Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2VND3

Protein Details
Accession A0A0A2VND3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-66IPDKPVPKAPSKKRSQAVQVKKEPTRPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-53KPVPKAPSKKRS
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11.5, nucl 9, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:2000001  P:regulation of DNA damage checkpoint  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MPVKKEPAEMSAFERRRLENIAANKALLTDISATAKKVIPDKPVPKAPSKKRSQAVQVKKEPTRPTRMSSRLAGIEADNDTLKRKLEVENEFEAAKSRAKKMRIGDDLNIGDIVVDGKKYGGSVAGITGIFRGAEPGVRTFSEDDIKETTDAGLKDLRLRLNSLKLYEHWAPNDIKITPQRVYALGFHPIEDKPIIFAGDKEGAMGVFDGSQTVPEADDDDEIDIPDPVISAFKTHTRTITSFVFSHTDANAVYSSSYDSSIRKMDLEKGISTQVFAPADADDDLPITALDVAATEPNILYFSTLDGSVGRYDIRAPKSEEIWTLSESKIGGFSLHPLQPHLLATASLDRTVKIWDLRKITGKGDLRHPALLGEHPSRLSVSHASWSAGGQLATSSYDDTIKIYNFAEAGKWSPGQDIAESDLEPAHIIRHNNQTGRWVTILKPQWQQRPKDGHQKFAIGNMNRFVDIFASDGSQLAQLGGDGITAVPAVAHCHPSMDWVAGGSGSGKLCLWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.42
3 0.41
4 0.44
5 0.42
6 0.39
7 0.44
8 0.48
9 0.45
10 0.43
11 0.39
12 0.35
13 0.31
14 0.23
15 0.17
16 0.11
17 0.11
18 0.16
19 0.17
20 0.17
21 0.2
22 0.23
23 0.24
24 0.28
25 0.31
26 0.34
27 0.44
28 0.5
29 0.55
30 0.62
31 0.64
32 0.68
33 0.73
34 0.76
35 0.76
36 0.78
37 0.79
38 0.77
39 0.8
40 0.81
41 0.81
42 0.82
43 0.82
44 0.82
45 0.81
46 0.8
47 0.8
48 0.78
49 0.75
50 0.74
51 0.68
52 0.65
53 0.66
54 0.66
55 0.64
56 0.58
57 0.56
58 0.48
59 0.45
60 0.4
61 0.3
62 0.27
63 0.23
64 0.21
65 0.16
66 0.14
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.17
72 0.21
73 0.28
74 0.33
75 0.36
76 0.38
77 0.38
78 0.37
79 0.35
80 0.32
81 0.26
82 0.25
83 0.23
84 0.27
85 0.32
86 0.35
87 0.41
88 0.45
89 0.53
90 0.56
91 0.56
92 0.52
93 0.53
94 0.5
95 0.45
96 0.38
97 0.28
98 0.2
99 0.15
100 0.14
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.06
121 0.08
122 0.1
123 0.11
124 0.13
125 0.13
126 0.16
127 0.16
128 0.18
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.2
133 0.21
134 0.19
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.15
141 0.14
142 0.18
143 0.21
144 0.23
145 0.2
146 0.23
147 0.25
148 0.29
149 0.31
150 0.29
151 0.28
152 0.26
153 0.31
154 0.32
155 0.32
156 0.26
157 0.28
158 0.27
159 0.27
160 0.29
161 0.23
162 0.22
163 0.24
164 0.27
165 0.23
166 0.24
167 0.24
168 0.22
169 0.23
170 0.22
171 0.2
172 0.22
173 0.21
174 0.19
175 0.21
176 0.2
177 0.2
178 0.17
179 0.15
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.1
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.19
225 0.2
226 0.23
227 0.24
228 0.23
229 0.19
230 0.2
231 0.2
232 0.17
233 0.18
234 0.14
235 0.12
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.15
253 0.18
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.2
258 0.19
259 0.18
260 0.14
261 0.13
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.09
300 0.15
301 0.17
302 0.19
303 0.23
304 0.24
305 0.26
306 0.28
307 0.27
308 0.24
309 0.23
310 0.21
311 0.2
312 0.18
313 0.17
314 0.16
315 0.14
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.07
320 0.1
321 0.13
322 0.15
323 0.15
324 0.15
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.14
329 0.1
330 0.08
331 0.09
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.15
339 0.16
340 0.17
341 0.21
342 0.25
343 0.29
344 0.33
345 0.39
346 0.4
347 0.39
348 0.42
349 0.43
350 0.4
351 0.44
352 0.47
353 0.42
354 0.41
355 0.4
356 0.32
357 0.27
358 0.27
359 0.24
360 0.2
361 0.19
362 0.18
363 0.19
364 0.18
365 0.17
366 0.18
367 0.15
368 0.14
369 0.17
370 0.18
371 0.18
372 0.18
373 0.18
374 0.16
375 0.15
376 0.13
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.07
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.11
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.17
402 0.17
403 0.16
404 0.15
405 0.16
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.14
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.1
414 0.12
415 0.14
416 0.19
417 0.29
418 0.35
419 0.37
420 0.38
421 0.42
422 0.41
423 0.42
424 0.39
425 0.31
426 0.27
427 0.33
428 0.39
429 0.39
430 0.45
431 0.49
432 0.57
433 0.63
434 0.67
435 0.67
436 0.71
437 0.71
438 0.75
439 0.7
440 0.69
441 0.65
442 0.65
443 0.56
444 0.54
445 0.56
446 0.49
447 0.49
448 0.45
449 0.42
450 0.36
451 0.36
452 0.28
453 0.2
454 0.17
455 0.15
456 0.11
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.06
466 0.07
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.08
477 0.11
478 0.14
479 0.14
480 0.16
481 0.16
482 0.2
483 0.21
484 0.19
485 0.17
486 0.15
487 0.15
488 0.13
489 0.13
490 0.1
491 0.12
492 0.11
493 0.11