Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VW79

Protein Details
Accession A0A0A2VW79    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-92RDRGDRRDRGDDRRDRHRDRRRSRSPDHRQRRDRDRDGDAYBasic
162-181RQQERRSPSPPKRREPTPDLBasic
689-714IKKAVAVRKHLERNRKDKDSKFRLILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-88RGERGDRGDRDRGDRRDRGDDRRDRHRDRRRSRSPDHRQRRDRDRD
96-175RNHRDREREERYTGGRDRRGDREWDRDRGSSRRDARRDDDGHGRRDRDGFDENRRGGRDRRDDGFARQQERRSPSPPKRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR012606  Ribosomal_S13/S15_N  
IPR000589  Ribosomal_S15  
IPR023029  Ribosomal_S15P  
IPR000504  RRM_dom  
IPR009068  S15_NS1_RNA-bd  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08069  Ribosomal_S13_N  
PF00312  Ribosomal_S15  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00362  RIBOSOMAL_S15  
PS50102  RRM  
CDD cd00353  Ribosomal_S15p_S13e  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MNGDNYSSRGESTASWCNRPNADKMLATEGDSRRDHQPSRSDRGERGDRGDRDRGDRRDRGDDRRDRHRDRRRSRSPDHRQRRDRDRDGDAYASSRNHRDREREERYTGGRDRRGDREWDRDRGSSRRDARRDDDGHGRRDRDGFDENRRGGRDRRDDGFARQQERRSPSPPKRREPTPDLTDVIPVLERKRRMTQWDIKPPGYEAVTSEQAKMSGMFPLPGAPRQQQMDPTKLQAFMNQPAGGQVSSAGLKASNSRQAKRLLVSNLPSGTTDDALVAFFNLQLNGLNVISATDPCALSQLSNDKSFAVLEFKNTSDATVALALDGISMEANGPGLSIRRPKDYVMPAVPDDIMYNPDVVSDSVPDTIHKLSITNLPPFLTEEQVLELLAAFGKPKAFVLVKDRTTEESRGIAFAEYAEPGSANEAALKALSGMDVGGKPLKITKACIGGTQVANFDAGINAISNLAGQGNGGEATRVLQLLNMVTAEELLDNDDYEEICDDVRDECSKYGKILDLKVPRPAGGSRQSAGVGRIFVKFESVDATTSALKALAGRKFADRTVVTTYFPEENFDVSACPGKLHHDSSNLNARQPTTTDNMGRLHSNGKGISASALPYSRVAPSWLKTTPEQVVEQICKLARKGATPSQIGVILRDSHGVSQVKLVTGNRILRILKSSGLAPELPEDLYMLIKKAVAVRKHLERNRKDKDSKFRLILIESRIHRLARYYKTVGVLPPTWKYESATASTIVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.36
3 0.4
4 0.44
5 0.49
6 0.5
7 0.5
8 0.47
9 0.48
10 0.46
11 0.44
12 0.46
13 0.4
14 0.39
15 0.42
16 0.37
17 0.39
18 0.38
19 0.39
20 0.39
21 0.45
22 0.46
23 0.45
24 0.52
25 0.53
26 0.61
27 0.66
28 0.64
29 0.61
30 0.67
31 0.69
32 0.63
33 0.62
34 0.63
35 0.59
36 0.61
37 0.65
38 0.6
39 0.59
40 0.64
41 0.65
42 0.65
43 0.66
44 0.65
45 0.67
46 0.7
47 0.71
48 0.73
49 0.73
50 0.71
51 0.76
52 0.8
53 0.79
54 0.83
55 0.84
56 0.85
57 0.86
58 0.91
59 0.91
60 0.9
61 0.91
62 0.92
63 0.92
64 0.92
65 0.93
66 0.93
67 0.92
68 0.92
69 0.93
70 0.92
71 0.9
72 0.86
73 0.82
74 0.76
75 0.7
76 0.63
77 0.53
78 0.44
79 0.39
80 0.35
81 0.31
82 0.34
83 0.36
84 0.4
85 0.44
86 0.51
87 0.56
88 0.63
89 0.68
90 0.67
91 0.64
92 0.64
93 0.62
94 0.61
95 0.61
96 0.59
97 0.56
98 0.55
99 0.58
100 0.59
101 0.58
102 0.59
103 0.57
104 0.59
105 0.59
106 0.61
107 0.6
108 0.58
109 0.59
110 0.57
111 0.57
112 0.56
113 0.58
114 0.61
115 0.63
116 0.65
117 0.65
118 0.67
119 0.65
120 0.6
121 0.62
122 0.58
123 0.6
124 0.59
125 0.56
126 0.49
127 0.48
128 0.45
129 0.39
130 0.4
131 0.38
132 0.42
133 0.49
134 0.48
135 0.5
136 0.51
137 0.5
138 0.49
139 0.53
140 0.53
141 0.49
142 0.5
143 0.52
144 0.52
145 0.55
146 0.59
147 0.56
148 0.52
149 0.52
150 0.52
151 0.54
152 0.57
153 0.56
154 0.52
155 0.57
156 0.62
157 0.68
158 0.73
159 0.75
160 0.76
161 0.78
162 0.8
163 0.78
164 0.76
165 0.71
166 0.66
167 0.58
168 0.52
169 0.45
170 0.36
171 0.29
172 0.21
173 0.16
174 0.16
175 0.2
176 0.22
177 0.26
178 0.33
179 0.36
180 0.41
181 0.49
182 0.55
183 0.6
184 0.68
185 0.69
186 0.63
187 0.6
188 0.55
189 0.48
190 0.39
191 0.29
192 0.2
193 0.19
194 0.23
195 0.23
196 0.23
197 0.2
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.14
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.2
210 0.18
211 0.21
212 0.23
213 0.25
214 0.29
215 0.32
216 0.35
217 0.33
218 0.36
219 0.34
220 0.34
221 0.32
222 0.28
223 0.28
224 0.26
225 0.29
226 0.25
227 0.23
228 0.21
229 0.22
230 0.18
