28
752 0.28
753 0.22
754 0.23
755 0.21
756 0.21
757 0.26
758 0.26
759 0.26
760 0.26
761 0.26
762 0.28
763 0.34
764 0.34
765 0.37
766 0.38
767 0.38
768 0.38
769 0.46
770 0.5
771 0.53
772 0.57
773 0.59