231 0.14
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.1
240 0.12
241 0.2
242 0.24
243 0.26
244 0.3
245 0.34
246 0.36
247 0.35
248 0.38
249 0.33
250 0.33
251 0.34
252 0.33
253 0.3
254 0.27
255 0.26
256 0.21
257 0.18
258 0.14
259 0.12
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.09
287 0.14
288 0.16
289 0.17
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.13
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.11
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.02
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.06
324 0.12
325 0.14
326 0.17
327 0.18
328 0.19
329 0.26
330 0.28
331 0.31
332 0.28
333 0.28
334 0.25
335 0.25
336 0.24
337 0.17
338 0.14
339 0.1
340 0.09
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.15
360 0.17
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.18
366 0.18
367 0.12
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.07
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.03
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.07
384 0.08
385 0.1
386 0.16
387 0.22
388 0.24
389 0.25
390 0.27
391 0.27
392 0.3
393 0.29
394 0.24
395 0.2
396 0.18
397 0.17
398 0.16
399 0.12
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.09
428 0.12
429 0.12
430 0.14
431 0.16
432 0.21
433 0.22
434 0.23
435 0.23
436 0.23
437 0.24
438 0.22
439 0.19
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.1
444 0.06
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.04
476 0.04
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.08
491 0.1
492 0.11
493 0.12
494 0.16
495 0.17
496 0.17
497 0.18
498 0.2
499 0.22
500 0.24
501 0.3
502 0.34
503 0.35
504 0.4
505 0.39
506 0.35
507 0.34
508 0.32
509 0.3
510 0.3
511 0.31
512 0.26
513 0.27
514 0.27
515 0.26
516 0.26
517 0.21
518 0.16
519 0.14
520 0.15
521 0.14
522 0.13
523 0.14
524 0.12
525 0.11
526 0.12
527 0.12
528 0.11
529 0.11
530 0.13
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.08
535 0.08
536 0.1
537 0.15
538 0.16
539 0.18
540 0.19
541 0.22
542 0.24
543 0.25
544 0.28
545 0.23
546 0.24
547 0.28
548 0.29
549 0.26
550 0.25
551 0.28
552 0.24
553 0.24
554 0.23
555 0.17
556 0.16
557 0.16
558 0.16
559 0.13
560 0.11
561 0.16
562 0.13
563 0.13
564 0.12
565 0.16
566 0.2
567 0.24
568 0.26
569 0.29
570 0.3
571 0.35
572 0.45
573 0.42
574 0.4
575 0.38
576 0.36
577 0.31
578 0.3
579 0.29
580 0.23
581 0.27
582 0.26
583 0.28
584 0.29
585 0.29
586 0.29
587 0.27
588 0.25
589 0.22
590 0.24
591 0.2
592 0.19
593 0.18
594 0.17
595 0.17
596 0.14
597 0.13
598 0.12
599 0.13
600 0.13
601 0.13
602 0.14
603 0.14
604 0.14
605 0.17
606 0.18
607 0.2
608 0.25
609 0.26
610 0.28
611 0.29
612 0.33
613 0.34
614 0.33
615 0.32
616 0.29
617 0.33
618 0.32
619 0.31
620 0.3
621 0.27
622 0.26
623 0.26
624 0.28
625 0.24
626 0.26
627 0.32
628 0.36
629 0.41
630 0.41
631 0.41
632 0.37
633 0.39
634 0.35
635 0.3
636 0.25
637 0.2
638 0.18
639 0.19
640 0.18
641 0.15
642 0.22
643 0.22
644 0.19
645 0.22
646 0.23
647 0.22
648 0.25
649 0.25
650 0.23
651 0.29
652 0.33
653 0.29
654 0.33
655 0.33
656 0.31
657 0.35
658 0.31
659 0.26
660 0.24
661 0.24
662 0.21
663 0.23
664 0.22
665 0.18
666 0.19
667 0.18
668 0.17
669 0.15
670 0.13
671 0.11
672 0.13
673 0.13
674 0.12
675 0.11
676 0.11
677 0.13
678 0.19
679 0.26
680 0.27
681 0.33
682 0.39
683 0.48
684 0.59
685 0.64
686 0.68
687 0.71
688 0.78
689 0.81
690 0.84
691 0.83
692 0.82
693 0.86
694 0.85
695 0.84
696 0.78
697 0.73
698 0.67
699 0.62
700 0.59
701 0.53
702 0.51
703 0.45
704 0.46
705 0.45
706 0.41
707 0.38
708 0.39
709 0.43
710 0.42
711 0.47
712 0.46
713 0.46
714 0.49
715 0.51
716 0.47
717 0.45
718 0.42
719 0.39
720 0.4
721 0.4
722 0.4
723 0.38
724 0.38
725 0.37
726 0.37
727 0.36
728 0.33